张龙涛
- 作品数：3 被引量：6H指数：2
- 供职机构：上海海洋大学水产与生命学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 三疣梭子蟹核受体基因HR38的克隆及其在蜕皮中的表达分析
- 2016年
- 采用RACE技术,克隆出三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)核受体基因HR38的c DNA全长,命名为PTHR38。该基因c DNA序列全长为2950 bp,5′和3′非编码区(UTR)长分别为101 bp和551 bp,开放阅读框(ORF)长2298 bp。推测编码765个氨基酸,预测分子量为84.2 k D,理论等电点为6.3。生物学分析预测,PTHR38基因编码的蛋白属于不稳定蛋白,不具有跨膜结构域。同源性分析表明,PTHR38基因编码的氨基酸序列与大型溞(Daphnia magna)的同源性最高。实时荧光定量分析表明,PTHR38基因在蜕皮周期的各个组织中均有差异表达,在眼柄中表达差异最大。去除单侧眼柄后,PTHR38的表达量在整体上呈现不同程度的上升趋势。
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- 关键词：三疣梭子蟹核受体基因克隆基因表达
- 三疣梭子蟹ftz-f1基因的克隆及相关核受体基因在蜕皮中的功能分析被引量：2
- 2015年
- 采用RACE技术克隆三疣梭子蟹核受体fzt-f1基因,全长c DNA序列1763bp。该基因3′和5′非编码区分别为1034bp和141bp,开放阅读框为588bp,推测编码195个氨基酸,预测分子量为22.8k Da,理论等电点为6.35,命名为PTNHr基因。同源性和系统进化分析表明,三疣梭子蟹fzt-f1基因与刀额新对虾同源性高达75.4%,并且与刀额新对虾聚为一支。对核受体基因fzt-f1、Ec R和RXR在蜕皮周期中的表达情况进行实时荧光定量PCR分析,结果表明,三个核受体基因在不同蜕皮时期,均出现表达差异,说明这三个基因都参与蜕皮调控过程。其中,fzt-f1和RXR基因在不同蜕皮时期的表达模式上出现相反的表达特征,预测这两个基因存在相互抑制的调节关系。Ec R和RXR基因在不同蜕皮时期的表达模式上出现部分相似的表达特征。
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- 关键词：三疣梭子蟹核受体基因克隆
- 三疣梭子蟹钙调蛋白基因的克隆及在蜕皮中的功能分析被引量：4
- 2015年
- 基于转录组数据库信息,采用RACE技术克隆获得三疣梭子蟹(Portunus trituberculatus)钙调蛋白基因(PTCaM)。该基因cDNA全长1981 bp,包含450 bp的开放阅读框,编码149个氨基酸,预测分子量16.8 k D,理论等电点为4.09。对序列进行生物信息学分析发现,PTCaM是一个高度保守的序列,具有EF家族典型的EF-hand钙离子结合域。同源性分析结果表明,PTCaM基因编码的氨基酸与果蝇和中华绒螯蟹(Eriocheir sinensis)的Ca M氨基酸序列覆盖率高达100%,与凡纳滨对虾(Litopenaeus vannamei)、克氏原螯虾(Procambarus clarkia)和仿刺参(Apostichopus japonicus)覆盖率高达99%。系统进化表明,PTCaM基因氨基酸序列与凡纳滨对虾、中华绒螯蟹和克氏原螯虾聚为一支。通过分析不同蜕皮时期各个组织中PTCaM的表达情况得知,该基因在蜕皮时期的各个组织中均出现差异性表达,并且差异显著,说明该基因参与蜕皮调控过程。
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- 关键词：三疣梭子蟹钙调蛋白基因克隆
