高营
- 作品数：3 被引量：8H指数：2
- 供职机构：中国医科大学附属第一医院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- hsa-miR-138的生物信息学分析及分子调控通路预测被引量：3
- 2016年
- 目的对hsa-miR-138进行靶基因、功能富集分析(GO分析)、信号通路富集分析及转录因子预测等生物信息学分析,为后续深入研究hsa-miR-138功能提供实验验证的理论基础。方法通过UCSC基因组浏览器、Target Scan、starbase、DAVID及KEGG公共数据库、Chipbase等在线工具分析hsa-miR-138序列,预测hsa-miR-138-1的靶基因,对预测的靶基因进行GO分析和信号通路富集分析,预测hsa-miR-138的可能转录调控因子。结果 hsa-miR-138序列在各物种间具有高度保守性。通过对目前文献的检索,发现hsa-miR-138-1的靶基因中既有抑癌基因,也有癌基因。GO分析发现hsa-miR-138-1靶基因主要富集在转录调控、转录、RNA代谢过程的调节、基因表达、生物大分子的合成等方面(P<0.01),KEGG通路分析提示相关信号通路主要涉及癌症通路、轴突导向、细胞内噬作用、Wnt信号转导、神经营养因子信号转导等重要生理病理过程。应用Chipbase预测出hsamiR-138的19个调控转录因子。结论 hsa-miR-138可能参与多种重要的生物学过程,并作为双向调节因子调控肿瘤的生物学行为。
- 孙丹于萌郑明星高营朱育焱
- 关键词：生物信息学靶基因信号通路
- 一种泌尿外科肿瘤用微创手术刀
- 本实用新型公开了一种泌尿外科肿瘤用微创手术刀，包括刀片、刀柄、滑槽、固定孔、固定槽、调节机构、限位孔和固定机构，所述刀柄的一侧开设有固定槽，所述刀柄的顶部中心处开设有滑槽，所述刀柄上安装有调节机构，所述刀柄的顶部一侧开设...
- 朱育焱于萌孙丹孔垂泽高营邢昊天郝文俊黄志弘
- 文献传递
- Netrin-1蛋白的结构与功能生物信息学分析被引量：5
- 2019年
- 目的:通过生物信息学方法对Netrin-1蛋白的结构和功能进行全面的预测分析,从而为癌症发病机制及治疗提供理论依据。方法:利用ProtParam、Genecards、STRING等数据库对Netrin-1蛋白的序列同源性、亚细胞定位、理化性质、空间结构及蛋白质相互作用网络及表达谱进行综合分析。结果:人Netrin-1蛋白由604个氨基酸组成,在进化过程中高度保守,属于Laminin_N超家族和NTR_like超家族,是一种亲水、不稳定的分泌蛋白。该蛋白主要二级结构为无规卷曲,存在较多潜在的磷酸化、乙酰化位点,其互作蛋白有DCC、UNC5H家族、FYN、BCAR1、MAP1B等,在结肠癌、乳腺癌、前列腺癌等实体肿瘤中表达较高。结论:综合Netrin-1蛋白的结构、功能信息,提示其可能通过调节多种肿瘤相关信号通路促进肿瘤恶性进展。
- 郝文俊于萌邢昊天孙丹孙丹高营朱育焱
- 关键词：NETRIN-1癌症生物信息学
