杨焕森
- 作品数：15 被引量：46H指数：4
- 供职机构：连云港市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：连云港市科技发展计划项目更多>>
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- 直饮水中分离的38株铜绿假单胞菌抗生素敏感性及24h生物膜形成能力分析被引量：3
- 2019年
- 目的了解连云港市直饮水中分离的铜绿假单胞菌抗生素敏感性和24h生物膜形成能力,探究直饮水中铜绿假单胞菌的潜在致病风险。方法对分离铜绿假单胞菌菌株,采用纸片扩散法(K-B法)进行12种抗生素敏感性测定,利用半定量粘附试验检测在96孔聚苯乙烯板上的24h生物膜形成能力。结果38株分离铜绿假单胞菌,对12种抗生素有耐药的5株(耐药率13.16%),1株为3重耐药、4株为单一耐药;其中多粘菌素B耐药率7.89%(3株),氨曲南、庆大霉素、阿米卡星、头孢吡肟耐药率均为2.63%(1株);对哌拉西林、哌拉西林/他唑巴坦、头孢他啶、环丙沙星和诺氟沙星均敏感。24h生物膜生成阳性率为65.79%。结论直饮水中铜绿假单胞菌耐药形势不容乐观,24h生物膜形成能力相对较强,需要持续关注直饮水中铜绿假单胞菌污染状况。
- 朱晓露张笑巩方文杨焕森张春道李莉
- 关键词：铜绿假单胞菌抗生素敏感性生物膜形成直饮水
- 2013—2014年连云港市流感病毒分离结果分析被引量：4
- 2015年
- 目的对2013—2014年度连云港市流行性感冒的病原学监测结果进行分析,了解连云港市流感流行动态,探索流行规律,为流感防治提供科学依据。方法采集流感样病例(ILI)的鼻咽拭子标本,用狗肾细胞(MDCK)进行病毒分离,采用血凝抑制方法(HI)进行流感病毒型别鉴定。结果 2013年4月—2014年3月共检测流感哨点医院ILI鼻咽拭子标本970份,分离到流感病毒44株,阳性分离率为4.54%,经分型鉴定新甲H1N1亚型35株(79.55%),A型H3亚型5株(11.36%),B型Yamagata亚型4株(9.10%)。结论 2013年流行的优势毒株为新甲H1N1亚型,2014年流行的优势毒株为B型Yamagata亚型,每年的3、4月份会出现流感亚型的转变。
- 于翔翔杨焕森高玉朋
- 关键词：血凝抑制试验
- 两例输入性新冠肺炎患者核酸检测结果分析
- 2021年
- 目的:对连云港市两例确诊新型冠状病(SARS-CoV-2)毒感染者的核酸检测结果进行分析,探讨新型冠状病毒患者核酸检测与病毒传染性因素的相关性。方法:对连云港市收治的两例境外输入性新冠感染病例住院期间及出院后随访核酸检测结果进行比较,回顾性分析在疾病初期诊断、治疗出院、出院后居家隔离、追踪观察过程中患者临床病例及其核酸检测结果。结果:两例患者自发病后核酸检测阳性天数明显不同,核酸检测Ct值随病程延长,数值明显升高。结论:两例患者症状严重程度不同,排毒时间长短不同,这为新冠防控提供一定的数据参考。
- 于翔翔杨焕森毛柯于其高玉朋朱晓露
- 关键词：新型冠状病毒核酸检测
- 连云港市2019年诺如病毒基因阳性双壳贝类中病毒的定量分析被引量：1
- 2023年
- 目的了解连云港市诺如病毒基因阳性双壳贝类中病毒携带量。方法选取2019年采集的双壳贝类中诺如病毒阳性标本,使用诺如病毒GI、GII质粒,采用RT-PCR检测方法,对阳性双壳贝类标本消化腺和组织进行诺如病毒基因定量检测。结果共选取48份阳性标本,诺如病毒浓度消化腺为7.94×103copies/g、单个组织为1.02×103copies/个,超标率为100.00%。不同类型贝类单个组织浓度以牡蛎科最高、蚶科最低,差异有统计学意义(H=10.24,P=0.03);不同类型贝类消化腺中浓度差异无统计学意义(H=2.56,P=0.63);不同贝类、消化腺和单个组织中GI、GII型基因浓度,仅消化腺中GI型基因浓度差异有统计学意义(H=9.05,P=0.01),其他差异均无统计学意义(H值为1.93~7.29,P值均>0.05)。不同采样时间、地区诺如病毒阳性样本消化腺中、单个组织中诺如病毒基因浓度差异均无统计学意义(H值为1.41~2.86,P值均>0.05)。结论连云港市诺如病毒基因阳性双壳贝类中诺如病毒含量水平超过人群感染剂量,具有一定的致病风险。
- 朱晓露刘彦凯徐梦朱鸿儒姚志扬徐炜杨焕森张春道
- 关键词：诺如病毒双壳贝类
- 连云港市2016-2018年流感病原学监测被引量：3
- 2019年
- 目的掌握连云港市流感发病状况,为制定防治策略提供科学依据。方法根据国家流感监测方案,每周从哨点医院采集流感样病例(ILI)咽拭子标本,通过实时荧光定量PCR方法进行流感病毒亚型鉴定,对连云港市2016-2018年的流感病例进行分析。结果2016—2018年连云港市共监测就诊病例894853例,ILI 87194例,ILI%为9.74%;各年ILI%平均值分别为11.38%、10.57%和7.95%,差异有统计学意义(χ^2=12.00,P<0.05);各年ILI年龄构成比顺位相同,由高到低分别是0~岁组(64.26%,69.16%,58.85%)、5~岁组(23.79%,22.12%,22.60%)、25~岁组(7.95%,5.64%,11.08%)、15~岁组(2.50%,1.76%,4.30%)和60~岁组(1.51%,1.32%,3.16%)。3年共检测流感样病例咽拭子3661份,检出流感病毒阳性598份,阳性率为16.33%。各年核酸检测阳性率分别为11.91%(134/1125)、21.93%(323/1473)、13.26%(141/1063),差异有统计学意义(χ^2=12.00,P<0.05)。其中,B(Yamagata)、季节性H3型、新甲型H1N1型、B(Victoria)、禽流感H7型分别占34.95%、24.75%、21.40%、18.56%和0.33%。结论2016-2018年连云港市秋冬季交替时连续出现流感流行高峰,流感病例以<15岁人群为主,应针对重点人群加强流感的监测方法与手段。
- 杨焕森于翔翔高玉朋李莉
- 关键词：流感病毒流感监测流感样病例流行病学特征
- 连云港地区2018年甲型H1N1流感病毒NA基因特征被引量：1
- 2019年
- 目的了解连云港地区2018年甲型H1N1流感病毒神经氨酸酶(NA)基因突变及抗原变异情况。方法随机提取2018年春季连云港地区分离的3株甲型H1N1流感病毒株,用RT-PCR方法对NA基因进行扩增,利用生物软件对基因序列特征及变化情况进行分析。结果 3株甲型H1N1流感病毒株的NA基因与流感疫苗株A/California/07/2009(H1N1)比对,NA区20个氨基酸位点发生变异,根据NA基因进化树分析发现,3株甲型H1N1流感毒株在同一分支上,与2017年分离到的甲型H1N1流感毒株亲缘关系近,与疫苗株A/Califonia/07/2009(H1N1)亲缘关系远。结论 2018年春季连云港地区的流感流行株相对于国际疫苗株已经出现抗原改变,对本地区流感防控工作带来更大挑战。
- 于翔翔杨焕森高玉鹏李莉张学军
- 关键词：甲型H1N1流感病毒NA基因基因特征
- 2010—2016年连云港市流感监测结果分析被引量：5
- 2019年
- 目的了解连云港市流感流行特征和优势毒株。方法通过流感监测网络,获取2010-2016年连云港市流感样病例数据、病原学监测数据和暴发疫情资料,并对流感疫情进行描述性流行病学分析。结果2010-2016年全市共报告流感样病例330 999例,占门急诊就诊总人数的4.27%,5岁以下儿童发病数最多,占报告总数的53.87%,冬春季发病风险最高;流感病毒核酸检测阳性率为14.82%,优势毒株为季H3型(占46.85%);中小学校报告流感暴发疫情20起,罹患率中位数为1.21%。结论应根据流感流行特征和优势毒株持续开展综合监测,关注流感病原学变化趋势。
- 赵跃媛营亮李海朋杨焕森许雷
- 关键词：流感流感样病例流行病学特征病原学特征
- 连云港地区甲型H1N1流感病毒HA1基因病原学特征研究
- 2021年
- 目的对连云港地区2018年—2019年甲型H1N1流感病毒表面血凝素HA1基因特征及抗原变异情况进行分析。方法对2018年—2019年连云港地区流感监测样本进行毒株分离,将分离到的6株甲型H1N1流感病毒株,用RT-PCR法对HA1基因进行扩增并测序,运用Lasergene软件包中MegAlign软件进行核苷酸以及氨基酸分析,用MEGA 6.0软件进行流感序列进化分析,并进行在线糖基化分析。结果6株连云港流感分离株与推荐疫苗株的HA1基因相比,核苷酸同源性为98.5%~99.9%,氨基酸同源性为98.9%~100%。基因树分析,6株新分离的流感病毒HA1基因分属不同的进化亚簇。进行氨基酸分析,6株HA1氨基酸序列均发生Sa区181(S→T),在Sb区202(S→T),在Cb区91(S→R)变异,1株在Sb区204(D→V)发生变异,2株在Ca2区155(H→Y)发生变异,但受体结合位点和糖基化位点的氨基酸均未发生。结论2018年—2019年在连云港地区人群中流行的甲型H1N1流感病毒与推荐疫苗株相比,基因特征发生一定改变,需要进一步加强流感监测。
- 于翔翔杨焕森高玉朋毛柯张春道
- 关键词：甲型H1N1流感病毒HA1基因
- 实时荧光定量RT-PCR、细胞培养法和鸡胚培养法在流感检测中的对比分析被引量：8
- 2015年
- 目的比较本实验室已有的3种流感病毒检测方法的差异,以确定它们在不同情形下的适用方向。方法通过实时荧光定量反转录PCR、细胞培养和鸡胚培养3种方法同时检测488份流感样病例(ILI)鼻咽拭子样本,计算出它们的灵敏度和特异度,并进行统计分析。结果实时荧光定量RT-PCR、细胞培养和鸡胚培养的阳性检测率分别为16.80%、6.76%、3.07%;相对于实时荧光定量RT-PCR,细胞培养的灵敏度为40.24%,特异度为100.00%,鸡胚培养的灵敏度为18.29%,特异度为100.00%;与细胞培养相比,鸡胚培养的灵敏度为45.45%,特异度为100.00%。结论3种方法在灵敏度方面差异很大,但在特异性上没有差异。由于实时荧光定量RT-PCR具有很高的灵敏度,并且检测速度快,适用于暴发疫情的应急检测;细胞培养和鸡胚培养作为经典的病毒分离方法,可以获得流感毒株,用来开展抗原性、基因特性和耐药性等深入研究。
- 于翔翔杨焕森高玉朋李莉张学军
- 关键词：细胞培养流感病毒
- 连云港市6例新冠感染病例样本病毒全基因组测序分析
- 2024年
- 目的应用高通量测序技术,从新冠感染病例样本中直接测定新冠病毒基因组,获得全基因组序列,分析基因组特征和变异情况,进行分子溯源。方法采用Illumina iSeq100二代测序平台对连云港市6例不同时期新冠感染确诊病例的呼吸道样本进行全基因组测序,运用多种在线病毒变异分析平台分析病毒基因变异情况,用CLC、MEGA等多种生物信息学软件分析病毒全基因组序列,并结合病例的流行病学资料,推断病毒的来源。结果成功从6份样本中获得29873~29903 bp长度的基因组序列,基因组覆盖度91.0%~100.0%,与Wuhan/WH01/2019株相比,分别检出28、56、82、75、78、79个核苷酸位点突变,涉及19、40、62、52、56、57处氨基酸变异,非同义突变占比分别为67.9%(19/28)、71.4%(40/56)、75.6%(62/82)、69.3%(52/75)、71.8%(56/78)、72.1%(57/79)。进化分析显示,6份样本分属于B.1.351(LYG20210406)、AY.42(LYG20210723)、BA.2.3(LYG20220312)、BA.2.2.1(LYG20220709)、BA.2.76(LYG20220825)、BA.5.2(LYG20221006)进化分支,LYG20210406与菲律宾流行株密切相关,LYG20210723、LYG20220312、LYG20220709、LYG20220825和LYG20221006与同时期国际流行新冠株基因组序列相似性高,与各自流行病学调查结果一致。结论本研究中的二代测序方法和数据分析流程可用于新冠病毒的变异分析和分子溯源,在地市疾控应用前景好,对新冠疫情防控具有重要意义。
- 于翔翔杨焕森史进军汤冬阳李续炎尹笑笑王一力
- 关键词：新型冠状病毒高通量测序进化分析
