目的:利用网络药理学方法,探讨二仙汤治疗乳腺癌的潜在作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)收集二仙汤药物的活性成分和其作用靶点,运用GeneCards、OMIM及CTD数据库建立乳腺癌靶点数据库。提炼出二仙汤作用于乳腺癌的交集靶点,运用Cytoscape Version 3.7.1软件和STRING数据库分别绘制“二仙汤活性成分-作用靶点-乳腺癌”网络图和蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein Interaction,PPI)网络图,运用R语言相关程序包进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析和基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析,最后运用分子对接验证活性成分与核心靶点的作用强度。结果:二仙汤共有93个活性成分,154个作用靶点,乳腺癌疾病靶点共有364个,中药成分靶点和乳腺癌交集靶点共有40个,具有重要作用的中药成分是槲皮素、山柰酚、异延胡索单酚碱和β-谷甾醇,关键核心靶点有TP53、IL-6和JUN。GO功能富集分析和KEGG通路富集分析共筛选出1502条GO信号通路(P<0.05)和101条KEGG信号通路(P<0.05),主要涉及癌症途径和PI3K-AKT信号通路等。分子对接结果显示,化合物和作用靶点之间具有较好的结合力。结论:二仙汤治疗乳腺癌具有多成分、多靶点和多通路的特点,可为后续研究提供更多支持。
目的:基于网络药理学-分子对接技术,探讨山慈菇治疗乳腺癌的分子作用机制。方法:从中药系统药理学数据库与分析平台(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)和UniProt数据库中收集山慈菇的活性成分和其作用靶点,运用GeneCards、人类孟德尔遗传综合数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)和毒性与基因比较数据库(comparative toxicogenomics database,CTD)建立乳腺癌靶点数据库,获取山慈菇作用于乳腺癌的交集靶点。运用Cytoscape Version 3.7.1软件和STRING数据库分别绘制“山慈菇-活性成分-作用靶点”网络图和蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络图,运用R语言相关程序包进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)通路富集分析和基因本体(gene ontology,GO)功能富集分析,运用分子对接技术验证活性成分与核心靶点的作用强度,最后运用细胞实验证明山慈菇水煎液对乳腺癌细胞增殖的抑制作用。结果:山慈菇共有3个活性成分,涉及70个作用靶点,乳腺癌作用靶点有364个。山慈菇作用靶点和乳腺癌疾病靶点共有14个交集靶点。其中,重要的中药成分有豆甾醇和β-谷甾醇;关键作用靶点为PTGS2、JUN、ESR1和NOS3。GO功能富集分析和KEGG通路富集分析结果显示,共筛选出475条GO信号通路和23条KEGG信号通路,主要涉及癌症的途径和雌激素信号通路等。分子对接结果显示,化合物与靶点之间具有较好的结合能。细胞实验结果证实,山慈菇对乳腺癌具有较好的抑瘤作用。结论:山慈菇治疗乳腺癌具有多成分、多靶点和多通路的特点,可为临床应用提供更多参考。
