您的位置： 专家智库 > >

宋培兵

作品数：7 被引量：23H指数：4
供职机构：曲靖师范学院更多>>
发文基金：国家自然科学基金国家级大学生创新创业训练计划云南省教育厅科学研究基金更多>>
相关领域：农业科学环境科学与工程更多>>

合作作者

文献类型

  • 7篇中文期刊文章

领域

  • 6篇农业科学
  • 1篇环境科学与工...

主题

  • 5篇生物信息
  • 5篇生物信息学
  • 4篇生物信息学分...
  • 4篇甜蛋白
  • 2篇桑树
  • 2篇紫茎泽兰
  • 2篇系统进化
  • 2篇密码子
  • 2篇密码子偏性
  • 2篇进化
  • 1篇氮素
  • 1篇氮素水平
  • 1篇蛋白基因
  • 1篇豆类
  • 1篇植物修复
  • 1篇致敏原
  • 1篇入侵
  • 1篇树类
  • 1篇甜蛋白基因
  • 1篇土壤

机构

  • 7篇曲靖师范学院

作者

  • 7篇韩利红
  • 7篇刘潮
  • 7篇宋培兵
  • 6篇唐利洲
  • 4篇王海波

传媒

  • 2篇江苏农业科学
  • 2篇江苏农业学报
  • 1篇北方园艺
  • 1篇中国蔬菜
  • 1篇热带作物学报

年份

  • 4篇2018
  • 3篇2017
共 7 条 记 录，以下是 1-7
全选 清除 导出
排序方式：
桑树潜在致敏原鉴定与生物信息学分析
2018年
致敏原是能引发Ⅰ型过敏反应的抗原性物质,桑树的花粉和果实均能引起人的过敏反应。为了解桑树的潜在致敏原信息,以报道的致敏原为探针,搜索桑树蛋白数据库,获得桑树潜在致敏原信息,并对其家族分布、结构和功能进行分析。结果显示,共获得143条桑树的潜在致敏原蛋白,它们分属于71个不同的基因本体(gene ontology,简称GO)注释子条目和49个pfam家族,且其结构和功能各不相同。其中多个成员属于常见的致敏家族,如Bet v 1家族、Profilin家族、Thaumatin家族、Rlp A-like_DPBB家族,与已鉴定的致敏原具有较高的序列一致性和相似的三级结构。研究结果有助于过敏症的临床诊断和交叉反应的预警。
刘潮韩利红宋培兵张亚萍唐利洲
关键词：致敏原桑树过敏反应生物信息学
桑树类甜蛋白家族鉴定与生物信息学分析被引量：4
2017年
为了全面分析桑树类甜蛋白家族基因特征,从桑树全基因组中鉴定类甜蛋白家族(Thaumatin-like protein,TLP)基因,并对基因结构和组成、蛋白质结构域和系统进化以及密码子使用特性进行分析。通过研究,筛选并鉴定了25个桑树TLP家族成员。多数具有典型的索马甜家族标签和保守氨基酸残基。基因结构分析结果表明,12个TLP基因家族成员含有1个内含子,10个成员含有2个内含子,且内含子相位较保守。系统进化分析结果显示,桑树TLP分为8个聚类组,组内序列一致性较高。密码子偏性分析结果显示,桑树TLP家族基因密码子第3位的核苷酸使用偏性较弱,多数基因的进化主要是由碱基随机突变造成的,属于低表达基因,少数基因受自然选择压力影响,基因表达水平较高,在植物响应环境胁迫中发挥作用。
刘潮韩利红宋培兵王德琴袁国芳王海波唐利洲
关键词：桑树系统进化密码子偏性
胡萝卜类甜蛋白家族鉴定与生物信息学分析被引量：7
2017年
为了全面了解胡萝卜基因组中类甜蛋白家族基因结构和蛋白功能,利用胡萝卜基因组数据库,通过生物信息学方法对筛选的32个胡萝卜类甜蛋白家族成员进行鉴定、聚类及结构功能分析。结果表明:胡萝卜类甜蛋白家族基因分布在8条染色体上,该家族蛋白保守性较强。系统发育分析显示,胡萝卜类甜蛋白家族属于10个进化组,其中进化组5中的基因主要来自1号染色体,该组成员具有抑菌潜力,值得深入研究。
刘潮韩利红王海波宋培兵唐利洲
关键词：胡萝卜系统进化生物信息学
土壤微生物对紫茎泽兰与我国西南当地植物生长的影响被引量：4
2018年
设置土壤灭菌、添加杀真菌剂和对照3种处理,采用盆栽法研究紫茎泽兰群落下土壤微生物对紫茎泽兰和3种我国西南地区当地植物生长的反馈效应。单种和混种均显示,灭菌处理下紫茎泽兰和我国西南当地植物的相对生长率和生物量整体较低,添加杀真菌剂处理紫茎泽兰和我国西南当地植物的相对生长率和生物量整体较高,说明土壤中的微生物类群能促进植物的生长。在对照处理下,与拔毒散混种的紫茎泽兰生物量较小,说明土壤微生物不利于紫茎泽兰对拔毒散的竞争。在添加杀真菌剂处理下,与马唐混种的紫茎泽兰生物量高于其他处理;在对照处理下,混种中马唐生物量显著低于其他处理,说明土壤微生物可促进紫茎泽兰对马唐的竞争。在紫茎泽兰的防治工作中,可考虑将拔毒散选作入侵地的替代植物。
刘潮韩利红宋培兵张亚萍
关键词：微生物紫茎泽兰入侵灭菌土壤
不同氮素水平对重金属胁迫下紫茎泽兰生长及重金属吸收的影响被引量：4
2018年
以紫茎泽兰为对象,采用水培法研究无氮、低氮、中氮、高氮4个氮素水平对Pb、Zn、Cu、Cd等4种重金属胁迫条件下紫茎泽兰生长和重金属吸收的影响。结果表明:低氮水平下,紫茎泽兰多数生长参数显著高于其他试验组;中氮水平下,紫茎泽兰POD、CAT、可溶性蛋白、可溶性糖、脯胺酸和叶绿素含量显著较高。低氮水平有利于紫茎泽兰根、茎和叶器官对Pb、Zn和Cd的吸收,试验组紫茎泽兰根器官中Pb、Zn和Cd累积量显著高于茎和叶。说明紫茎泽兰对重金属胁迫具有一定的抗逆性,低氮、中氮水平提高了紫茎泽兰对重金属的耐受性和吸收能力。可考虑将紫茎泽兰用于重金属污染的生态修复。
刘潮宋培兵张亚萍李强韩利红丁雪梅唐利洲
关键词：紫茎泽兰氮素水平重金属植物修复
辣椒类甜蛋白基因家族鉴定及表达分析被引量：6
2018年
为了在全基因组水平上了解辣椒类甜蛋白基因(TLP)家族特征,本研究通过生物信息学方法,利用辣椒基因组数据库,对筛选的28个辣椒TLP家族成员进行鉴定,对结构功能、聚类及时空表达进行分析。结果表明,辣椒TLP家族基因主要分为4种结构类型,基因分布在9条染色体上。系统发育分析结果显示,辣椒TLP家族基因属于8个聚类组,其中成员最多的聚类组5中的基因主要来自1号染色体。基因启动子区顺式作用元件分析发现多个激素响应元件、生物/非生物响应元件。时空表达分析结果表明,多数辣椒TLP家族基因在各器官和果实发育的各阶段均有较高表达,各成员在时空表达上具有器官特异性。本研究为辣椒TLP家族基因的克隆及其在植物生长及对抗胁迫方面的研究奠定了基础。
刘潮韩利红宋培兵王德琴王海波唐利洲
关键词：辣椒生物信息学
绿豆类甜蛋白家族鉴定与生物信息学分析被引量：3
2017年
为了解全基因组水平上绿豆类甜蛋白家族基本生物学特征,通过生物信息学手段,鉴定绿豆类甜蛋白家族成员,并对基因和蛋白结构及染色体定位进行了分析,为进一步克隆绿豆类甜蛋白基因以及探讨其抗真菌活性奠定基础。结果表明:共鉴定出34个绿豆类甜蛋白家族成员,基因主要有4种结构类型,分布在除4号和9号染色体外的其余9条染色体中。该家族蛋白功能主要构成细胞结构组分和参与细胞生物学进程。系统发育分析显示,绿豆类甜蛋白家族归属10个聚类组,其中成员较多的聚类组6和聚类组7中的基因主要来自11号染色体,其中7个基因簇中的基因存在紧密连锁现象,属于旁系同源基因,可能发生了染色体内复制。密码子使用性分析显示,绿豆TLP家族基因偏好A或T作为第三位密码子,但密码子使用总体偏性不强,多数属于低表达基因,多数基因进化受碱基突变和正向选择压力的双重影响。
刘潮韩利红王海波宋培兵唐利洲
关键词：绿豆密码子偏性生物信息学
全选 清除 导出
共1页<1>
聚类工具0