康宏宇
- 作品数：16 被引量：51H指数：5
- 供职机构：中国医学科学院北京协和医学院医学信息研究所更多>>
- 发文基金：中央级公益性科研院所基本科研业务费专项中央高校基本科研业务费专项资金国家社会科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生文化科学生物学自动化与计算机技术更多>>
- 面向精准医学的基因突变数据分类与融合研究被引量：1
- 2018年
- 目的:通过调研现有的基因突变数据标准,包括分类标准、命名标准以及组织标准,制定一套整合式的基因突变数据分类体系以融合多来源异构的突变数据。方法:从Clin Var和COSMIC突变数据库中获取基因突变数据,根据数据特征对基因突变数据进行标准化融合。通过与已制定的分类体系进行映射,对融合后的基因突变数据进行标准化分类注释。结果:构建的基因突变分类体系包括术语34条,突变数据库包括突变概念746 504个,突变术语1 083 397个。结论:基因突变数据分类体系可提供一种有效的基因突变数据分类和突变数据整合方案,对推动突变数据的融合、标准化与共享和疾病的精准治疗具有重要意义。
- 吴萌李姣康宏宇侯丽
- 关键词：基因突变数据融合
- 临床药理学知识模型构建研究被引量：1
- 2018年
- 分析临床药理学知识表示与模型研究现状,阐述临床药理学知识模型构建技术路线、知识来源、模型框架和具体方法,以非小细胞肺癌为例介绍模型应用并对可行性进行验证,最后提出不足并展望未来发展方向。
- 沈柳侯丽康宏宇吴萌郑思李姣
- 关键词：临床药理学知识模型非小细胞肺癌
- 生物医学文献的知识发现与数据整合被引量：6
- 2015年
- 通过整合生物医学文献与科学数据,创建数据和文献能够交互操作的开放式环境,充分发现生命科学领域新的知识,已经成为当前数据密集型科学发现的研究热点之一。系统分析和阐述了国内外生物医学文献挖掘与科学数据整合领域的整合方式和研究内容,调研了不同整合方式的对应系统,展望了生物医学文献与科学数据整合领域的发展趋势。
- 康宏宇李姣
- 关键词：生物医学科学数据数据整合
- 精准医学研究相关信息资源的发现与汇聚被引量：5
- 2017年
- 根据美国和英国的精准医学科学数据,整合该领域的前沿资讯、研究进展、企业动态等资源,制定统一的科学数据元数据标准和资讯类元数据标准,实现相应数据的解析、存储和自动更新,为从事精准医学研究的临床医生、科技人员以及决策者等提供综合性、集成化和多元化的精准医学知识服务。
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- 关键词：资源发现信息整合知识服务科学数据
- 黑色素瘤单病种本体构建研究
- 2021年
- 利用百科知识、临床指南、科技文献、专家经验等多源异构资源进行本体顶层范畴界定,借助Ontofox、Protégé等本体工具采集并组织黑色素瘤疾病、分子异常、症状、解剖结构、药物、干预与操作、并发症等顶层范畴的概念和术语,构建黑色素瘤单病种本体并对其评估,开发本体展示和检索工具,为相关领域研究提供参考。
- 康宏宇李勤李勤吴萌李姣李姣
- 关键词：单病种黑色素瘤本体构建知识检索
- 基于多特征融合的药物疾病关联预测模型构建
- 2023年
- 构建基于药物多特征融合的药物疾病关联预测模型,为药物知识发现提供新思路。借助药物的化学结构、药物-副作用关联、药物-靶标关联的3个特征,构建融合的药物综合相似度及基于MeSH的疾病语义相似度特征表示方法。利用图卷积神经网络模型抽取药物-疾病图数据特征信息,构建基于多特征融合的药物疾病关联预测模型(MFFGCN),进而实现未知的药物疾病关联发现。利用269种药物、598种疾病及其之间的18416种关联关系,对药物疾病存在的未知关联进行预测,借助AUC、AUPR、准确率、灵敏度、召回率、F1等多个评价指标进行评价。结果表明,多特征融合的药物疾病关联预测方法的AUC指标为0.8662,较单一特征的平均预测指标最大相对提升为2.48%,较4种代表性基线方法的指标最大相对提升为1.67%;AUPR指标为0.3412,较单一特征预测结果最大相对提升为1.67%,较4种代表性基线方法提升27.49%。对预测结果中药物-疾病预测关联得分中排名前10的组合及阿霉素为例的单一药物预测组合进行文献研究验证、临床治疗验证,同样证明MFFGCN在未知的药物疾病关联预测上表现良好,能有效地发现药物的新适应症,为药物重定位提供方法借鉴和理论依据。
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- 关键词：多特征融合药物疾病
- 医学图书馆公众健康知识服务平台的构建与应用实践被引量：20
- 2018年
- 随着公众对健康知识需求的日益迫切,搭建面向公众需求的健康知识服务平台尤为重要,本文旨在构建符合公众需求的中文健康知识服务平台,通过网络调查,明确国内健康知识服务平台的问题,确定国际健康知识服务平台可借鉴的地方。通过问卷分析,获取公众对健康信息的关注点,包括:公众获取健康信息的动机、公众对网络健康信息可信性的认知、公众对健康信息需求类型等方面。据此展开公众健康知识服务平台的设计与开发,从数据层、业务层与表示层三个维度进行平台的构建与开发,设计知识库类型与数据更新机制,开展知识加工与关联标注,进而实现多维知识导航服务、跨知识库的集成服务以及知识动态关联服务。结合平台用户日志数据的统计分析,对平台服务效果及公众在疾病、药物、医院等主题方面的关注点进行了系统阐释。
- 侯丽康宏宇钱庆
- 关键词：公众健康健康信息需求日志数据知识服务知识关联
- 新型冠状病毒肺炎防控专题服务构建研究被引量：1
- 2020年
- 详细阐述基于资源聚合与可视化分析技术的新型冠状病毒肺炎防控专题构建方案,包括需求分析、模块设计、架构搭建、数据采集与处理、可视化分析、功能开发与实现等流程,为社会公众、科研人员、领域决策者等提供权威、全面、及时的新冠肺炎综合知识服务。
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- 关键词：可视化分析
- 一种药物基因组学知识图谱构建方法及系统
- 本发明公开了一种药物基因组学知识图谱构建方法及系统，该方法包括：获取与药物基因组学相匹配的初始数据信息；对所述初始数据信息进行数据抽取处理，获得目标数据信息；根据所述目标数据信息，确定分析维度以及所述分析维度之间的关联关...
- 李姣侯丽康宏宇
- 文献传递
- 抗癌药物基因组学知识表示模型构建被引量：1
- 2019年
- 目的:通过构建抗癌药物基因组学知识表示模型,丰富药物、基因、疾病以及个性化用药等之间的语义关系,为临床医生精准用药、联合用药等提供参考依据,为药学科研人员开展新药研发、老药新用等研究提供理论支持,为癌症患者查询药物知识提供服务支撑。方法:对DrugBank、RxNorm、FDA药品说明书等药物基因组数据进行整合和抽取,在通用药物基因组学知识表示模型的基础上,涵盖药物、基因、疾病3个基本维度,并拓展个性化用药、药物副作用等知识维度,设计知识表示框架,确立相关实体类型,发现和定义实体与实体之间的语义关系。在构建好的抗癌药物基因组学知识表示模型的基础上,以黑色素瘤相关药物为例,对知识表示模型进行填充,并对实体和实体间语义关系进行可视化表达。结果:实现了药物、基因、疾病、个性化用药、药物副作用5类实体的概念抽取,定义了实体间的15种语义关系,构建了黑色素瘤药物基因组学相关的136个知识三元组。结论:面向抗癌药物精准用药的药物基因组学知识表示模型可以确定癌症用药与基因突变、人群、药物副作用之间的关联和推动药物基因组学知识在临床研究中的应用。
- 康宏宇李姣吴萌侯丽
- 关键词：药物基因组学知识模型信息整合抗癌药物知识抽取知识整合
