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曾荣
作品数:
1
被引量:3
H指数:1
供职机构:
湖南大学金融与统计学院
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相关领域:
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张骋
湖南大学生物学院植物功能基因组...
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曾荣
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2014
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拟南芥高丝氨酸激酶HSK的分子结构与同源建模研究
被引量:3
2014年
高丝氨酸激酶(EC 2.7.1.39)是拟南芥中合成甲硫氨酸和苏氨酸的关键酶之一。作者利用DNAMAN软件分析高丝氨酸激酶的氨基酸组成和等电点;利用生物信息学在线网站预测分析其疏水性、二级结构、跨膜结构域、信号肽区域、PEST序列、化学修饰位点及亚细胞定位等;利用SWISS-MODEL软件进行同源建模,使用Chimera(V1.8.1)做结构修饰处理,最后利用Molprobity4及ERRAT(V2.0)对建模结果进行结构质量分析。结果发现:HSK预测等电点为8.48,平均亲水性0.267;二级结构中α-螺旋占34.32%,不规则卷曲占48.11%,延伸链占17.57%;高丝氨酸激酶的预测模型经验证具有稳定的空间结构,符合立体化学规则。
肖文君
胡帅
曾荣
常洪平
袁聪颖
王萍
张骋
陆秀涛
郭新红
关键词:
拟南芥
分子结构
同源建模
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