焦振彬
- 作品数：3 被引量：9H指数：2
- 供职机构：河南农业大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：河南省教育厅自然科学基金国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 香椿(Toona sinensis)微卫星富集文库构建及特性分析被引量：4
- 2015年
- 采用Dynal磁珠富集法构建了香椿微卫星富集文库,通过测序结果对文库的特性进行了分析。实验使用改良CTAB法提取香椿基因组DNA,用（AC）8、（AG）8和（ATG）123种带有生物素标记的探针与香椿基因组DNA的酶切片段进行杂交,将磁珠捕获的含有微卫星序列的DNA片段插入p MD 18-T载体,并转入感受态细胞Trans 5α构建克隆,经筛选后得到含356个克隆的香椿基因组微卫星富集文库。从富集文库中挑选插入片段长度为400-800 bp的128个克隆进行测序,其中含有SSR的序列77条,得率达60.16%,其中完美型占82.69%,非完美型8.65%,混合型8.65%。上述结果为SSR位点的进一步开发奠定了基础。
- 裴宋雨任志勇焦振彬程月琴王红卫
- 关键词：香椿微卫星磁珠富集文库
- 地黄微卫星富集文库构建及特性分析被引量：5
- 2013年
- 应用Dynal磁珠-生物素标记的微卫星探针(AC)8,(AG)8和(ATG)12与地黄基因组DNA酶切片段杂交,捕获含有微卫星序列的DNA片段,连接到pMD 18-T载体上,转入感受态细胞Trans 5α,构建地黄富集微卫星文库。利用M 13 F和M 13 R载体序列引物筛选文库,对插入片段长度为400～800 bp的克隆进行测序。共获得96条序列,48条(50%)含有微卫星位点,其中完美型占66%,非完美型22%,混合型12%。微卫星重复基元中,二核苷酸(AG)n和三核苷酸(CAT)n最为常见。
- 程月琴焦振彬张佩叶永忠王红卫
- 关键词：地黄微卫星磁珠富集文库
- 磁珠富集法构建播娘蒿SSR文库及特性分析
- 2014年
- 为构建播娘蒿SSR文库，通过Dynal磁珠富集法富集生物素标记的（AC）8，（AG）8和（ATG）12探针与播娘蒿基因组的酶切片段杂交的片段，捕获含有SSR位点的DNA序列，连接到pMD18-T载体上，并转入感受态细胞DH5d，共获得778个克隆．挑选阳性克隆，利用SuperSNX24一F引物对茵液克隆进行PCR检测．利用M13F，M13R载体引物和探针结合的方法对文库进行2次筛选，获得93个长度为400～1000bp的克隆并测序．结果表明，82条序列舍有SSR位点，占测序条数的88．17％．共有SSR位点数127个．其中完全型SSR位点102个，不完全型SSR位点10个．混合型SSR位点15个，分别占SSR位点总数的80．31％，7．87％，11．81％．SSR重复基元中，以二核苷酸（CT）n，（AC）n，（GT）n，三核苷酸（GAT）n最为常见，得率分别为20．47％，26．77％，21．26％和15．75％．
- 王亚平焦振彬裴宋雨叶永忠王红卫
- 关键词：播娘蒿磁珠富集法
