林征
- 作品数：4 被引量：22H指数：3
- 供职机构：上海市长宁区疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：中美新发和再发传染病合作项目国家高技术研究发展计划国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 上海市长宁区2017年肠炎沙门菌多重耐药和分子分型研究被引量：9
- 2019年
- 【目的】了解上海市长宁区2017年肠炎沙门菌的分子分型结果及抗菌药物耐药情况。【方法】对2017年上海市长宁区的感染性食源性病原菌监测标本进行沙门菌的分离鉴定、血清分型,检出33株肠炎沙门菌,运用国家致病菌识别网技术手册(2017年)的分子分型方法进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型,使用微量肉汤稀释法进行抗菌药物耐药性的测定。【结果】33株肠炎沙门菌共分为11种带型,优势带型集中在Clade1中,共计30株。耐2种及2种以上抗菌药物的有22株,耐6种及6种以上抗菌药物的19株,并出现2株四代头孢全耐药。【结论】长宁区肠炎沙门菌多重耐药现象比较普遍,PFGE型别差异较小,相同PFGE型别的菌株多重耐药表型相近。
- 毕磊黄峥林征张岭
- 关键词：肠炎沙门菌脉冲场凝胶电泳耐药分子分型
- 旺兹沃思沙门菌耐药分子流行病学特征研究被引量：5
- 2015年
- 目的研究旺兹沃思沙门菌的耐药分子流行病学特征。方法基于上海市网络实验室连续性监测腹泻病例和环境食品的旺兹沃思沙门菌进行抗生素耐药和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分析。结果 2005-2012年上海市网络实验室诊断临床病例分离沙门菌4553株,居前10位的20个血清型均为A^F群,旺兹沃思沙门菌在少见的非A^F群中居首位,5岁以下和60岁以上人群普遍易感,偶见血流感染重症病例。确认食源环境沙门菌1805株,前10位血清型明显比人源更具多样性,旺兹沃思沙门菌亦在少见型中居首位,多源自牛蛙、甲鱼和淡、海水养殖鱼介类。旺兹沃思沙门菌的人源和非人源株间的耐药性差异无统计学意义(P>0.05)。PFGE分5个克隆族:克隆族A为多重耐药克隆,疑似暴发的2株12重耐药MDR-ACSSu T-SH009型菌株和1株6重耐药的SH009型甲鱼源菌株100%同源;克隆族B、D、E和C分别是成年人和低年龄组感染克隆,均对抗生素敏感。结论旺兹沃思沙门菌虽属相对少见菌型,近年病例数呈上升趋势。上海市近期分离的旺兹沃思沙门菌与牛蛙、甲鱼和淡、海水养殖鱼介类菌株存在高度相似性,建议对致病且多重耐药克隆加强监测,并预警餐饮机构在操作牛蛙和甲鱼时可能存在交叉污染或接触感染的暴露风险。
- 黄峥刘芸汤泓李颖石维敏张静李勇林征张岭金汇明王传清阚飙史贤明许学斌
- 关键词：低年龄组
- 上海市长宁区2014—2015年急性结膜炎病原学鉴定与基因特征分析被引量：5
- 2017年
- 目的了解上海市长宁区急性结膜炎的病原学种类及流行病学特征。方法 2014年5月至2015年5月,在上海市长宁区监测点医院采集急性结膜炎患者眼拭子标本,抽提核酸后使用荧光RT-PCR法检测肠道病毒通用型、肠道病毒70型(EV70)、柯萨奇病毒A组24型(CA24v)及肠道腺病毒。选取腺病毒阳性标本采用普通PCR法进一步扩增腺病毒六邻体基因高变区片段。使用生物信息学软件对测序后序列信息进行研究以进一步确定感染腺病毒的基因型。结果检测的144份急性结膜炎患者标本中,22.22%(32/144)为肠道病毒通用型和腺病毒阳性,未检测到EV70和CA24v。腺病毒阳性共28份,占所有阳性标本的87.50%(28/32)。各年龄组腺病毒阳性率差异有统计学意义,20~39岁年龄组阳性率最高。对所有腺病毒阳性标本进行测序,共有5份标本测序成功,序列信息显示均为腺病毒D组,核酸序列同源性达到97.6%。结论 2014—2015年D组腺病毒是上海市长宁区急性结膜炎的最主要病原体,应在日后的监测中引起重视。
- 林征徐云蕴黄峥
- 关键词：急性出血性结膜炎肠道病毒柯萨奇病毒
- 上海市长宁区2015-2016年冬春季甲型H1N1流感病毒基因特征分析被引量：3
- 2018年
- 目的对2015-2016年冬春季甲型H1N1流感病毒基因特征进行分析。方法选取上海市长宁区流感网络实验室于2015-2016年流感冬春季流行高峰期分离的甲型H1N1毒株35株,采用RT-PCR扩增其血凝素基因(hemagglutinin,HA)及神经氨酸酶基因(neuraminidase,NA)全长,并对扩增产物进行序列测定。使用MEGA软件计算基因同源性,使用MegAlign软件分析相关抗原和耐药位点,使用NetNGlyc1.0软件在线预测糖基化位点。结果35株甲型H1N1流感病毒HA基因分布在Clade6B.1、6B.2和6C分支上,以Clade6B.1为主。与2015-2016、2016-2017年北半球推荐的疫苗株A/California/07/2009的核苷酸和氨基酸同源性分别为96.7%~99.0%和96.7%~98.2%。与2017-2018年疫苗株A/Michigan/45/2015的核苷酸和氨基酸同源性分别为97.2%~99.3%和97.5%~99.5%;与疫苗株A/California/07/2009相比,35株分离株的HA都发生了抗原位点Sb区S185T位点和Cb区S203T位点突变,33株发生了Sa区K163Q位点突变,7株发生了Cb区Q223R位点突变。受体结合位点和糖基化位点的氨基酸序列均未发生变异。对35株病毒NA基因上9个与耐药有关的基因位点进行分析,1株发生了H274Y位点的改变。结论2015-2016年冬春季流行的甲型H1N1病毒的HA和NA基因序列改变可能是造成流行高峰的主要原因。
- 徐阳卜方郭家胤张岭林征黄峥
- 关键词：流感病毒A型H1N1亚型血凝素类神经氨酸酶基因特征分析
