王新根
- 作品数：3 被引量：8H指数：2
- 供职机构：深圳市福田区人民医院更多>>
- 发文基金：深圳市福田区卫生系统公益性科研项目广东省医学科学技术研究基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- CD147和PTEN在非小细胞肺癌中的表达及与临床病理因素的相关性分析被引量：3
- 2016年
- 目的分析细胞外基质金属蛋白酶诱导因子(CD147)和第10号染色体同源缺失性磷酸酶-张力蛋白(PTEN)在非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达,并探讨两者的相关性及其蛋白表达水平与多个临床病理因素的关系。方法采用免疫组织化学链霉素标记生物素过氧化物酶法(SP法)检测64例NSCLC患者组织中CD147和PTEN的表达情况,另选取10例患者的癌旁正常肺组织作为对照,并分析CD147和PTEN表达与临床病理参数的关系。结果 CD147在NSCLC组织中的表达率(75.00%)明显高于癌旁正常肺组织(0.00%),差异有统计学意义(P<0.05)。CD147蛋白表达与肺癌组织分化程度、有无淋巴结转移及TNM分期相关(P<0.05)。PTEN在肺癌组织中的表达率(32.81%)明显低于癌旁正常肺组织(80.00%),差异有统计学意义(P<0.05)。PTEN表达与TNM分期相关(P<0.05)。Spearman相关分析结果显示NSCLC组织中CD147和PTEN表达呈明显负相关(r=-0.442,P<0.05)。结论 CD147和PTEN异常表达在NSCLC的发生、发展过程中起着重要作用。
- 刘曙光邹振宁马红梅王新根李静徐胜美
- 关键词：非小细胞肺癌免疫组织化学细胞外基质金属蛋白酶诱导因子
- 人类miR-22靶基因生物信息学预测及功能分析被引量：5
- 2015年
- 目的应用生物信息学技术分析预测人类miR-22(hsa-miR-22)的靶基因并分析其功能,为深入研究hsa-miR-22的生物学功能和调控机制提供理论指导。方法利用Pub Med检索miR-22相关文章,明确其部分已知功能及已证实的靶基因,通过miRBase获得miR-22序列和基因组特征。应用miRWalk综合数据库中4种工具对hsa-miR-22靶基因进行预测并取交集,对预测的靶基因集合结合已证实的靶基因进行功能富集分析(GO分析)以及KEGG生物通路富集分析。结果 miR-22序列在多物种间具有一定的保守性。通过Pub Med检索获得已证实靶基因20个,miRWalk综合数据库预测的靶基因集合共194个。GO分析结果显示hsa-miR-22靶基因功能主要富集于转录调控、蛋白修饰、生物合成和形态发生等过程(P<0.01);KEGG生物通路主要富集于细胞外基质受体相互作用、黏着斑、肌动蛋白细胞骨架调节、Erb B信号通路、m TOR信号通路以及前列腺癌、子宫内膜癌、急性髓系白血病、胶质瘤和黑色素瘤疾病信号通路(P<0.05)。结论 hsa-miR-22的靶基因集合富集于多个生物学过程及疾病信号通路,与多种肿瘤密切相关。
- 刘曙光韩京军马红梅王新根李静郭东周有俭徐胜美
- 关键词：微小RNA靶基因生物信息学
- hsa-miR-30b靶基因预测及其相关生物信息学分析
- 2015年
- 目的通过生物信息学分析预测hsa-mi R-30b靶基因和功能,为深入研究hsa-mi R-30b的生物学功能和调控机制提供理论指导。方法利用Pub Med检索mi R-30b相关文章,通过mi RBase在线工具分析mi R-30b序列和基因组特征。应用mi RWalk综合数据库对hsa-mi R-30b靶基因进行预测,对靶基因集合应用Cytoscape及其插件Bingo进行功能富集分析,应用DAVID数据库进行靶基因信号转导通路富集分析。mi RBase、Pub Med、mi RWalk数据库通过输入hsa-mi R-30b或mi R-30b名称进行检索,Cytoscape及其插件Bingo和DAVID数据库则输入hsa-mi R-30b靶基因进行分析。结果 mi R-30b序列在多物种间具有一定的保守性。mi RWalk综合数据库预测靶基因交集共125个。hsa-mi R-30b靶基因主要富集于生长发育、细胞迁移、细胞周期、胰腺细胞分化、转录调控、神经系统发育等(P<0.01);KEGG生物通路主要富集于Notch信号通路及年轻起病成人型糖尿病、致心律失常性右心室心肌病、小细胞肺癌和前列腺癌疾病通路(P<0.05)。结论 hsa-mi R-30b预测的靶基因集合富集于多个生物学过程及疾病通路,与肺癌、前列腺癌等多种肿瘤密切相关,为hsa-mi R-30b在肿瘤方向的后续研究奠定基础。
- 刘曙光马红梅王新根李静郭东徐胜美
- 关键词：靶基因信号通路生物信息学
