张茨
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：中国科学院生物物理研究所更多>>
- 发文基金：中国科学院知识创新工程国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学自然科学总论更多>>
- ATOM 1.0:基于GPU的电子断层重构软件被引量：1
- 2011年
- 电子断层成像技术能够在纳米尺度下重构出不具有全同性的细胞或大分子的三维结构,正受到越来越广泛的重视。针对现有电子断层成像技术中重构软件的不足,特别是迭代重构算法速度慢的缺点,我们开发了一款基于Graphic Processor Unit(GPU)平台的电子断层重构软件——ATOM,实现了图像对位、重构参数计算、三维重构及数据可视化等电子断层重构的基本功能。其中,在二维对位方面,ATOM实现了迭代的无标记平移和旋转对位;在三维重构方面,实现了背投影和多种迭代重构算法,并实现了迭代重构在GPU平台上的并行加速,获得了良好的加速比,如SIRT算法得到了47倍加速比。ATOM是绿色开源软件,可以运行在支持Qt和CUDA的所有操作系统上。ATOM为图形界面软件,结合详尽的安装及使用文档,便于用户使用。
- 储琪张凯万晓华张茨张艳张广勇沈铂卢晓伟赵开勇褚晓文张法孙飞
- 关键词：GPU加速图形界面
- 破解蛋白质翻译机器的结构与功能——2009年诺贝尔化学奖简述
- 2009年
- 作为将基因信息翻译为蛋白质的机器,核糖体对于生命活动至关重要。2009年诺贝尔化学奖授予了在核糖体结构功能研究中做出突出贡献的三位科学家:Venkatraman Ramakrishnan(英国剑桥MRC分子生物学实验室),Thomas A.Steitz(耶鲁大学)和Ada E.Yonath(以色列魏茨曼科学研究所)。文章以时间为主线,对核糖体结构以及基于结构的功能研究的历程、意义、历史性突破和应用进行了介绍,并由此对结构生物学的未来进行了一些思考。
- 张凯张茨孙飞
- 关键词：核糖体诺贝尔化学奖晶体结构
