张正东
- 作品数:2 被引量:0H指数:0
- 供职机构:贵州大学计算机科学与技术学院更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:生物学交通运输工程更多>>
- 基于MR_MC无线传感网的高速公路凝冻监测系统设计研究
- 2014年
- 对MR_MC的技术背景及其在无线传感网中的应用和关键技术进行分析。针对凝冻灾害天气分析并设计一个基于MR_MC技术搭建的凝冻监测系统,且对该系统各部分的设计及其在贵州省高速公路凝冻监测中的应用进行阐述。实践证明:该系统能有效提高高速公路凝冻监测能力,可保障公路交通的安全性。
- 张正东谢晓尧徐曦
- 关键词:无线传感网
- 基于EST序列的茶代谢网络的构建
- 2017年
- 茶树体内的生化反应所生成的各种功能性化合物是茶叶具有营养和健康功能的物质基础,也是茶叶品质的决定因素。这些生化反应由茶树基因编码的酶催化并组成复杂的代谢网络。首先通过开源工具包jsoup开发异步数据采集程序,从布伦瑞克酶数据库(braunschweig enzyme database,简称BRENDA)和美国国立生物技术信息中心(NCBI)网站上获取酶序列及其催化反应、GI号、EC编码对应关系等相关信息,建立本地酶数据库;其次从NCBI上下载FASTA格式的茶树表达序列标签(expressed sequence tag,简称EST)序列数据,通过GI号查询本地酶数据库,得到酶催化反应信息,继而基于超图思想利用Cytoscape Web API重构茶代谢网络;最后对EST序列信息进行统计分析,并从多个维度对构造的代谢网络进行拓扑特性、KEGG路径、生物意义的深入分析,对茶树内生化反应的理解、新功能基因的挖掘、茶叶品质的提升、新茶产品的开发具有重要意义。
- 张正东申铁周文卫谢晓尧
- 关键词:WEBEST超图代谢网络茶叶