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排序方式：

用于高通量测序的基因组靶序列捕获方法的建立被引量：2: 2010年; 文章旨在建立一种基因组目标靶序列捕捉文库的方法,并结合第二代测序技术,以实现候选基因区段的深度测序。利用Agilent公司的eArray在线平台,对1250个基因的11824个外显子共2414977bp的基因组序列进行120个碱基长度的捕捉探针(钓饵)设计,并制备成SureSelect液相靶序列捕获试剂。选用2例人基因组DNA,超声打断后末端补平并磷酸化,连接SOLiD接头,回收150bp～200bp的DNA片段,与靶序列探针杂交捕获目标序列,油包水微乳滴PCR扩增后,磁珠分离富集,上SOLiD测序系统通过工作流程分析(WFA)进行文库质量的评价,或正式测序反应。结果显示对所包含的11147个基因外显子片段设计出并合成了46509个捕捉探针,制备成SureSelect试剂盒。探针可有效地捕捉并富集基因组DNA的目标靶片段,定量PCR显示富集效率可达29倍。WFA分析表明文库可以在SOLiD仪器进行正式测序。测序结果显示靶序列区域的测序数占有效总测序数的比例达到70%,覆盖率均在200×以上。结果表明本研究所建立的SureSelect基因组靶序列捕捉、富集建立测序文库的技术路线可行,可直接用于SOLiD测序仪的测序。; 陈丹张雯朱智东黄银王平周贝贝杨晓楠肖华胜张庆华

胃癌中DNA拷贝数、mRNA和microRNA表达谱变异的研究: 目的:利用高通量生物芯片技术,通过对胃癌中DNA拷贝数、mRNA和microRNA表达谱三个不同层次变异的整合分析,以期发现新的与胃癌诊断和分型、预后和治疗相关的分子标志物,为后续深入了解胃癌发生、发展过程奠定基础。; 程磊阳圣杨燕青张雯陈丹张庆华; 文献传递

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陈丹