柴海云
- 作品数：5 被引量：14H指数：2
- 供职机构：广州金域医学检验中心有限公司更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 真菌DNA提取液及提取方法
- 本发明公开了一种真菌DNA提取液及提取方法，其包括Chelex‑100、tris‑HCl、EDTA‑Na<Sub>2</Sub>、NaN<Sub>3</Sub>、蛋白酶K以及蜗牛酶。该真菌DNA提取液中通过添加蜗牛酶，可...
- 柴海云朱庆义张磊
- 文献传递
- 嗜肺军团菌核酸疫苗研究进展被引量：1
- 2014年
- 嗜肺军团菌通过气溶胶的形式感染人和动物,引起军团菌性肺炎,危害极其严重,但该病目前尚无有效的预防措施。军团菌病疫苗的研究经历了灭活疫苗、减毒活疫苗和蛋白亚单位疫苗不同阶段,但至今尚未能在临床得到应用。核酸疫苗作为一种新型疫苗,能有效诱导机体产生细胞免疫应答,符合兼胞内寄生菌嗜肺军团菌的预防需要,并且还具有诸多其他优点,引起了研究者们的兴趣。对嗜肺军团杆菌核酸疫苗的研究现状进行了简要介绍。
- 柴海云朱庆义
- 关键词：嗜肺军团菌核酸疫苗免疫原性免疫保护性
- 一种快速鉴定分枝杆菌的引物与方法
- 本发明属于生物检测技术领域，尤其涉及一种快速鉴定分枝杆菌的引物与方法。本发明提供的快速鉴定分枝杆菌的引物与方法可以从原始标本出发，通过提取标本中的总的细菌DNA，利用本发明提供的引物进行PCR扩增，得到Hsp65靶向基因...
- 柴海云张磊袁海明
- 文献传递
- 10株蜃楼弗朗西斯菌的鉴定与特征分析被引量：11
- 2017年
- 目的对10株蜃楼弗朗西斯菌样细菌进行菌种鉴定和特征分析。方法对环境水源及临床患者样本中分离的10株实验菌株,进行菌体形态和生长特征观察、生化表型鉴定、基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(MALDI-TOF MS)鉴定和16S rRNA测序分析。E-test方法检测菌株对各种药物的最低抑菌浓度(MIC)。结果该10株菌均为着色较淡的革兰阴性小球杆菌;尿素酶阴性、硝酸盐还原试验阴性、V因子和X因子需求试验阴性,氧化酶和触酶试验阳性;在M-H平板和麦康凯平板上不生长,血平板、巧克力平板和BCYE平板上生长迅速,可形成白色不透明型、无色透明型和灰色光滑型,直径约2 mm大小的菌落。16S rRNA基因测序显示,该10株菌与蜃楼弗朗西斯菌ATCC 25015同源性在99.6%以上,系统发育分析亦位于同一个分枝上。MALDI-TOF MS分析显示,该10株均含有6 153 m/z、5 180 m/z、7 757 m/z和9 392 m/z等特征峰,与蜃楼弗朗西斯菌ATCC 25015类似。采用Vitek 2 GN卡及NH卡、API 20NE及NH试条则可能错误鉴定为少动鞘氨醇单胞菌、灰色奈瑟菌、气味黄杆菌和嗜血杆菌等。药敏试验显示,对氯霉素、多西环素、庆大霉素、四环素、氧氟沙星和环丙沙星等均敏感。结论该10株菌可鉴定为蜃楼弗朗西斯菌,其生化反应不活泼,常规方法鉴定会发生错误,应予以重视。
- 张磊叶大柠朱焱柴海云朱庆义陈茶屈平华
- 关键词：基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱
- 基于高通量测序的平均核苷酸一致性在1株弗朗西斯菌鉴定中的应用被引量：6
- 2017年
- 目的对一溺水性肺炎患者血液标本中分离的弗朗西斯菌(编号Wenzhou1)进行菌种鉴定。方法采用Illumina二代测序平台2000/mi Seq系统对实验菌株进行高通量测序,Microbe Trakr Plus软件对测得的全基因组草图进行序列拼接。在Gen Bank数据库中,对实验菌株的16S rRNA基因、mdh基因、rpo B基因和sdh A基因序列进行NCBI BLAST分析,获得与实验菌株遗传关系接近的近缘菌种信息。Java 8运行环境,Ortho ANI软件对实验菌株和近缘菌种进行全基因组序列NCBI BLAST搜索和全基因组平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)分析。结果测得的弗朗西斯菌Wenzhou1的基因组大小为1.96×10~6bp,含74个重叠群(contigs)。基因组G+C mol%为32.1%,与其他弗朗西斯菌和另弗朗西斯菌一致。Gen Bank数据库NCBI BLAST分析结果显示,Wenzhou1的16S rRNA基因、mdh基因、rpo B基因和sdh A基因序列与西班牙弗朗西斯菌FSC454和"土拉弗朗西斯菌新凶手亚种"3523最为近缘。ANI分析显示,实验菌株Wenzhou1与西班牙弗朗西斯菌FSC454的ANI为97.8%,与"土拉弗朗西斯菌新凶手亚种"3523的ANI在97.5%~97.6%之间,而与土拉弗朗西斯菌的4个亚种的ANI在91.3%~91.5%之间。结论基于全基因组序列的ANI分析是一种准确和有效的菌种鉴定方法。Wenzhou1可明确鉴定为西班牙弗朗西斯菌。
- 张磊郑敏玲王亚柴海云邓光远朱庆义陈茶屈平华
- 关键词：菌种鉴定
