张博
- 作品数:4 被引量:46H指数:2
- 供职机构:西安交通大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金美国国立卫生研究院基金Fogarty基金更多>>
- 相关领域:文化科学医药卫生更多>>
- 生命科学实验教学中心网站设计与建设被引量:1
- 2013年
- 本文主要针对生命学科本科生教学需求和生命科学实验教学中心的建设要求,提出了实验教学中心网站的网站定位、基本设计内容、主体功能和建设内容,网站的建设目标是建成一个集教学实验、学术交流于一体的信息型网站,为广大师生提供了一个便捷、优质的信息交互平台,网站经过测试已经投入使用,效果良好。
- 周秦武张博宋亚楠石公羽
- 关键词:教学网站生命科学网站设计资源共享
- 北京汉族人群MAFB基因SNPs等位基因及单体型频率研究
- 2014年
- 目的为病因学研究中MAFB基因单核苷酸变异(SNV)研究位点的确定提供依据。方法利用Haploview软件和千人基因组计划提供的遗传学数据,对MAFB基因单核苷酸多态(SNP)位点的最小等位基因频率(MAF)、单体域及单体型进行分析。结果千人基因组计划在MAFB基因编码区及3'和5'端之间共测定了3196个SNV位点。位于基因3'端39255548与39282720间的106个SNVs中,81个MAF〉1且符合Hardy-Weinberg平衡,其中27个与其它SNP间r2=1。其余54个SNPs中,MAF位于0.01-和0.45-组段者所占比例最高,分别为35.19和27.78。54个SNPs所形成的5个单体域均以频率最高的2种单体型为主,累计频率为73.7~98.9。结论千人基因组计划比illumina 610芯片提供了更丰富的SNPs遗传标记,检出并避免利用无效或低效SNPs进行关联研究,可提高研究的把握度和效率。
- 胡斌陈倩倩张博张天啸张小龙王红
- 关键词:MAFBGENOMES单体型频率HARDY-WEINBERG
- SUMO1基因单核苷酸多态性分析及rs7599810多态性与非综合征型唇/腭裂的关联研究被引量:3
- 2014年
- 目的:对HapMap数据库四个不同人群SUM01基因的单核苷酸多态性(singlenucleotidepolymorphisms,SNPs)进行分析和比较,并探讨山东汉族人群rs7599810位点多态性与非综合征型唇/腭裂(non—syndromiccleftlipwithorwithoutcleftpalate,NSCL/P)的关联。方法:首先用Haploview软件确定HapMap四个人群,分别为:中国北京汉族(HanChineseinBeijing,China,CHB)、日本东京(JapaneseinTokyo,Japan,JPT)、西北欧后裔(UtahresidentswithNorthernandWesternEuropeanancestryfromtheCEPHcollection,CEU)和尼日利亚约鲁巴(YorubaninIbadan,Nigeria,YRI),四个人群中SUM01基因SNPs中最小等位基因频率(minorallelefrequency,MAF)〉0.01且符合Hardy—Weinberg平衡的SNPs为合格SNPs,用MAF全距相对比指标衡量人群间最小等位基因相同的共有合格SNPs的MAFs差异;然后对四个人群共有合格SNPs进行单体域和单体型的分析及比较;最后对本研究所测该基因中的rs7599810在山东地区183个NSCL/P核心家系中进行传递不平衡检验(transmission/disequilibriumtest,TDT)。结果:HapMap提供的24个SNPs中,纯合SNPs在CHB和JPT均为9个,在CEU为8个,在YRI为6个,四个人群共有合格SNPs为12个。这些SNPs在四个人群均形成了一个单体域,其中CHB、JPT、CEU人群的单体域包括全部12个SNPs,YRl人群的单体域包括第3~11个SNPs。CHB、JPT、CEU和YRI人群的单体域分别确定了3、3、5、6种单体型,且均以前两种单体型为主,频率为0.634~0.922。TDT结果显示SUM01基因rs7599810多态性与NSCL/P未见统计学关联(X^2=0.485,P=0.486,OR=0.898,95%C/:0.663~1.021)。结论:CHB、JPT和CEU人群SUM01基因SNPs在等位基因组成、MAF、单体域及单体型构成等方面以共性特征为主,与之相比,YRl人群SNPs表现出较大的独特性。山东汉族人群中SUM01基因rs7599810多态性与NSCL/P未见统计学关联。
- 岳青王红张博赵凯平
- 关键词:多态性单核苷酸唇裂腭裂
- 以项目驱动为导向的专业综合实验课程设计与实践被引量:42
- 2014年
- 提出了一种基于项目驱动为导向的生物医学工程专业综合实验教学方法,提出了实验教学目标、实验项目设置方法,以及实验考核评价体系,深入分析了实验教学对创新型人才培养的巨大促进作用,在实验内容设计和指导教师选拔培养两方面构建了完善的实验教学保障体系,多年的教学实践证明,课程内容得到了学生广泛的欢迎,对学生的工程实践能力和创新能力有明显的促进和提高。
- 周秦武张博张大龙赵永席冯怡
- 关键词:工程实践