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何晨
作品数:
1
被引量:5
H指数:1
供职机构:
重庆邮电大学生物信息学院生物信息学研究所
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发文基金:
重庆市自然科学基金
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相关领域:
生物学
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合作作者
陈薇
重庆邮电大学生物信息学院生物信...
谭军
重庆邮电大学生物信息学院生物信...
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谭军
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陈薇
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何晨
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重庆邮电学院...
年份
1篇
2006
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植物miRNAs前体的生物信息分析
被引量:5
2006年
miRNAs前体(pre-miRNAs)是产生成熟miRNAs的基因表达产物,能形成较为稳定的发卡环结构,具有较低的最小折叠自由能(minimal folding free energy,MFE)。在对植物pre-miRNAs长度、不同碱基含量、MFE、熵分析基础上,重点比较不同RNAs序列之间MFE与其长度的比值(MFEL)。结果表明MFEL是区分植物pre-miR-NAs的一个很有效的参数:pre-miRNAs的MFEL值平均为-45.98 kcal/mol,明显低于mRNAs(-23.08 kcal/mol),tRNAs(-22.13 kcal/mol)和rRNAs(-16.83 kcal/mol)。使用MFEL参数可提高预测植物miRNAs基因的效率。
陈薇
谭军
何晨
关键词:
拟南芥
MIRNAS
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