曹孟婵
- 作品数：8 被引量：36H指数：4
- 供职机构：安庆市疾病预防控制中心更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 诺如病毒GII.17和GI.3基因型引起急性胃肠炎疫情的病原分析被引量：5
- 2017年
- 目的对安庆市某中学暴发的急性胃肠炎疫情进行病原鉴定,并进一步对部分基因序列测序分析,以确定其基因亚型。方法对采集的13份肛拭子,3份生活饮用水标本,采用实时荧光定量RT-PCR方法进行诺如病毒GI/GII型检测,对阳性标本的病毒VP1区部分核酸序列测序和基因库数据比对,并采用MAGA5.0软件构建进化树。结果在13份肛拭子样本7份诺如病毒阳性中,6份属于GI.3型,1份属于GII.17型;3份生活饮用水样本GI.3和GII.17型均有检出。结论该起疫情由诺如病毒感染引起,为GI.3和GII.17基因亚型。
- 刘敏鸿曹孟婵金爱武孙永李贤湘徐四清
- 关键词：诺如病毒急性胃肠炎暴发疫情基因亚型
- 人腺病毒7型引起的呼吸道感染疫情病原分子生物学分析被引量：3
- 2019年
- 目的对安庆市某部队一起人腺病毒7型引起的急性呼吸道感染暴发疫情进行病原学鉴定,并对其六邻体(Hexon)基因进行测序分析。方法采取Real-time PCR对采集的13份咽拭子标本进行腺病毒核酸检测,阳性标本接种Hep-2细胞进行病毒分离培养。收集阳性分离培养物,采用RT-PCR扩增Hexon的核苷酸序列进行测序,获得序列在NCBI GenBank数据库进行同源比对,MAGE6.0软件进行进化分析、构建进化树。结果获得10份阳性毒株培养物,Hexon基因序列与我国武汉7型腺病毒疫情株Z9/WH/CHN/2015(GenBank号为KX897164)100%同源,与2012AQHAdv7疫情株和2015AQHAdv7散发株100%同源性。结论该起疫情由人腺病毒7型感染引起,安庆地区流行的腺病毒疫情株基因型别稳定,此次的疫情可能源于本地的流行株。
- 曹孟婵孙永徐四清李贤相刘敏鸿
- 关键词：人腺病毒基因序列急性呼吸道感染进化分析
- GⅡ.17型诺如病毒流行概况及分子进化特征研究进展被引量：7
- 2018年
- GⅡ.P17_GⅡ.17诺如病毒株是2014—2015年亚洲出现的变异株,其导致的疾病,在发病规模、感染人数、发病程度等方面,均盛于诺如病毒流行株GⅡ.4。虽是新毒株,但近年来,利用自组装病毒样颗粒蛋白(VLPs)系统对诺如病毒GⅡ.P17_GⅡ.17的研究比较多,包括病毒衣壳蛋白结构、受体结构、进化机制等方面。这些研究为诺如病毒引起的急性腹泻等相关疾病的预防控制和疫苗研制奠定了良好的理论基础。
- 曹孟婵李贤相何军
- 关键词：诺如病毒分子进化
- 一起水源性诺如病毒引起的急性胃肠炎疫情的调查分析被引量：13
- 2016年
- 目的通过对怀宁县一起以诺如病毒感染引起的急性胃肠炎暴发疫情调查分析,探讨疫情暴发的原因和流行病学特征,为制定防控措施提供科学依据。方法制定病例定义,开展病例搜索进行流行病学调查,采集病例及有关标本检测,调查疫情暴发危险因素等。结果本次疫情累计发病99例,持续时间11d,发病曲线呈单峰带拖尾,发病集中在3月1日至2日,示点源暴露,3月3日以后仍有少量病例不排除因接触传播出现二、三代病例;男性罹患率为0.39%,女性罹患率为0.32%,发病年龄、性别均无显著差异;各村发病率不同,存在统计学差异(χ2=72.469,P<0.01),管网距离自来水厂越近罹患率越高;饮用该镇水厂自来水人群罹患率0.81%,饮用其它水源人群罹患率0.03%,不同水源人群发病差异有显著性(RR=26.238,χ2=114.692,P<0.01)。采取病例28份粪便、肛拭子和呕吐物标本中27份诺如病毒核酸阳性,阳性率为96.43%;基因序列分析为诺如病毒GⅡ.17型。结论本次疫情为一起因自来水受到污染,诺如病毒GⅡ.17型引起的急性胃肠炎暴发疫情,农村地区乡镇自来水厂水源水选址不当、缺乏保护,一旦出现大雨则易造成水源水污染,加之基层自来水厂监管不力是该类事件的危险因素。
- 汪金生孙琴曹孟婵李贤相史永林金爱武
- 关键词：急性胃肠炎诺如病毒
- 2013—2015年安庆地区腺病毒流行株型别鉴定及六邻体基因特征分析被引量：2
- 2018年
- 目的 了解引起安庆地区急性呼吸道感染的人类腺病毒( HAdv)流行株型别特点及编码六邻体蛋白基因及氨基酸残基的变异情况.方法 收集2013—2015年间流感监测哨点596份急性呼吸道感染患儿咽拭子,real-time PCR腺病毒核酸检测试剂盒进行检测,阳性标本进行Hep细胞病毒分离,对病毒分离成功样本进行六邻体蛋白基因( hexon gene) PCR扩增、测序并将序列与Gen-Bank发表的序列进行同源比对和进化树分析.结果 HAdv阳性标本68份,阳性率为11. 4% .病毒分离成功34株,其中,HAdv-3型为9株占26. 5% ;HAdv-7型为12株占35. 3% ;HAdv-14型为12株占35. 3% ;HAdv-55型为1株占2. 9% . 9株HAdv-3型分离株与KX384958亲缘关系最近,为99. 8% ~100% ,与其他株相比较氨基酸残基的变异主要有 3 个;12 株 HAdv-7 型分离株与 KX897164 和KU361344亲缘关系最近,为99. 8% ~100% ,与其他株相比较氨基酸残基的变异主要有7 个;12 株HAdv-14型分离株与JF420883亲缘关系最近,为99. 6% ~99. 9% ,与其他株相比较氨基酸残基的变异主要有3个;1株HAdv-55型分离株与KP279748和KX289874亲缘关系较近,核苷酸和氨基酸的同源性为100% .在这几个型别的研究株中HAdv-7 型变异最大,其次为 HAdv-14 型.结论 2013—2015年,引起安庆地区急性呼吸道感染的腺病毒流行株主要为HAdv-3型、HAdv-7型、HAdv-14型,同时存在少量HAdv-55型. HAdv-55型分离株六邻体基因稳定,没有出现变异.而HAdv-3型、HAdv-7型、HAdv-14型型别之间,核苷酸和氨基酸均发生不同程度的变异.在抗原决定簇HVR1、HVR2 和HVR7区存在氨基酸的变异.
- 曹孟婵何军李贤相徐四清
- 关键词：急性呼吸道感染腺病毒
- 安庆市呼吸道感染疫情人腺病毒的病原分析被引量：2
- 2015年
- 目的对一起呼吸道感染疫情人腺病毒进行病原鉴定。方法将4株腺病毒核酸阳性患者标本接种于Hep-2细胞进行培养,利用产生病变的细胞提取核酸DNA,PCR扩增六邻体蛋白基因,对扩增的产物进行测序,并通过BLastn序列分析以确定其型别。结果 4株腺病毒毒株六邻体蛋白基因PCR产物测序和Blastn分析结果证明该腺病毒与人7型腺病毒同源性为最高,大于99%。结论本研究从患者标本中分离到的病毒毒株为腺病毒7型。
- 曹孟婵刘敏鸿汪金生李贤相徐四清张其威
- 关键词：腺病毒同源性
- 2017年安庆市急性胃肠炎暴发疫情病原体诺如病毒的鉴定及基因特征分析被引量：6
- 2018年
- 目的对安徽省安庆市2017年2-3月间发生的10起急性胃肠炎暴发疫情病原诺和病毒进行鉴定及基因分型。方法采集聚集性和暴发疫情中有胃肠炎症状者的肛拭子标本,采用实时荧光定量RT-PCR检测诺如病毒(NoV)核酸,使用RT-PCR对核酸阳性标本扩增NoV衣壳区-聚合酶区,选取27份琼脂糖电泳条带清晰的阳性标本进行基因测序及型别鉴定,并与国内外参考株序列构建进化树,进行遗传进化分析。结果 10起胃肠炎暴发疫情中共采集103份肛拭子标本,实时荧光定量RT-PCR检测诺如病毒核酸阳性41份,且均为GII型,阳性率为39.81%。选取27份阳性标本测序,其中20份测序成功,进化分析显示19条序列为NoV GII.P16/GII.2,1条序列为NoV GII.P17/GII.17。结论诺如病毒GII.P16/GII.2是安庆市2017年2-3月份急性胃肠炎暴发疫情的主要病原体。
- 刘敏鸿金爱武曹孟婵史永林李贤相徐四清
- 关键词：诺如病毒进化分析
- 1例人感染腺病毒55型病原体的分离鉴定及进化分析被引量：1
- 2018年
- 目的对1例人感染腺病毒55型病原体进行分离鉴定及进化分析。方法选取2015年5月安庆市某流感监测哨点医院采集的一例被诊断为急性上呼吸道感染患者的咽拭子标本作为研究样本，提取标本总核酸，采用人腺病毒通用引物进行real—time荧光定量PCR检测。将检出的阳性标本感染Hep－2细胞进行病毒分离。对成功分离的腺病毒毒株进行六邻体基因的扩增、纯化并测序。测序结果提交GeneBank上Blast，同源分析确定型别、制作系统进化树以及分析六邻体基因和氨基酸序列。结果对咽拭子标本中的病毒核酸进行荧光定量PCR检测，结果显示，腺病毒核酸DNA检测呈阳性（Ct〈24）。同源比对结果显示，该株的六邻体（Hexon）基因与辽宁株、江苏株、河北株、山西株、安庆株（GenBank号分别为KP896483、KX289874、KP896478、FJ643676、KP279748）的同源性可达100％，与安徽株（KC551973）可达99．96％，存在一个核苷酸C→T的无义突变。进一步的分析显示，该株与参考株在系统发生树上处于同一进化分支，Hexon蛋白氨基酸的同源性为100％。结论此ADR标本由人腺病毒55型感染引起，其Hexon蛋白氨基酸没有出现变异。
- 曹孟婵张其威金爱武刘敏鸿李贤相徐四清
- 关键词：人腺病毒流感进化分析
