何杨
- 作品数：12 被引量：22H指数：3
- 供职机构：德阳市疾病预防控制中心更多>>
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- 四川省德阳市柯萨奇病毒A组5型基因特征分析
- 2023年
- 目的分析四川省德阳市手足口病病例中的柯萨奇病毒A组5型(coxsackievirus A5,CVA5)的基因特征,为防控CVA5提供科学依据。方法对德阳市2013—2021年手足口病监测中收集到的疑似病例咽拭子标本,采用实时荧光聚合酶链反应(real-time fluorogenic quantitative polymerase chain reaction,Q-PCR)进行肠道病毒核酸检测,选择Q-PCR检测结果CT值<30的非肠道病毒71型(EV-A71)/柯萨奇病毒A组16型(CVA16)的其他肠道病毒核酸阳性标本,分别进行VP4/VP2区和VP1区基因扩增和核苷酸测序,再用MEGA 7.0.26软件构建CVA5系统进化树,分析其基因特征。结果2013—2021年德阳市共收集手足口病疑似病例标本3115份,经Q-PCR检测非EV-A71/CVA16的其他肠道病毒核酸阳性标本为1314份;选择其中的353份标本进行VP4/VP2区和VP1区核苷酸测序,在280份标本中检测出8种肠道病毒型别,其中10份为CVA5。德阳市10份CVA5标本之间,VP1区核苷酸序列相似性为91.4%~99.8%,推导氨基酸序列同源性96.6%~99.6%;同CVA5原型株比较,核苷酸相似性和推导氨基酸同源性分别为81.3%~82.5%和94.9%~96.6%,有19个位点发生了氨基酸变异。进化树分析显示,德阳市CVA5与绝大多数中国CVA5聚集在一起,均为C1基因亚型3谱系,但分布在3个不同的进化分支中,分支间平均遗传距离为6.2%~6.4%。结论德阳市10株CVA5均为C1基因亚型3谱系,分布在3个不同的进化分支。CVA5不但能引起手足口病和疱疹性咽峡炎,还会引起急性脑病、急性弛缓性脊髓炎、胃肠炎等疾病,今后应加强CVA5的检测,并开展基因组测序,更全面了解其基因特征。
- 吴晓宇何杨杨国庆曾德军刘泉童文彬
- 关键词：手足口病基因特征
- 德阳市乙型肝炎病毒基因型、血清亚型和变异分析
- 2013年
- 目的了解德阳市乙型肝炎病毒基因型、血清亚型和变异。方法从HBsAg阳性的血清标本提取病毒DNA,S基因全序列多聚酶链反应和测序后,根据进化树和推导氨基酸确定基因型、血清亚型及"α"抗原决定簇氨基酸变异。结果 41份标本中,33份标本为B基因型/adw2血清亚型,7份标本为C基因型/adrq+血清亚型,另1份标本为B基因型/ayw1血清亚型;6份标本"α"抗原决定簇内氨基酸发生变异,分别为Thr126Ser,Thr126Ala,Gln129His,Met133Leu和Thr143Met,且变异集中在第1环内氨基酸(6/7,85.7%)。1份标本在114位和115位氨基酸间插入额外1个氨基酸,1份标本的216位氨基酸变异为终止码。结论德阳市HBV以B基因型/adw2为主,自发的"α"决定簇氨基酸变异集中在第一环氨基酸。
- 何杨刘朝红李超代泽伟杨成林
- 关键词：乙型肝炎病毒基因型血清亚型
- 四川省德阳市柯萨奇病毒A组4型基因特征分析
- 2017年
- 目的分析四川省德阳市柯萨奇病毒A组4型(coxsackievirus A4,CV-A4)的基因特征。方法对2014-2015年德阳市手足口病咽拭子标本进行病毒分离和核苷酸测序,VP1区序列与世界各地的CV-A4参考株序列构建进化树并分析基因特征。结果德阳市5株CV-A4分离株之间,VP1区核苷酸序列一致性91.5%~96.8%(推导氨基酸序列一致性97.7%~99.3%);同CV-A4原型株(High Point)比较,核苷酸序列一致性≥84.0%(推导氨基酸序列一致性≥97.0%);进化树分析显示,德阳市CV-A4分离株均为G1B基因亚型,分别与云南、上海和浙江分离株有较近的亲缘关系。G1B基因亚型内的平均核苷酸遗传距离为10.4%。结论德阳市CV-A4为G1B基因亚型,为中国大陆的优势基因亚型;VP1区核苷酸变异较大,形成不同的进化分支并在德阳市循环传播。
- 何杨吴晓宇代泽伟吉华贵高燕
- 关键词：手足口病VP1基因基因特征
- 流感标本的采集和保存条件对分离率的影响被引量：3
- 2007年
- 刘华利刘泉何杨谢贤建
- 关键词：分离率
- 2018年德阳市胃肠炎暴发中诺如病毒分子病原学特征研究被引量：3
- 2020年
- 目的了解2018年德阳市急性胃肠炎(acute gastroenteritis,AGE)暴发疫情中诺如病毒(Norovirus,NoV)感染情况及其分子病原学特征,为NoV预防控制和疫苗研发提供参考。方法收集德阳市2018年3起AGE暴发疫情的疑似病例及健康人标本共63份。采用实时荧光RT-PCR检测NoV核酸,阳性标本用RT-PCR扩增聚合酶(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)区和衣壳蛋白(capsid protein)VP1区并测序分析。结果NoV实时荧光RT-PCR结果显示3起AGE暴发疫情均由GII组NoV感染引起,检测阳性率为33.3%(21/63),其中病例标本检出率为95%(19/20),健康人标本检出率为4.7%(2/43)。测序分析表明,2起疫情由GII.17[P17]型NoV引起,与2014年以来流行的GII.17变异株高度同源;1起疫情由GII.2[P16]型NoV引起,与2016年以来流行的GII.2[P16]重组株高度同源。结论2018年德阳市至少存在2种以上不同型别的NoV同时流行。
- 曹冉冉曹冉冉何杨马小珍马小珍
- 关键词：诺如病毒胃肠炎系统进化分析
- 四川省德阳市埃柯病毒6型的基因特征分析被引量：1
- 2015年
- 目的了解四川省德阳市埃柯病毒6型(echovirus 6,E6)的基因特征。方法对2013年德阳市手足口病咽拭子标本的病毒分离阳性株进行核苷酸测序,获取的E6毒株序列与世界各地的E6参考株序列构建进化树并分析基因特征。结果4株E6分离株中,3株VP1区核苷酸序列一致,与另1株仅有1个核苷酸差异。同E6原型株(D'Amori)比较,核苷酸一致性≥77.0%。进化树分析显示,德阳市E6分离株为C2基因亚型,与部分山东分离株聚集在同一进化分支上。结论德阳市E6为C2基因亚型。其中3份标本来自同一地区的不同月份,提示E6在此地持续传播。
- 何杨伍剑代泽伟杨成林刘泉刘灵韵童文彬
- 关键词：基因特征
- 四川省德阳市健康儿童肠道病毒带毒调查和型别鉴定被引量：3
- 2018年
- 目的了解四川省德阳市健康儿童的肠道病毒(enterovirus,EV)带毒状况,确定EV型别,并探讨其与手足口病病原谱的关系。方法 2016年5月19日在德阳市4家幼儿园采集健康儿童粪便标本进行EV核酸检测、病毒分离和核苷酸测序,根据进化树聚集确定EV型别。结果 203份标本中,EV核酸阳性81份。选取其中的60份EV核酸阳性标本(Ct≤33)进行部分VP2区直接测序和病毒分离,56份标本获取VP2区序列,29株病毒分离物获取VP1区全序列。VP1区核苷酸进化树显示,29株分离物分别与CV-A4、CV-A6、CV-A9、CV-A10、E11、E16和E30原型株聚集在一起;VP2区推导氨基酸进化树显示56份粪便标本也分别与相同的7种原型株聚集。标本VP2区定型结果和其对应的分离物VP1区定型结果一致。结论此次调查的德阳市健康儿童中EV阳性率为39.9%,检出7种EV型别。同一EV型别在1家幼儿园的多份标本中检出,提示局部存在密切接触传播。4种B组EV (CV-A9、E11、E16和E30)未在德阳市所有手足口病标本中检出过。VP1区分析是EV定型的最准确的方法;VP2区分析可初步确定EV组别,对部分EV也可正确定型,为下一步VP1区测序引物选择提供帮助。
- 何杨吴晓宇吉华贵高燕刘泉周立晶马小珍童文彬
- 关键词：健康儿童肠道病毒
- 高毒力猪链球菌致化脓性脑膜炎1例被引量：2
- 2020年
- 报道1例猪链球菌引起化脓性脑膜炎病例,为猪链球菌感染的诊治提供参考。回顾某院1例猪链球菌致化脓性脑膜炎病例的诊治过程和流行病学资料,并对相关文献进行复习。此病例临床表现为发热头痛,进展迅速,通过有效的抗感染治疗后患者好转出院,但是出现严重的听力障碍,流行病学调查证明此为单发病例。猪链球菌感染后进展迅速并常伴有严重后遗症,及时足量的地塞米松联合耳毒性低的抗菌药物治疗能降低听力障碍的发生率。
- 陈宗耀何杨王登朝谢伟郑茂姜亚运
- 关键词：高毒力猪链球菌脑膜炎
- 2011年德阳市手足口病病原学检测结果分析
- 2016年
- 目的了解2011年德阳市手足口病发病情况,采集临床诊断手足口病病例标本进行病原学检测,为降低手足口病发病率提供及时可靠的科学数据。方法收集并分析德阳市手足口病发病资料,对采集的临床诊断手足口病病例咽拭子标本进行肠道病毒核酸实时荧光PCR检测。结果 2011年德阳市共报告手足口病病例1 574例,其中重症4例（0.25%）,发病高峰为4-6月和10-12月,发病例数和发病率都以广汉市最高,男女性别比例为1.55∶1,2-岁年龄段发病人数最多,占病例总数的30.30%,职业发病构成以散居儿童为主,占所报告病例的60.55%,2011年共收集到235份临床诊断手足口病病例标本,检测出阳性标本158份（67.23%）,下属各区县的阳性标本都以EV71感染为主。结论 2011年德阳市手足口病主要病原体是EV71,发病高峰为4-6月和10-12月,应在发病高峰期做好预防工作。
- 伍剑何杨杨成林代泽伟张秀华刘泉肖静杰
- 关键词：手足口病EV71实时荧光PCR病原学检测
- 四川省什邡市健康儿童中埃柯病毒11型基因特征分析被引量：2
- 2019年
- 目的分析四川省什邡市埃柯病毒E11型(echovirus 11,E11)的基因特征。方法对采集的健康儿童大便标本进行肠道病毒(enterovirus,EV)核酸检测、病毒分离和VP1区核苷酸全序列测序,根据进化树聚集确定E11基因型/基因亚型。结果69份标本中,EV核酸阳性32份,选取Ct值≤33的20份标本进行病毒分离,收获毒株14株,其中8株为E11。E11间VP1区核苷酸序列一致性≥99.4%,推导氨基酸序列一致性≥98.9%。进化树分析显示,什邡市E11与D5基因亚型参考株聚集在同一进化分支上。结论什邡市健康儿童中分离到的E11为D5基因亚型,与以前我国流行的基因型(A和C)不同。D5基因亚型E11可引起脑炎、脑膜炎和手足口病等疾病,需对其流行程度和持续时间开展监测。
- 何杨吴晓宇吉华贵高燕刘泉周立晶邹俊李鹏向阳马小珍童文彬
- 关键词：健康儿童基因特征
