陈飞飞
- 作品数:7 被引量:1H指数:1
- 供职机构:南京林业大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金更多>>
- 相关领域:环境科学与工程农业科学更多>>
- 吡咯伯克霍尔德氏菌JK-SH007高GC基因PCR体系的扩增研究被引量:1
- 2017年
- 对生防菌吡咯伯克霍尔德氏菌JK-SH007基因组上高GC基因PCR扩增体系进行探讨。通过对该菌株基因组进行100℃处理5 min;PCR反应体系为10μL,在体系中使用高保真LA Taq(Mix)酶,并分别加入不同体积分数的DMSO、2×GC bufferⅠ、2×GC bufferⅡ,然后选用适当的PCR程序对产几丁质酶基因(bcc1,GC含量71.1%)进行扩增,在此基础上,选择最适体系对产ACC脱氨酶基因(acd S,GC含量66.86%)、内切葡聚糖酶基因(GC含量74.71%)、色氨酸单加氧酶基因(iaa M,GC含量6.62%)、嗜铁素合成相关基因(cepR,GC含量64.44%)进行PCR扩增,将扩增出的片段与PMD19-T vector连接后转化至大肠杆菌JM-109中进行测序。结果表明:JK-SH007菌株基因组经高温处理后,在PCR反应体系中加入10%DMSO可成功扩增出该菌株bcc1基因(2 484 bp)。该体系同样适用于acd S、内切葡聚糖酶、iaa M、cepR等基因,而且测序结果与预期的序列一致。因此,该体系具有广泛性,而且简单可靠,成本低,扩增效率高,具有很强的实用性,为洋葱伯克霍尔德氏菌群菌株及其他菌株高GC含量基因的克隆提供了参考依据。
- 张鹏飞吴伟陈飞飞叶建仁任嘉红
- 关键词:测序PCR扩增
- 一种适用于吡咯伯克霍尔德氏菌JK-SH007的转化方法
- 本发明公开了一种适用于吡咯伯克霍尔德氏菌JK‑SH007的高效转化方法,包括:1)取感受态细胞,冰浴融化;2)取pHKT2质粒加入含感受态细胞混匀,冰浴15~75min;3)液氮冷冻30~150sec,32~42℃水浴1...
- 叶建仁陈飞飞刘婉慧吴学连黄金思
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- 一种吡咯伯克霍尔德氏菌形成生物膜的方法
- 本发明公开了一种吡咯伯克霍尔德氏菌形成生物膜的方法,包括以下步骤:1)采用LB固体平板活化吡咯伯克霍尔德氏菌JK‑SH007菌种,获得单菌落,挑取单菌落进入LB液体培养基,180r/min,28℃纯培养24h,获得菌悬液...
- 叶建仁付欢欢陈飞飞刘婉慧方雪琦王朝恩
- 文献传递
- 一种基于反复冻融方式的基因组DNA提取方法
- 本发明公开了一种基于反复冻融方式的基因组DNA提取方法,向提取细胞培养物(细菌,真菌,线虫等)加入提取缓冲液,混匀后反复冻融两次,加入RNase 37℃孵育10min,再加入5M NaCl和10%SDS充分混匀后,再次冻...
- 叶建仁陈飞飞刘婉慧王俊伟唐旭黄金思
- 文献传递
- 一种冷适应性内切β-1,4-葡聚糖酶及其表达基因和应用
- 本发明公开了一种冷适应性内切β‑1,4‑葡聚糖酶及其表达基因和应用,所述的冷适应性内切β‑1,4‑葡聚糖酶的氨基酸序列如 SEQ ID NO.1所示,其表达基因的核苷酸序列如 SEQ ID NO.3所示。本发明采用PCR...
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- 一种促进拟茎点霉产生大量分生孢子的方法
- 本发明公开了一种促进拟茎点霉产生大量分生孢子的方法,包括:1)采用PDA培养基在固体平板上活化拟茎点霉菌种,获得到菌丝体;2)采用打孔法取步骤1)的菌丝体接种于装有PDA培养基的培养皿中,置于黑暗培养箱培养;3)待拟茎点...
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- 文献传递
- 一种吡咯伯克霍尔德氏菌形成生物膜的方法
- 本发明公开了一种吡咯伯克霍尔德氏菌形成生物膜的方法,包括以下步骤:1)采用LB固体平板活化吡咯伯克霍尔德氏菌JK‑SH007菌种,获得单菌落,挑取单菌落进入LB液体培养基,180r/min,28℃纯培养24h,获得菌悬液...
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