您的位置： 专家智库 > >

叶丙雨

作品数：4 被引量：8H指数：1
供职机构：河南师范大学生命科学学院更多>>
发文基金：国家自然科学基金博士后科研启动基金更多>>
相关领域：生物学更多>>

合作作者

文献类型

  • 4篇中文期刊文章

领域

  • 4篇生物学

主题

  • 3篇基因
  • 2篇蛋白
  • 2篇肝再生
  • 2篇大鼠肝再生
  • 1篇调控基因
  • 1篇调控基因表达
  • 1篇增强子
  • 1篇增强子结合蛋...
  • 1篇全基因组
  • 1篇染色
  • 1篇染色质
  • 1篇染色质结构
  • 1篇转录
  • 1篇转录因子
  • 1篇微小RNA
  • 1篇细胞
  • 1篇锌指
  • 1篇锌指蛋白
  • 1篇锌指结构
  • 1篇结合蛋白

机构

  • 4篇河南师范大学
  • 2篇科技部
  • 1篇军事医学科学...
  • 1篇聊城大学
  • 1篇学研究院

作者

  • 4篇叶丙雨
  • 1篇师明磊
  • 1篇叶丙雨
  • 1篇赵志虎
  • 1篇常翠芳
  • 1篇李平
  • 1篇沈文龙
  • 1篇张彦
  • 1篇何超

传媒

  • 2篇解剖学报
  • 1篇遗传
  • 1篇中国细胞生物...

年份

  • 1篇2023
  • 1篇2021
  • 2篇2017
共 4 条 记 录，以下是 1-4
全选 清除 导出
排序方式：
大鼠肝再生的肝细胞周期启动及终止中骨髓瘤基因mRNA与其他非编码RNA的表达变化与作用
2023年
目的 了解大鼠肝再生(LR)0 h、6 h和72 h时骨髓瘤基因(MYC)及其mRNA相互作用的微小RNA(miRNA)和环状RNA(circRNA)调节肝细胞周期启动及终止的途径与方式。方法 按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型,按Smedsrod等方法分离肝细胞,用大规模定量检测技术测定大鼠肝再生中肝细胞的mRNA、miRNA和circRNA[合称内源竞争RNA(ceRNA)]表达变化,用Cytoscape 3.2软件构建ceRNA的相互作用网,用ceRNA综合分析等方法解析它们的表达相关性和作用相关性。结果 在PH后肝细胞周期启动0~6 h间的0 h和6 h时,MYC mRNA的比值为0.15±0.03和2.36±0.2,miR-134-5p为3.22±0.61和0.08±0.02,circRNA_12112为0.68±0.21和13.35±3.53。同时,PH后0 h时,MYC促进的细胞周期启动相关基因Ras关联域家族成员1(RASSF1)、细胞周期蛋白依赖性激酶2(CDK2)、超氧化物歧化酶2(SOD2)表达下调,抑制的细胞周期启动相关基因嵌套蛋白(NES)、雷达21黏附复合物成分(RAD21)、CUE域包含2(CUEDC2)未发生有意义表达变化。PH后6 h时,MYC促进的细胞周期启动相关基因SOD2表达上调,抑制的细胞周期启动相关基因NES、RAD21、CUEDC2表达下调。相反,在细胞周期终止,即PH后72 h时,MYC mRNA的比值为0.30±0.10,miR-880-3p为0.54±0.01,circRNA_09599为0.54±0.16。同时,MYC促进的细胞周期终止相关基因肝细胞生长因子(HGF)表达上调,抑制的细胞周期终止相关基因MET原癌基因受体酪氨酸激酶(MET)和细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1A(CDKN1A)表达下调。结论 上述circRNA抑制的miRNA、miRNA抑制的MYC mRNA以及MYC调节的细胞周期启动及终止相关基因的表达相关性和作用相关性有利于PH后6 h时肝细胞处于细胞周期启动状态和PH后72 h时肝细胞处于细胞周期终止状态。
薛奇杰常翠芳王子慧臧夏炎林凯琳张春博韩璐叶丙雨徐存拴
关键词：肝再生
大鼠肝再生启动阶段肝细胞CCAAT增强子结合蛋白β mRNA、微小RNA-369-3p和rno-Rmdn2_0006的表达和作用
2021年
目的了解大鼠肝再生启动阶段CCAAT增强子结合蛋白β(CEBPβ)mRNA、miR-369-3p和rnoRmdn2_0006调节肝细胞处于G_(0)期还是G_(1)期的途径和方法。方法按Higgins等方法制备大鼠2/3肝切除(PH)模型,按Smedsrod等方法分离肝细胞,用大规模定量分析技术检测大鼠肝再生中肝细胞竞争性内源RNA(ceRNA)表达的变化,用Cytoscape 3.2软件构建ceRNA的相互作用网络,用ceRNA综合分析等方法解析它们表达的相关性和作用相关性。结果PH后0 h和6 h时,CEBPβmRNA的比值为1.11±0.11和2.57±0.10,miR-136-3p为0.70±0.22和0.28±0.03,rno-Rmdn2_0006为1.26±0.34和2.62±0.70。CEBPβ促进的G_(0)期相关基因生长停滞和DNA损伤诱导型β(GADD45β)为0.12±0.09和2.50±0.44,细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂1A(CDKN1A)为0.39±0.07和0.93±0.15,抑制的G_(0)期相关基因细胞周期蛋白依赖性激酶2相关蛋白2(CDK2AP2)为2.55±0.42和0.74±0.11,信号转导子和转录激活因子1(STAT1)为2.57±0.13和1.32±0.13。CEBPβ促进的G_(1)期相关基因ETS变异转录因子6(ETV6)为0.77±0.05和2.22±0.68,血红蛋白加氧酶1(HMOX1)为1.05±0.21和4.57±0.88,丝裂原活化蛋白激酶14(MAPK14)为1.01±0.15和2.01±0.32,硫氧还蛋白相互作用蛋白(TXNIP)为1.03±0.07和2.50±0.19,抑制的G_(1)期相关基因红细胞衍生核因子2样蛋白2(NFE2L2)为0.66±0.09和0.35±0.05。结论PH后0 h时,CEBPβmRNA未上调,有利于CEBPβ抑制的G_(0)期相关基因表达和肝细胞处于G_(0)期。相反,PH后6 h时,rno-Rmdn2_0006和miR-369-3p通过相互作用解除了后者对CEBPβmRNA的抑制,有利于CEBPβ形成,有利于CEBPβ促进的G_(1)期相关基因表达和肝细胞处于G_(1)期。
白格王子慧宋亚萍臧夏炎李亚霏叶丙雨赵志虎徐存拴
关键词：肝再生
ZNF143调控基因表达的机理
2017年
ZNF143(zinc finger protein 143)是由7个锌指结构组成的C2H2型转录因子,其在绝大多数脊椎动物的不同组织、细胞中广泛表达。但通常情况下,ZNF143在癌组织、胚胎发育过程中的表达高于正常组织。研究发现,ZNF143主要通过参与编码和非编码基因的激活,从而在细胞周期、细胞增殖与分裂等细胞活动中发挥重要作用。更为重要的是,近几年研究表明,ZNF143通过与其他调控蛋白质形成转录起始复合物来介导远距离染色质的相互作用,从而参与染色质结构的形成,推测其在细胞身份及命运决定中发挥重要功能。此外,由于ZNF143的表达异常往往伴随着肿瘤的发生,因此,近些年针对ZNF143来设计药物靶点的研究也取得了一定的进展。
叶丙雨徐存拴
关键词：锌指结构转录因子染色质结构
全基因组染色质相互作用Hi-C文库制备的优化及其质量控制被引量：8
2017年
Hi-C(highest-throughput chromosome conformation capture)技术是近年出现的一种研究染色质相互作用的关键技术。该技术步骤多、耗时长,涉及的试剂耗材繁杂,目前常规流程还有较多可以改进优化的步骤。本研究以GM12878细胞为材料,通过优化常规Hi-C实验中的交联、酶切、限制性内切酶的失活、末端生物素标记、原位连接等关键步骤,建立了稳健的Hi-C流程,制备了相应的Hi-C文库。文库经初步的Sanger测序等质量控制以后,两个生物学重复文库进行了高通量测序。测序结果利用生物信息学处理发现:原始测序数据中可比对率和配对率分别达到90%和72%左右。此外,去除自连片段(self-circular ligation)和dangling-ends片段以后,可获得超过96%的有效相互作用对,其中染色体内相互作用数据达到60%。进一步的染色体相互作用热图分析可见清晰拓扑学相关结构域TADs(topologically associated domains),与已发表的文献报道一致。而两次生物学重复之间的相关性分析则表明bin coverage和all bin pairs的相关性都极强。上述结果表明通过对常规Hi-C流程关键步骤的优化,本研究建立了高效、稳健、可靠的Hi-C流程,对Hi-C技术的进一步使用与推广具有重要的参考价值。
张香媛何超叶丙雨叶丙雨师明磊师明磊张彦沈文龙李平
关键词：高通量测序
全选 清除 导出
共1页<1>
聚类工具0