谭明峰
- 作品数：4 被引量：10H指数：2
- 供职机构：军事医学科学院生物工程研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：理学医药卫生农业科学更多>>
- 幽门螺杆菌TNF-α诱导蛋白的生物信息学分析被引量：6
- 2009年
- 肿瘤坏死因子诱导蛋白Tipα是幽门螺杆菌特有的一个膜相关蛋白。它可以激活核因子κB,并诱导多种细胞因子和趋化因子的表达,导致胃炎和随后的肿瘤发生。它是幽门螺杆菌和胃癌发生之间的关键分子。本文利用生物信息学工具分析Tipα序列,预测其信号肽、跨膜区、疏水性、二级结构、三级结构等性质。结果:Tipα具有一段信号肽、脂蛋白信号肽酶切位点及脂盒模体。另外该蛋白没有跨膜区,可能是一个外周膜蛋白。Tipα的三级结构说明,该蛋白形成了一个致密的球状结构,Tipα的二级结构以α螺旋为主。
- 岳俊杰谭明峰李北平牛超周围王月兰梁龙
- 关键词：肿瘤坏死因子-Α诱导蛋白生物信息学
- 细菌黏附素序列模体分析被引量：1
- 2008年
- 目的:认识细菌黏附素序列保守的特征,更好地理解细菌黏附的机理。方法:利用InterProScan、MEME等分析工具对实验确认的155条细菌黏附素序列进行模体搜索。结果:用InterProScan在155个黏附素序列中搜索到119个模体,通过MEME分析发现了50个模体。结论:发现了一些与黏附功能相关的模体,为在细菌基因组内搜索黏附素序列奠定了基础。
- 岳俊杰谭明峰周围王夏李北平王月兰梁龙
- 关键词：黏附素细菌
- 人尿酸氧化酶结构的同源模建和生物信息学分析被引量：3
- 2007年
- 以微生物来源的尿酸氧化酶晶体结构为模板,根据推测的人尿酸氧化酶序列,利用同源模建技术预测人尿酸氧化酶的三维结构。人尿酸氧化酶结构具有两个相同的T-fold结构域。叠合不同来源的尿酸氧化酶结构证实,人尿酸氧化酶与其他来源尿酸氧化酶的活性中心的结构高度保守。另外找到一些不利于人尿酸氧化酶聚合的因素,这些因素可能是使人尿酸氧化酶基因在进化中失活的部分原因。
- 岳俊杰任仙文谭明峰李北平王月兰方宏清梁龙
- 关键词：同源模建
- 调控性SNP与羟自由基切割谱变化值的关系研究
- 2011年
- 目的将一种新的功能性非编码区预测方法———羟自由基切割法应用于调控性单核苷酸多态性(rSNP)的识别,验证其有效性。方法从人类基因突变数据库(HGMD)中收集99个rSNP,以其所在基因上游2 kb范围内的所有单核苷酸多态性(SNP)为对照;应用羟自由基切割法分别计算正链和负链。结果以正链计算有统计学差异,rSNP引起的羟自由基切割谱变化小于对照,而以负链计算则无统计学差异。结论该法识别调控性SNP有统计学意义,但显示趋势与表型相关SNP不一致。
- 张志毅岳俊杰王月兰李北平谭明峰梁龙孙建中
