杨东升
- 作品数:21 被引量:77H指数:6
- 供职机构:内蒙古农业大学农学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划内蒙古自治区自然科学基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学更多>>
- 基于SSR分子标记的高丹草遗传图谱构建及相关性状QTL定位被引量:6
- 2018年
- 本试验以散穗高粱和红壳苏丹草为亲本,以其杂种F2代的170个分离单株为作图群体,利用SSR分子标记技术和Join Map 3.0作图软件构建高丹草遗传连锁图谱,并在此基础上对分蘖数、株高、氢氰酸含量等8个相关性状进行QTL定位。结果表明:从120对SSR引物中共筛选出50对多态性引物,利用这些引物对作图群体各单株进行PCR扩增,共获得226个多态性标记,平均扩增标记为4.5个/引物。构建出一张由10个连锁群组成的高丹草SSR分子遗传图谱,含181个SSR标记,图谱总长803.13 cM。各连锁群长度在5.8~152.3 cM之间,标记间平均距离4.38 cM,图谱密度较高。在构建图谱的基础上,对高丹草8个相关性状进行QTL定位,共获得17个QTLs,其中控制茎粗的QTL 4个,控制叶宽的QTL 3个,控制叶片数、叶长、分蘖数和穗长的QTL各2个;控制株高和氢氰酸含量的QTL各1个。这些QTL位点分布于高丹草SSR遗传连锁图谱的其中8个连锁群上,其遗传贡献率的范围为12.5%~25.6%。本研究可为进一步开展高丹草重要性状基因的精细定位、图位克隆、功能分析,以及分子标记辅助育种提供理论指导。
- 于肖夏南志标于卓杨东升谢锐石悦吴国芳
- 关键词:高丹草遗传连锁图谱QTL定位
- 高丹草茎叶等农艺性状的QTL定位被引量:8
- 2017年
- 以散穗高粱×红壳苏丹草杂种F2代305个分离单株群体为材料,在前期已构建出的高丹草高密度AFLP分子标记遗传图谱上,采用MQM模型法对茎粗、叶片数、叶长、叶宽、穗长、穗宽、分蘖数共7个农艺性状进行了QTL定位分析。结果表明:7个性状三年一点测定的平均值均呈正态分布,适合于QTL定位分析;在LOD>2.5条件下,7个性状共定位了63个QTL,分布在10个连锁群上,其遗传贡献率变幅在8.8%~44.4%之间。在63个QTL中,控制茎粗的QTL有13个,控制叶长的有11个,控制分蘖数的有10个,控制穗宽的有16个,4个性状的QTL在10个连锁群上均有分布;控制叶宽的QTL有2个,分布在LG4连锁群上;控制穗长的有2个,分别位于LG2和LG3连锁群上;控制叶片数的QTL有9个,其分别位于LG1、LG2、LG3、LG4、LG6、LG8、LG10连锁群上。
- 石悦于肖夏于卓杨东升张明飞李造哲姜超
- 关键词:高丹草农艺性状QTL
- 冰草可溶性碳水化合物含量等重要品质性状的QTL定位被引量:2
- 2020年
- 冰草是小麦的重要优质基因源,为更好地利用冰草资源进行小麦育种,以四倍体杂交冰草F2群体的246个分离单株无性系及其亲本为材料,在课题组前期已构建的冰草高密度分子遗传连锁图谱上,利用区间作图法对两年一地环境条件下测定的冰草WSC、淀粉和粗纤维含量的QTL进行了定位分析。结果发现,在LOD>2.5的条件下,共检测到85个QTLs位点;在两年一地不同环境条件下均能检测到的稳定QTLs有11个,分布在冰草LG1、LG3、LG8、LG9、LG10和LG14连锁群上,遗传贡献率范围在10.1%~41.4%之间。贡献率>20%的主效QTLs有6个,分别是qwsc1-1(2)-1、qwsc10-1(2)-2、qwsc14-1(2)-3、qst3-1(2)-5、qcf1-1(2)-3和qcf8-1(2)-2。本研究明确了各稳定QTLs的分子标记位点和遗传效应,为深入开展冰草3个品质性状QTL的精细定位及分子标记辅助育种等研究奠定了基础。
- 李佳奇于卓于肖夏张胜杨东升卢倩倩吴国芳牛亚青青
- 关键词:品质性状QTL定位
- 高丹草AFLP分子遗传连锁图谱的构建被引量:7
- 2017年
- 【目的】对高丹草低氢氰酸含量及产量等重要性状进行QTL定位,构建其AFLP分子遗传连锁图谱,为分子标记辅助育种等研究奠定基础。【方法】以散穗高粱×红壳苏丹草杂种F2代305个分离单株为作图群体,利用AFLP分子标记技术先从供试AFLP引物中筛选适宜引物对,再用这些引物对对其供测群体进行PCR扩增;根据扩增原始数据,利用Join Map 3.0作图软件进行高丹草分子遗传连锁图谱构建。【结果】从113对AFLP引物组合中筛选出了25对多态性丰富、重复性好、条带清晰的适宜引物,对高丹草F2分离群体305个单株的基因组DNA扩增,得到444个AFLP分子标记位点,据此构建的高丹草遗传图谱包含10个连锁群,覆盖的基因组总长度为1 468.12cM,各连锁群的长度变幅为114.24~189.34cM,标记间平均图距为3.38cM。【结论】成功构建了一张密度较高的高丹草分子遗传连锁图谱。
- 石悦于肖夏于卓杨东升姜超张明飞
- 关键词:高丹草AFLP分子标记遗传连锁图谱
- 蒙农7号高丹草的选育及其特性分析被引量:6
- 2017年
- 为培育超低氢氰酸含量且综合农艺性状优良的高丹草新品种,将抗旱抗寒、抗倒伏性强的高粱雄不育系V4A与氢氰酸含量低、叶量大、品质好、营养价值高的棕壳苏丹草进行人工杂交授粉,从F2代群体选择优良单株,通过单株选择和混合选择,历经9个世代育成超低氢氰酸高丹草新品种蒙农7号。新品种生育期142d,具有发达的根系、较强的再生能力和高大的植株,平均株高414.80cm,鲜草、种子产量高,3次刈割平均鲜草产量15.96万kg/hm^2,种子产量5823.63kg/hm^2;拔节期,茎叶鲜草氢氰酸含量仅7.06mg/kg,粗蛋白质含量14.63%、粗脂肪含量3.58%;开花期粗蛋白质含量8.00%,粗脂肪含量2.27%,且富含各种氨基酸及粗纤维、钙、磷等;花期主茎糖锤度高达11.39%,多汁,茎叶比小(2.92),适口性好,适应性广,推广利用前景广阔。
- 于卓焦欣磊于肖夏马艳红石悦张明飞杨东升
- 关键词:种间远缘杂交饲用价值
- 基于SRAP分子标记的冰草遗传连锁图谱构建被引量:10
- 2019年
- 构建高密度遗传连锁图谱是冰草抗性、品质、产量等重要性状QTL精细定位及标记辅助育种研究的基础。该试验以四倍体杂交冰草F2群体的202个分离单株及其亲本为材料,利用SRAP分子标记技术和Join Map 4.0作图软件对冰草的遗传连锁图谱进行了构建。结果表明:(1)共筛选出22对多态性好、标记位点清晰稳定的SRAP适宜引物,对冰草杂种F2分离单株的基因组DNA进行PCR扩增,共获得510个SRAP多态性标记位点,其比率占88.2%。(2)偏分离分析表明,偏分离标记比率仅为14.12%,符合遗传作图的要求。(3)成功构建了冰草的SRAP分子标记遗传连锁图谱,该图谱有14个连锁群、510个标记,连锁群间长度范围86.4~179.0cM,覆盖基因组总长度1 912.9cM,标记间平均间距3.75cM,为高密度遗传图谱。
- 李佳奇于卓杨东升于肖夏吴国芳牛亚青青
- 关键词:冰草SRAP标记
- 四倍体杂交冰草SRAP和SSR分子标记遗传连锁图谱构建被引量:6
- 2018年
- 为了给后期冰草抗旱耐寒基因筛选及QTL图位克隆搭建平台,并为产量及相关性状QTL定位和分子标记辅助育种奠定基础,以航道冰草和蒙古冰草为亲本,杂交加倍后随机选取180个F2分离单株为作图群体,利用SRAP和SSR分子标记进行四倍体杂交冰草遗传连锁图谱的构建。结果表明,构建的图谱包含475个标记(240个SRAP标记和235个SSR标记),分布于14个连锁群,图谱全长为1 592.7cM,标记间平均间距为3.35cM,各连锁群长度范围为67.6~145.2cM。该图谱密度较高、标记位点分布均匀且连锁群更加饱满。
- 杨东升于卓于肖夏李晓宇吴国芳石悦张明飞
- 关键词:SRAP遗传连锁图谱
- 马铃薯新品系染色体构型及SSR分析被引量:2
- 2021年
- 为明确马铃薯新品系染色体构型及在DNA水平上的遗传差异。以5个马铃薯新品系(NNS-01、NNS-02、NNS-03、NNS-04、NNS-05)及对照(MIN-021)为材料,采用常规压片法及SSR分子标记技术对其PMCMⅠ染色体配对构型及SSR多态性进行了分析。结果表明,5个马铃薯新品系的染色体构型明显不同,依次为7.66Ⅰ+7.52Ⅱ+6.82Ⅲ+1.21Ⅳ、4.72Ⅰ+11.02Ⅱ+3.2Ⅲ+2.91Ⅳ、5.26Ⅰ+10.2Ⅱ+3.82Ⅲ+2.72Ⅳ、8.39Ⅰ+7.32Ⅱ+6.51Ⅲ+1.36Ⅳ和4.96Ⅰ+8.06Ⅱ+5.74Ⅲ+2.43Ⅳ。利用筛选出的10对SSR适宜引物,对各供试材料的基因组DNA进行PCR扩增,获得SSR多态性条带94个,多态性比率为72.23%;用特异性引物S 189建立了能明显鉴别5个新品系及对照材料的SSR指纹图;以GD值0.39为基准,将6个材料分成四类:新品系NNS-01和NNS-02为一类,新品系NNS-03和对照材料MIN-021为一类,NNS-04和NNS-05各单独为一类。
- 刘宇飞于卓于肖夏杨东升李佳奇李景伟卢倩倩李靓
- 关键词:马铃薯新品系染色体构型SSR分析
- 基于BSA-SSR技术的高丹草低氢氰酸性状目的片段的筛选与鉴定被引量:2
- 2021年
- 采用BSA-SSR技术对高丹草低氢氰酸含量性状DNA目的片段进行了筛选和鉴定。结果表明,利用筛选出的9对SSR适宜引物PCR扩增找到了与高丹草低氰酸性状相关的SSR目的片段26个,经对PCR产物回收、部分纯化及测序分析,得到了这些低氰DNA片段的碱基序列。经与BLASTn数据库序列比对发现,有2个低氰目的片段TF8和TF16分别与高粱叶绿体磷酸核糖激酶XM_021458168.1和高粱克隆BAC 88M4 AY661656.1基因同源性高达95.4%和97.0%,其片段大小分别为101和586 bp。但在DNA碱基上有一定变异,TF8片段发生了3次碱基替换和1次插入,导致丙氨酸和甘氨酸替换成半胱氨酸,苏氨酸替换成丙氨酸,甘氨酸缺失;TF16片段缺失了1个碱基A,导致丙氨酸缺失。据此推测TF8和TF16这2个低氰目的片段具有调控低氢氰酸含量性状的作用。该研究结果为深入开展高丹草低氢氰酸含量性状主效QTL精细定位及标记辅助育种等研究奠定了基础。
- 吴国芳于肖夏于卓杨东升卢倩倩
- 关键词:高丹草
- 冰草SSR-PCR体系优化及验证被引量:2
- 2020年
- 以蒙古冰草(Agropyron mongolicum var.mongolicum)DNA为模板,利用单因素与正交试验设计相结合的方法,对影响冰草SSR-PCR体系的dNTP浓度、Mg2+浓度、引物浓度、模板DNA浓度和Taq DNA聚合酶用量5个因素进行优化。结果表明,冰草SSR-PCR的最佳体系为:dNTP浓度250μmol·L^–1、Mg^2+浓度2.25 mmol·L^–1、引物浓度0.60μmol·L^–1、模板DNA浓度40 ng·μL^–1和Taq DNA聚合酶用量0.75 U,其余为ddH2O,反应总体积为20μL。本研究筛选出适于冰草SSR-PCR的最佳反应体系,可提高冰草SSR扩增条带的清晰度和可靠性,这为后续深入开展冰草的遗传作图、重要性状QTL定位及分子标记辅助育种等研究奠定了基础。
- 于肖夏杨东升于卓卢倩倩吴国芳李景伟张明飞
- 关键词:冰草SSR-PCR分子标记辅助育种