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2016年我国3株欧洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定及其全基因组特征分析被引量：12: 2017年; 2016年,本实验室共检测到3株基因1型(欧洲型)猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV),分别命名为ZD1株、WK14株和WG9株,本研究对3株PRRSV进行了全基因组序列分析。遗传演化分析显示,3株PRRSV均属于基因1型I亚型,与基因1型代表株LV的核苷酸同源性为88.7%~88.9%,与基因2型代表株VR2332的核苷酸同源性为60.7%~60.8%。ORF3与ORF4推导氨基酸序列比对结果显示,ZD1株的ORF3提前26个氨基酸(aa)终止,这是首次报道基因1型PRRSV编码的结构蛋白存在提前终止现象,WK14株与WG9株在ORF3的245位存在1个氨基酸的缺失;3株PRRSV在ORF4的66位皆存在1个氨基酸的缺失。Simplot生物学重组软件分析表明,WK14株为重组病毒,供体病毒株为BJEU06-1,提供重组片段的病毒株为NVDC-FJ,重组位置位于第931~3 379位碱基处。ZD1株和WG9株未发现重组现象。本研究发现我国欧洲型PRRSV基因组在缺失、重组等方面正发生一些新的变化,有必要对该类病毒进行持续监测和深入研究。; 张洪亮张晶张文立相丽润宋帅杰刘春晓李真彭金美陈家锃冷超粮王倩白云安同庆童光志蔡雪辉田志军; 关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒

2016年我国部分地区猪伪狂犬病毒gE和gC基因的分子流行病学分析: <正>伪狂犬病(Pseudoraies)是由伪狂犬病病毒(PRV)引起的猪、牛、羊等多种家畜及野生动物的一种以发热、奇痒(除猪外)、脑脊髓炎为主要症状的急性传染病。猪伪狂犬病可引起母猪繁殖障碍、仔猪死亡并破坏猪的免疫系统...; 刘春晓彭金美李真张晶王倩张洪亮蔡雪辉田志军; 关键词：猪伪狂犬病毒 GE基因 GC基因分子流行病学; 文献传递

高致病性猪繁殖与呼吸综合征活疫苗(HuN4-F112株)对类NADC30 PRRSV免疫保护效果的评价被引量：5: 2021年; 类NADC30猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)已成为我国PRRSV的主要流行株,为了评价当前商品化疫苗对类NADC30 PRRSV的免疫保护效果,本研究将12头6周龄仔猪随机分为3组,免疫组和攻毒对照组各5头、空白对照组2头,免疫组肌注高致病性猪繁殖与呼吸综合征活疫苗(HuN4-F112株)10^(5.0)TCID_(50)/头,免疫后21 d,免疫组和攻毒对照组每头各肌注2 mL和滴鼻2 mL类NADC30 PRRSV SD53-1603株(104.0TCID_(50)/mL)。攻毒后观察各组实验猪临床症状,可见攻毒对照组所有猪均发热,持续5 d9 d,免疫组仅2头猪发热1 d2 d。检测各组实验猪体重变化,结果显示,攻毒后免疫组和攻毒对照组体重增长均显著低于空白对照组(p<0.001),但攻毒14 d以后,免疫组体重增长显著高于攻毒对照组(p<0.05)。IDEXX ELISA测定各组猪血清中PRRSV的特异性抗体,结果显示免疫后14 d可以诱导免疫组仔猪产生良好的针对PRRSV的特异性抗体。利用荧光定量PCR测定血清和组织中的病毒载量,结果显示免疫组血清和组织中的病毒载量均极显著低于对照组(p<0.0001)。对PRRSV免疫后及攻毒后各组仔猪各脏器病理学观察,结果可见攻毒对照组与免疫组相比出现明显的剖检和组织病理学变化。以上结果表明,高致病性猪繁殖与呼吸综合征活疫苗(HuN4-F112株)对类NADC30 PRRSV可以提供一定的交叉保护,该研究为评价我国现有疫苗是否对类NADC30 PRRSV具有保护效果提供了参考依据。; 张洪亮相丽润许浒宋帅杰赵静张文立李真汤艳东陈家锃冷超粮王倩彭金美安同庆童光志蔡雪辉田志军; 关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒

2016年～2017年我国华北地区某规模化猪场经典美洲型猪繁殖与呼吸综合征病毒的分离鉴定及全基因组序列分析被引量：5: 2017年; 为了解近期我国华北地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)的流行及变异情况,本研究对该地区某猪场采集33份2016年~2017年疑似患PRRS猪病料样品进行PCR检测,对阳性样品进行病毒分离,并从分离株中选择两株病毒(SD158和SD192)进行全基因的序列扩增及分析。结果显示,检测到13份PRRSV阳性病料样品,病原为经典美洲型PRRSV,但仅分离到11株病毒(4株感染MARC-145细胞,另外7株感染PAM细胞)。SD158和SD192株与Resp PRRS MLV株(疫苗株)的核苷酸同源性最高,分别为99.7%和99.4%。对这两株PRRSV与VR-2332、Resp PRRS MLV的各基因的推导氨基酸序列进行分析,结果显示在VR-2332与Resp PRRS MLV株22处差异氨基酸中,SD158株有15处、SD192株有14处氨基酸和Resp PRRS MLV株相同,但二者仅各有6处及7处氨基酸与VR-2332株一致,在鉴别PRRSV VR-2332株与Resp PRRS MLV株的7处可能与毒力相关的氨基酸位点时发现,SD158与SD192株各有5处基酸与VR-2332株相同。根据以上结果推测SD158与SD192株可能来源于PRRSV Resp PRRS MLV株,具有上述分子变化特征的PRRSV在我国的流行状况值得关注。; 刘春晓张洪亮张文立相丽润李真冷超粮陈家锃彭金美王倩安同庆童光志蔡雪辉田志军; 关键词：病毒分离鉴定流行病学

两株2.1d新基因亚型猪瘟病毒的全基因组序列分析及其基因亚型分子特征被引量：2: 2016年; 为研究猪瘟病毒(CSFV)2.1d新基因亚型的基因组特征,本研究根据Gen Bank中登录的Zj0801株CSFV全基因组序列设计合成6对引物,通过RT-PCR方法对2014年分离自山东的两株2.1d亚型CSFV(SDSG1410和SDLS1410)进行全基因组测序,两株CSFV全长均为12 296 nt。全基因组遗传演化分析表明这两个分离株位于一个独立分支中,属于2.1d亚型,与E2基因分型结果一致。核苷酸和推导氨基酸同源性分析显示,分离株全基因组同源性与参考株相比差异较大,与Zj0801株的全基因组同源性最高为97.3%~97.5%,而与1.1亚型的Shimen和HCLV株的同源性仅为85.0%~85.1%和84.3%~84.4%;部分基因和非翻译区变异较大,如N^(pro)、C、E2、NS2、NS5A和3'UTR。对全基因组氨基酸序列分析,结果显示2.1d亚型CSFV在V^(640)、K^(992)、A^(1020)、M^(1090)、R^(1395)和D^(2374) 6处氨基酸上具有共同的分子特征。以上研究结果增加了CSFV 2.1d新基因亚型的分型依据。; 冯丽苹张洪亮彭金美刘春晓王倩李真吴桐翁长江蔡雪辉田志军熊涛; 关键词：猪瘟病毒分子特征

2015年我国部分地区2.1d新基因亚型猪瘟病毒的分子流行病学分析被引量：10: 2015年; 为了解猪瘟病毒（CSFV）在我国的流行情况，本研究对2015上半年来自4个省疑似猪瘟（csF）病料样品采用RT．PCR方法进行检测，28份样品中14份为CSFV阳性，并对这些阳性样品进行CSFVE2基因遗传进化分析。结果表明，14个病毒株中11个属于2．1d新基因亚型，它们与CSFV代表株Shimen、HCLV和2．1b基因亚型病毒株的核苷酸同源性分别为82．8％～84．1％、81．1％～82．4％和92．6％～97．1％，氨基酸同源性分别为89．8％～91．2％、88．2％～89．8％和94．1％～98．9％，其余3个病毒株属于2．1b亚型。这些2．1d亚型新分离株在E2基因的4个氨基酸（R31、S34、K303和A331）上具有相同的分子特征。本研究结果与我们2014年CSFV流行病学研究结果一致，表明2．1d亚型病毒株已成为我国现阶段CSFV的主要流行株。; 冯丽苹张洪亮刘春晓冷超粮陈家锃李真彭金美王倩白云张武超安同庆蔡雪辉童光志田志军; 关键词：猪瘟病毒流行病学

2014-2016年我国山东某规模化猪场猪繁殖与呼吸综合征病毒的遗传演化分析: <正>猪繁殖与呼吸综合征(PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)引起的重要的病毒性传染病之一,对我国乃至世界各地的养猪业造成了巨大的经济损失。为研究近年来我国规模化猪场区域内的PRRSV遗传和演化情况,本研究...; 李真张洪亮刘春晓张文立张晶彭金美王倩安同庆蔡雪辉田志军; 关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒基因组序列; 文献传递

2014年~2019年PRRSV主要流行毒株在我国的变化被引量：42: 2020年; 为了研究2014年至2019年PRRSV在我国的流行变化情况,本研究分别检测了2014年6月~2019年8月全国17个省、市和自治区及某大型养猪集团2007份和338份疑似PRRSV感染的病料。结果显示,共检出PRRSV阳性病料650份,测定了486株ORF5基因、441株nsp2基因和122株全基因组序列。遗传演化分析显示,2014年~2019年共检测到6种基因亚型的PRRSV,分别是I型PRRSV、HP-PRRSV、NADC30-like PRRSV、NADC34-like PRRSV、QYYZ-like PRRSV和RespPRRS MLV-like PRRSV。经统计分析显示,2016年以前除检测到1株NADC30-like PRRSV外,其余全部是HP-PRRSV;2016年后HP-PRRSV检出比率逐渐降低,NADC30-like PRRSV检出比率逐渐升高,且2016年后已超过HP-PRRSV,成为我国主要的流行株。QYYZ-like PRRSV的检出数量增多,其广泛流行于我国的华南地区。其它类型的PRRSV检出比率较低,呈现散发或局部流行。此外,近年来,PRRSV的细胞嗜性已经发生明显变化,绝大多数的病毒株无法在体外分离培养。因此,我国养殖企业针对PRRSV流行株的变化应及时调整防控策略,同时加大对PRRSV生物学特性变化机制的研究。本研究对了解我国PRRSV的流行状况及防控具有重要的指导意义。; 张洪亮张文立许浒宋帅杰赵静相丽润冷超粮李真刘春晓汤艳东陈家锃彭金美王倩安同庆童光志蔡雪辉田志军; 关键词：PRRSV 细胞嗜性

2016年我国部分地区类NADC30新亚群猪繁殖与呼吸综合征病毒的遗传变异分析被引量：32: 2016年; 为了解类NADC30猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）在我国新的流行特点，本研究根据GenBank中美国2012年提交的PRRSV NADC30株全基因组序列设计合成8对引物，通过RT-PCR的方法对本实验室2016年从4个省搜集的临床样品中检测到的15株类NADC30 PRRSVs株进行了全基因组测序，并且结合参考株进行了序列分析。NSP2推导氨基酸的序列比对表明，15株PRRSVs均具有aa323～aa433＋aa484＋aa505～aa523 （111＋1＋19） 131个氨基酸缺失的分子特征；经RDP4和Simplot生物学软件分析表明，15株PRRSVs中14株为重组病毒株，参与重组的亲本病毒株为PRRSV NADC30株，提供重组基因片段的病毒株为HP-PRRSV或以VR2332为代表的经典PRRSV株，这些类NADC30重组病毒株的重组位置、重组的基因片段及重组片段长度均具有多样性，而且重组的位置多位于编码非结构蛋白或次要结构蛋白的基因区域；全基因组遗传演化分析表明，这些病毒株远离国内之前流行的HP-PRRSV，同源性仅为83.4 %～87.2 %，而与其它的类NADC30病毒株位于一个相对独立的分支，以上结果均表明这类病毒株已形成了一个新的亚群，命名为5亚群。本研究中不同地区PRRSV的核苷酸同源性差异较大，仅为88.6 %～99.6 %，并且只有2个病毒株可以感染PAM和MARC-145细胞。本研究表明，以基因缺失和基因重组多样性为主要特征的5亚群PRRSV已在我国流行，其生物学特性有待进一步研究。; 张洪亮张晶李真张文立刘春晓陈家锃相丽润冷超粮彭金美王倩白云安同庆童光志蔡雪辉田志军; 关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒

2014年～2016年某大型规模化猪场猪繁殖与呼吸综合征病毒的遗传演化分析被引量：4: 2017年; 为研究近年来猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)在规模化猪场的变异情况,本研究对华北某规模化猪场2014年~2016年采集的117份疑似PRRS的病料进行PCR检测,结果阳性病料57份,并对阳性病料中PRRSV的NSP2基因和ORF5基因测序分析。结果显示,43份阳性病料中的PRRSV为NSP2缺失1+29个氨基酸,与HP-PRRSV的缺失相同,其NSP2基因区与HP-PRRSV Hu N4株的同源性为93.6%~99.6%;而其余的14份阳性样品中的病毒NSP2则为缺失111+1+19个氨基酸,与PRRSV NADC30株的缺失相同,NSP2基因区同源性为92.3%~92.9%,ORF5基因同源性为93.8%~94.8%。此外,在2016年检测到的4份阳性病料,基于NSP2基因构建的系统进化树显示其属于HP-PRRSV亚群,但基于ORF5基因构建的系统进化树结果显示,这些病毒则与国内近年来在香港、台湾以及华南地区流行的低致病力PRRSV GM2株(谱系3)同源性最高,核苷酸同源性为96.7%~97.0%。以上结果表明2014年以来同一猪场内的PRRSV变异呈多样性,并且出现了两类新的PRRSV变异株。; 李真张洪亮张晶张文立刘春晓相丽润冷超粮彭金美王倩安同庆童光志蔡雪辉田志军; 关键词：猪繁殖与呼吸综合征病毒 NSP2 ORF5 分子流行病学

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李真

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