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刘文丽: 作品数：17 被引量：13H指数：2; 供职机构：北京市理化分析测试中心更多>>; 发文基金：国家高技术研究发展计划国家自然科学基金国家科技重大专项更多>>; 相关领域：医药卫生生物学文化科学政治法律更多>>

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利用宏基因组测序分析一起食蟹猴致死因素: 2016年; 为分析死亡食蟹猴脑组织菌群结构情况,初步探索细菌对食蟹猴的致死因素,本研究按照标准化操作流程收集死亡食蟹猴的大脑、小脑病理组织样本,提取样本中全部细菌总DNA,利用通用引物27F/338R PCR扩增细菌16S rDNA V1-V2高变区。扩增产物经高通量测序,并利用QIIME软件对测序数据进行生物信息学分析。结果显示,测序共生成238 Mbp原始数据,获得脑组织细菌的结构组成,其中优势菌门包括厚壁菌门、拟杆菌门和变形菌门,优势菌科包括普雷沃氏菌科、瘤胃菌科、鞘氨醇单胞菌科等,含量最高的细菌属为普雷沃菌属、螺旋体属、交替假单胞菌属等。本研究结果表明死亡食蟹猴的脑组织中含有多种细菌,可能会引起感染和炎症,结合病理学检查,提示食蟹猴脑组织病原菌感染可能与死亡的发生存在一定关联。; 刘文丽王进舒鹏童贻刚法云智; 关键词：食蟹猴脑组织菌群

一种基于DNA甲基化检测肝癌的试剂盒及应用: 本发明涉及一种基于DNA甲基化检测肝癌的试剂盒，包括能检测人体肝特异的试剂，所述试剂包含在APOA5基因甲基化位点肝特异区序列的引物。所述引物的核苷酸序列为以下序列中的一种或多种：APOA5‑M‑F、APOA5‑M‑R、...; 钱嘉林刘文丽武会娟张小莉田彦捷方晨刘旭; 文献传递

宏基因组靶向测序分析皮肤表面微生物群落方法优化被引量：1: 2016年; 通过实验设计和数据分析,筛选出尽可能真实反映含量较低的皮肤微生物群落的高通量测序分析方法。使用多因素多水平完全随机实验设计,分析DNA提取、PCR扩增、样品采集、测序过程中各种实验因素对微生物群落组成特征分析结果的影响。结果显示,在样品采集方面,筛选出了最佳的采集拭子与采集液体;在DNA提取方面,筛选出了最佳的前处理方法及试剂盒种类;在PCR反应方面,筛选出了最佳的模板浓度及退火温度;在测序方面,筛选出了合适的测序深度。通过一系列的实验条件筛选,确定了适合分析低含量细菌群落结构组成特征的方法,并成功地应用于人类手掌面皮肤。; 姚雪刘文丽裴广倩童贻刚罗亚平; 关键词：RRNA基因

一种复合型皮肤消毒剂对冠状病毒灭活效果的观察被引量：5: 2020年; 目的观察一种复合皮肤消毒剂对冠状病毒的杀灭效果。方法采用悬液定量杀灭试验方法,对某复合型皮肤消毒剂灭活冠状病毒的效果进行观察。结果该复合型皮肤消毒剂主要有效成分为2 000 mg/L复合双链季铵盐和600 mg/L邻苯二甲醛。以该复合皮肤消毒液原液作用30 s,对悬液内冠状病毒GX_P2V(分离于穿山甲)灭活对数值> 4. 5。结论该复合型皮肤消毒剂可快速灭活冠状病毒GX_P2V。; 王立钦刘文丽刘文丽安小平范华昊宋立华童贻刚管洪在; 关键词：季铵盐邻苯二甲醛皮肤消毒剂冠状病毒灭活效果

基于土壤宏基因组分析的法医学个体来源地理位置推断被引量：1: 2021年; 目的初步探讨基于土壤宏基因组分析方法应用于法医学个体来源地理位置推断的可行性。方法收集黑龙江省、青海省、西藏自治区土壤样本共33例,提取样本中全部细菌总DNA,采用通用引物扩增细菌16S rDNA V3-V4高变区并在MiSeq测序仪上完成高通量测序,对测序数据进行物种组成和样本比较等生物信息学分析,基于分类操作单元(operational taxonomic unit,OTU)结果计算丰富度指数及多样性指数。结果测序共得到2720149条序列,聚类得到114848个OTU。黑龙江省、青海省、西藏自治区土壤微生物Chao1指数分别为797.45、745.11、535.98,Shannon指数分别为6.46、6.36、6.25,土壤中细菌物种数从多到少及群落多样性从高到低均依次为黑龙江省、青海省、西藏自治区。获得了3省土壤细菌在各分类水平下的结构组成,黑龙江省优势菌属为Chthoniobacteraceae科DA101属和Thermogemmatisporaceae科某一未注释的属;青海省优势菌属为Cytophagaceae科某一未注释的属和Nocardioidaceae科某一未注释的属;西藏自治区优势菌属为Comamonadaceae科某一未注释的属和Verrucomicrobiaceae科Luteolibacter属。主坐标分析结果显示,按照加权UniFrac度量分析,3个主成分代表总变量的56.36%,按照未加权UniFrac度量分析,3个主成分代表总变量的34.81%,同一省样本可分别聚类到一起,不同省来源的土壤微生物种类及含量则有明显差别。结论基于土壤宏基因组分析方法可以有效区分不同地区土壤样本,未来在法医学个体来源地理位置推断方面具有潜在的应用价值。; 刘文丽程凤钱嘉林方晨刘旭刘旭武会娟严江伟; 关键词：法医遗传学土壤

难提取细菌基因组DNA提取方法的比较与优化被引量：2: 2016年; 目的:比较并优化2种试剂盒提取以巨型球菌为代表的难提取细菌基因组DNA的方法,以获得高质量的DNA用于高通量测序,探索高通量测序样品的前期处理方法。方法:用Life Technologies公司的Charge Switchg DNA Mini Bacteria Kit和Roche公司的High Pure PCR Template Preparation Kit提取制备困难的巨型球菌基因组DNA,然后通过添加溶葡球菌酶和增加溶菌酶、RNase A、Protein K的投入量及延长消化时间优化2个试剂盒,对4种方法提取的细菌基因组DNA进行浓度、纯度和基因组完整性测定,选取质量良好的基因组进行高通量测序。结果:改良后的2个试剂盒提取的巨型球菌DNA浓度较高,分别达到78.4和67.8 ng/μL,可满足高通量测序的需求,并获得基因组全序列。结论:改良后的2种方法是提取制备困难的巨型球菌基因组DNA更好的方法。; 程实刘文丽舒鹏米志强安小平童贻刚; 关键词：高通量测序细菌基因组 DNA提取方法

试管容纳盒和试管架: 本实用新型涉及试管技术领域，提供试管容纳盒和试管架。试管容纳盒包括：容纳盒本体，至少在相对的两个第一表面设置有不同尺寸的试管的容纳腔，且所述容纳盒本体形成有位于所述容纳腔周围的注液腔。该种试管容纳盒，由于在相对的两个第一...; 方晨武会娟严江伟李宝明刘旭钱嘉林张小莉刘文丽; 文献传递

16S核糖体DNA宏基因组测序中细菌核酸提取方法的比较研究被引量：2: 2015年; 目的：探究细菌核酸提取方法对16S核糖体DNA（r DNA）宏基因组测序的影响。方法：分别采用TRIzol提取、试剂盒提取、溶葡酶＋试剂盒提取、超声波＋试剂盒提取、超声波＋溶葡酶＋试剂盒提取、匀浆＋试剂盒提取、匀浆＋溶葡酶＋试剂盒提取共7种方法对模拟样本进行细菌核酸提取,特异性地扩增16S r DNA的V1~V2高变区,测序后分析模拟样本中各种细菌的含量和相对分布。结果：超声波处理结合试剂盒提取方法中不同细菌数据分布及含量都相对均匀,是一种广谱、高效的细菌核酸提取方法。结论：超声波处理结合试剂盒提取方法适用于细菌宏基因组测序中样本核酸的提取。; 王伟王玉琢舒鹏米志强安小平裴广倩刘文丽袁文俊史套兴童贻刚; 关键词：基因组测序

一种唾液斑miRNA的提取方法和构建唾液斑miRNA高通量测序文库的方法: 本发明提供了一种唾液斑miRNA的提取方法和构建唾液斑miRNA高通量测序文库的方法，属于分子生物学技术领域。本发明的提取方法中应用了LH液，能够显著提高唾液斑miRNA的提取效率。采用本发明的提取方法得到的唾液斑miR...; 方晨武会娟严江伟刘旭钱嘉林李宝明刘文丽张小莉; 文献传递

一种基于血痕miRNA的年龄预测方法: 本发明提供了一种基于血痕miRNA的年龄预测方法，属于基因工程技术领域，包括：裂解血痕样本，得到裂解液；将裂解液与氯仿混合、离心，得到水相；将水相与检测外参、异丙醇混合、离心，得到miRNA；将miRNA逆转录为cDNA...; 方晨武会娟严江伟刘旭钱嘉林李宝明田彦捷刘文丽张小莉; 文献传递

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