邹秀群
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：上海交通大学医学院生物化学与分子细胞生物学系更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 基于RNA测序研究过表达AJUBA对T47D基因表达谱的影响
- 2016年
- 目的探究AJUBA基因对于雌激素受体阳性乳腺癌细胞T47D基因表达的影响。方法构建AJUBA稳定过表达的T47D细胞系。载体对照组和实验组分别提取RNA进行转录组测序技术(RNA-seq)测序,将所得序列映射到人类基因组并进行转录组重建,样本标准化后寻找实验组和对照组之间的差异基因,利用生物信息学方法进一步对所得的差异基因进行基因本体论(GO)分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集性分析,同时挑选部分基因用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-q PCR)进行基因表达验证。结果实验组与对照组细胞相比共找到568个差异基因,其中上调基因239个,下调基因329个。GO分析中,注释到分子功能、生物学过程和细胞组成的上调差异基因分别有3、23、8个;下调差异基因分别有21、35、9个。KEGG分析中上调基因显著富集通路有2个,下调基因显著富集通路有4个。结论 AJUBA过表达可以影响T47D细胞的一系列生物学过程相关的多条信号通路,可能在乳腺癌发生、发展中起重要作用。
- 徐北惠李琪邹秀群徐洪侯照远王家敏倪培华
- 关键词：差异表达基因生物信息学分析
- 结直肠腺癌中特异蛋白1表达与临床病理指标的关系被引量：1
- 2014年
- 目的研究结直肠腺癌组织中特异蛋白1(Sp1)表达的变化及其与患者临床病理学指标的关系。方法通过查阅mRNA array数据库Oncomine,分析结直肠腺癌组织及正常组织中Sp1 mRNA的水平和差异。采用免疫组织化学法检测65例结直肠腺癌组织及其癌旁正常组织中Sp1蛋白的表达,Western blotting检测5个不同恶性程度的结直肠癌细胞系中Sp1蛋白的表达,分析Sp1表达水平与结直肠癌患者临床病理学指标之间的关系。结果查阅Oncomine数据库发现Sp1 mRNA在结直肠腺癌组织中的表达与正常组织无明显差异。免疫组织化学法及细胞系Western blotting检测结果证实,Sp1在结直肠腺癌组织和细胞系中均有较高的一致性表达,但与癌旁正常组织无差异;肿瘤组织中Sp1蛋白表达水平与结直肠腺癌患者淋巴结和远处转移与否无明显相关性。结论转录因子Sp1在结直肠腺癌组织中的表达与正常组织无明显差异,与肿瘤转移无明显相关性。
- 宋立伟王文越邹秀群陈宁崔志滨王兵
- 关键词：结直肠腺癌免疫组织化学
