李天恩
- 作品数：3 被引量：3H指数：1
- 供职机构：中南民族大学药学院更多>>
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- 大肠杆菌MurD抑制剂的分子对接与3D-QSAR研究被引量：1
- 2018年
- UDP-N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸-D-谷氨酸连接酶(MurD)在细胞质中催化D-谷氨酸(D-Glu)和UDP-N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸(UDP-MurNAc-L-Ala)之间的酰胺键形成UDP-N-乙酰胞壁酰-L-丙氨酸-D-谷氨酸(UDP-MurNAc-L-Ala-DGlu).由于MurD对D型氨基酸表现出非常高的特异性,使得它被认为是发现选择性抗菌剂的新靶标之一.通过利用从相关文献中获取的31个大肠杆菌MurD抑制剂建立3D-QSAR预测模型.以分子对接获得的打分较高的活性构象为模版,对选择的分子进行叠合,从中随机选择26个化合物作为训练集建立比较分子场分析(CoMFA)模型,该模型的去一交叉验证(LOO)相关系数q^2=0.515(CoMFA).剩余的5个化合物组成测试集以验证模型的预测性能,相应的相关系数R2press=0.701 8(CoMFA).结果表明建立的CoMFA模型具有较好的预测能力,研究结果将为今后的MurD抑制剂设计和开发提供参考信息.
- 李天恩马建覃初新戴康
- 关键词：分子对接COMFA
- 3,5-吡唑烷二酮衍生物与大肠杆菌MurB酶的分子对接研究
- 2017年
- 指出了MurB酶是细菌合成细胞壁的重要的合成酶,可以作为抗菌药物的新的靶点。为了开发新的MurB酶的抑制剂,选取了16个3,5-吡唑烷二酮衍生物作为配体,应用计算机辅助药物设计技术,对靶标MurB酶进行了分子对接分析。结果显示:16个化合物和MurB酶都有较强的结合,其中12个化合物的对接打分函数超过了对照已知抑制剂;化合物中的3,5-吡唑烷二酮的结构能够和MurB酶形成较强的氢键连接;而且分子中的芳基取代基也能够和MurB酶形成疏水性结合。
- 覃初新李天恩戴康
- 关键词：肽聚糖分子对接
- 大肠杆菌DXS酶抑制剂的3D-QSAR研究被引量：2
- 2019年
- 利用分子对接和叠合构象,在SYBYL软件中运用CoMFA和CoMSIA方法,成功建立了DXS酶抑制剂的3D-QSAR预测模型,其相关参数(CoMFA:q^2=0.617,R^2=0.998,rpred^2=0.640;COMSIA:q^2=0.505,R^2=0.990,rpred^2=0.668,其中q^2为交叉验证系数,R和rpred为检验模型预测能力的相关系数)均证明模型具有较好的预测能力.该模型研究了DXS抑制剂的三维构效关系,其结构方面的信息有助于研发新的DXS抑制剂.
- 戴康马建李天恩吴吉祥谭宏飞
- 关键词：三维定量构效关系
