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狐狸MC1R基因编码区c. 40A>C和c. 41C>T相邻变异研究被引量：2: 2016年; 为了检测狐狸MC1R基因多态性及其与毛色表型的相关性,本研究采集两个狐属12种毛色共计163只狐狸的皮肤组织样,利用PCR扩增和产物直接测序的方法获得狐狸MC1R基因1 054bp长的核苷酸序列,并进行了SNPs筛查。用PopGen32和SHEsis软件对突变位点进行了群体遗传学分析,用PANTHER软件评估了突变对基因产生的功能影响,用SPSS二元变量相关统计方法分析了多态位点与毛色表型间的相关性。结果表明,狐狸MC1R基因编码区40(c.40A>C)和41位点(c.41C>T)存在2个相邻错义突变,导致其编码的第14位氨基酸发生了变异:当第40位点为A时,氨基酸由苏氨酸(Thr)转变为异亮氨酸(Ile);当第40位点为C时,氨基酸由脯氨酸(Pro)转变为亮氨酸(Leu)。北极狐属狐在41位点基因型全部为TT型,而狐属狐大部分个体均为CC型,不存在TT型,推测该位点可能是区分狐狸属间的一个重要功能位点。PANTHER预测获知第41位点突变导致的氨基酸替换(p.Pro14Leu)对MC1R功能有显著影响。SPSS二元变量相关分析结果表明,41位点多态性与狐狸毛色表型存在显著低度相关性,推测狐狸MC1R基因编码区第41位点可能是参与其毛色形成的一个相对重要功能位点。; 徐桂利张文香段玲欣巩元芳葛慕湘刘谢荣王书朋果新苓刘铮铸; 关键词：狐狸 MC1R基因多态性毛色

HBV感染食蟹猴肝细胞的研究: 乙型肝炎病毒(hepatitis B virus，HBV)感染可诱发肝炎、肝硬化，甚至肝癌，是严重威胁人类健康的疾病之一。在HBV相关研究中，研究人员建立了一系列HBV感染的细胞和动物模型。虽然这些模型极大地推动了HBV...; 徐桂利; 关键词：食蟹猴原代肝细胞乙型肝炎病毒发病机制; 文献传递

狐狸Agouti基因SNPs筛查及其与毛色关联性分析被引量：5: 2015年; 旨在探究狐狸刺豚鼠基因(Agouti)多态性及其与狐狸被毛颜色之间的关系。本研究采用PCR和直接测序的方法对中国5个狐种58只狐狸的Agouti基因部分序列进行了SNPs筛查和单倍型分析。结果表明,在已测序的58只狐狸中首次发现6个SNPs(g.269G>T、g.295C>T、g.325T>G、g.518G>A、g.608C>A和g.846G>A),它们全部存在于内含子2上。狐属的所有个体(25只)在6个位点全部为纯合子基因型,依次为GG、CC、TT、GG、CC和GG型,而北极狐属的所有个体(33只)在这6个位点则均为另一种纯合子基因型,依次为TT、TT、GG、AA、AA和AA型。6个SNPs形成两种单倍型:单倍型Ⅰ(H1:GCTGCG)和单倍型Ⅱ(H2:TTGAAA),分布频率分别为42.1%和57.9%。单倍型Ⅰ(H1)分布于狐属3个狐种的所有受试个体中,单倍型Ⅱ(H2)分布于北极狐属两个狐种的所有受试个体中。进一步分析没有发现6个SNPs及其单倍型与狐狸毛色的明显关联性,但推测它们是区分狐属和北极狐属的重要功能位点和重要单倍型。; 李英杰刘铮铸巩元芳徐桂利张磊唐家明段玲欣刘谢荣郭秀玲陆奇玉; 关键词：狐狸 SNPS 单倍型毛色

银黑狐MC1R基因核心启动子区的鉴定: 2022年; 【目的】确定银黑狐黑素皮质激素受体1(melanocortin 1 receptor,MC1R)基因的核心启动子区,为探究该基因的表达调控机制提供理论依据。【方法】以银黑狐基因组DNA为模板,PCR扩增获得MC1R基因5′-UTR区序列,利用3个在线生物学软件综合预测MC1R基因启动子活性区;PCR扩增获得该基因5′-UTR区不同长度的缺失片段,并克隆至pMD19-T载体,将重组质粒转染至黑色素B16细胞中,利用双荧光素酶检测技术对10个缺失片段进行荧光素酶活性检测。【结果】成功获得银黑狐MC1R基因5′-UTR区序列,软件预测显示-596/+73 bp可能为启动子活性区。双荧光素酶活性检测发现,构建的10个缺失片段的荧光素酶表达载体均具有启动子活性,其中pGL3-MC1RP8(-520/+73 bp)有较强的活性,提示其为核心启动子区,与软件预测结果基本一致。【结论】试验确定了银黑狐MC1R基因的核心启动子区为―520/+73 bp,为深入研究该基因的毛色调控机制奠定了理论基础。; 刘华云张磊徐桂利张天浩谢遇春段玲欣刘铮铸巩元芳; 关键词：银黑狐 MC1R基因启动子核心区

靶向食蟹猴NTCP基因的CRISPR/Cas9系统gRNA筛选被引量：1: 2016年; 本研究旨在通过CRISPR/Cas9体外酶切法及细胞水平上的PCR扩增测序筛选出靶向食蟹猴NTCP基因具有高敲除活性的gRNA。首先通过比对食蟹猴与人类NTCP氨基酸序列,选择差异位点,即第84—87位和第157—165位氨基酸作为基因靶点序列区;利用gRNA软件设计针对上述基因靶点序列的gRNA,每个靶点设计3～4条候选gRNA序列;然后利用gRNA体外检测试剂盒,筛选出靶向NTCP基因的体外敲除活性较高的两条gRNA序列：gRNA1.2和gRNA2.1。将gRNA1.2和gRNA2.1分别插入pLV hUbC-Cas9-T2A-GFP载体中,转染食蟹猴原代肝细胞。提取转染后细胞基因组DNA,通过PCR扩增NTCP基因并将其克隆到T载体中进行测序分析。结果表明,gRNA1.2和gRNA2.1均可使NTCP基因产生移码突变,但gRNA2.1比gRNA1.2具有更高的敲除活性。本研究为下一步编辑食蟹猴NTCP基因及研究其在乙型肝炎病毒（HBV）感染中的功能奠定了基础。; 徐桂利高新刘铮铸巩元芳宋海峰; 关键词：食蟹猴基因敲除

毛皮动物毛色调控基因的研究进展被引量：13: 2015年; 狐、貉、貂等毛皮动物毛纤维颜色丰富,含有多种天然毛色,主要由遗传基因决定。掌握调控毛皮动物毛色基因的作用机制,可以有效控制毛皮动物毛色的转变。动物毛色表型与其体内黑色素的种类、数量、合成及分布有关。在动物皮肤组织中,MC1R基因、Agouti基因、TYR基因、CBD103基因、SILV基因和KIT基因都参与毛色的形成与调控,文章对这些调控毛皮动物毛色的候选基因、作用机理及其与毛色表型的相关性研究进行了综述。; 徐桂利刘铮铸巩元芳冯敏山段玲欣吴建华郭秀玲陆奇玉; 关键词：毛皮动物毛色候选基因

乙肝病毒体内外感染模型研究进展被引量：2: 2016年; 乙肝病毒是威胁人类健康的重要病原体之一。目前,利用针对乙肝病毒和宿主分别建立的细胞模型和动物模型,广泛应用于乙肝病毒的基础研究、新药研发和新疗法的探索。但是,这些模型仍然存在某些方面的缺陷,如感染率低、感染期短,与人存在较大的种属差异等,最重要的是,这些模型无法完全模拟乙肝病毒自然感染人的过程及产生病理变化。本文对近十五年来主要乙肝病毒体内外感染模型及其最新的研究进展进行简要综述,为今后建立新型乙肝病毒感染模型提供参考。; 徐桂利高新刘铮铸巩元芳宋海峰; 关键词：乙肝病毒细胞模型动物模型

银黑狐TYRP1基因CDS区鉴定及生物信息学分析: 2018年; 为了探明酪氨酸酶相关蛋白1（TYRP1）基因对狐狸毛色的调控机制，本研究利用RT-PCR、染色体步移和核酸测序等技术，获得了银黑狐TYRP1基因完整编码区（coding DNA sequence，CDS），利用ProtParam和PredictProtein等在线软件对该基因进行了生物信息学分析，并利用Lasergene7．1软件包进行银黑狐与其他物种间的同源性分析及系统进化树的构建。结果表明，银黑狐TYRP1基因CDS区共计1614bp，编码537个氨基酸残基，属于不稳定可溶性亲水蛋白质。亚细胞定位主要在内质网和高尔基体中，属于分泌蛋白。在第24和25个氨基酸之间存在1个裂解位点，存在信号肽。其属跨膜蛋白，包括跨膜域、胞外域和胞内域3个部分。二级结构以无规则卷曲为主（59．03％），α-螺旋占22．91％，属卷曲蛋白质。三级结构与二级结构预测结果基本一致，主要是由无规则卷曲和α-螺旋构成。银黑狐与其他10个物种间的相似度为88．6％～99．6％，说明物种之间同源性较高，TYRP1基因编码区在进化过程中保守性较强。系统进化分析提示，银黑狐与赤狐和家犬的遗传亲缘关系最近。银黑狐TYRP1基因编码区的成功获取及分析为进一步探讨其在毛色形成过程中的功能研究提供了较好的理论依据。; 张文香徐桂利刘艳军牛迪彭永东尹生辉石刚刘铮铸巩元芳李祥龙李佩国; 关键词：银黑狐染色体步移生物信息学分析

Agouti基因及其与动物毛色关系的研究进展被引量：9: 2015年; 动物特别是毛皮动物,毛纤维颜色丰富多彩,其主要由遗传基因调控,在众多的调控基因中,Agouti基因是一个重要的功能基因。论文重点综述了Agouti基因结构及其在人、小鼠、家养普通动物和毛皮动物毛色方面的研究现状,旨在为动物毛色选育提供参考依据。; 李英杰唐家明张磊徐桂利张文香段玲欣刘谢荣刘铮铸巩元芳; 关键词：动物毛色

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徐桂利

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