叶坤
- 作品数：6 被引量：13H指数：3
- 供职机构：中国人民解放军总医院更多>>
- 相关领域：医药卫生自动化与计算机技术更多>>
- 2015至2017年解放军总医院沙门菌分子分型和耐药基因特征分析被引量：7
- 2019年
- 目的了解解放军总医院沙门菌流行情况及耐药基因特征,为沙门菌的感染防治提供依据。方法回顾性研究,收集78株2015至2017年沙门菌临床分离株,患者年龄(49±21)岁,以中青年为主,临床样本主要来自粪便和静脉血,分别占44.87%(35/78)和33.33%(26/78)。对其进行血清型鉴定、体外药敏试验和全基因组测序后,进行多位点序列分型(MLST)和携带耐药基因分型,对耐头孢噻肟或环丙沙星沙门菌聚类分析。结果沙门菌血清型以D群沙门菌(53.85%)和C群沙门菌(21.79%)为主;ST分型以ST11型为主。体外药敏试验显示沙门菌多药耐药率为64.11%(50/78),全部敏感率为25.64%(20/78)。对萘啶酸耐药率最高,为65.38%(51/78)。沙门菌最常携带的耐药基因为β内酰胺类药物耐药基因,占78.21%(61/78)。结论本院分离的沙门菌ST型与携带耐药基因呈多样性,多数沙门菌对抗菌药物呈现多药耐药。对沙门菌进行分子分型、耐药基因分析及构建耐药菌进化树对确定耐药沙门菌间的亲缘关系,具有一定的临床意义。
- 荆颖罗燕萍叶坤李鑫叶丽艳张樱何赏王成彬
- 关键词：沙门菌属
- MALDI-TOF MS在临床曲霉菌鉴定中的应用被引量：3
- 2018年
- 目的 探讨基质辅助激光解析电离飞行时间质谱技术（MALDI-TOF MS）在临床曲霉菌属鉴定中的应用,并评价其鉴定性能.方法 以ITS测序结果为金标准,对解放军总医院2017年5月至2018年4月临床分离的曲霉菌属采用VITEK MS V3.0进行鉴定,并对结果进行分析.结果 通过V3.0数据库（含12种曲霉菌图谱）鉴定了9种曲霉菌,占总体分离菌株的86.24%.VITEK MSV3.0的鉴定符合率为91.49%,未获得结果的占16.51%;菌属符合率为93.62%,其中仅有两株杂色曲霉鉴定到属水平.根据鉴定置信度进行统计,88.30%的菌株获得了99%以上的鉴定率.首次未获得鉴定结果的占13.83%,鉴定错误率3.19%,二次提取后再次进行质谱鉴定未鉴定菌株降低到6.38%,鉴定错误率降到2.13%;结合传统鉴定和VITEK MS鉴定手段,属正确率为98.94%,种正确率为93.62%;其他真菌对曲霉菌鉴定的影响度为0%.结论 MALDI-TOF MS作为传统鉴定方法的有力补充,应用于曲霉菌鉴定给工作带了很多便捷,提高了种水平鉴定准确率,使得真菌实验室鉴定水平得到了提高.
- 叶丽艳王强沈跃云叶坤马薇陈刚杨继勇罗燕萍
- 关键词：曲霉菌属光谱法基质辅助激光解吸电离
- 人工智能在疟原虫检测中的应用进展
- 2022年
- 尽管全球处于新冠疫情流行阶段,但目前疟疾仍是人类健康的主要威胁之一,每年世界范围内约有2亿疟疾确诊新发病例,其中约40多万死亡病例.疟疾的及时诊断对减少传播和降低死亡率都至关重要.为提高边远贫穷地区疟疾的诊断水平,以深度学习算法为基础的人工智能模型逐渐应用于显微镜检测技术以诊断血涂片中的疟原虫.本文综述了此类技术的原理,介绍了当前人工智能模型在疟疾显微镜诊断中的最新进展,并展望了深度学习和智能手机在疟疾诊断领域的应用前景.
- 杨姗李艳冰刘拓宇张海东叶坤崔玉军张先超滕越
- 关键词：疟原虫疟疾感染人工智能图像检测
- 血液病患者血流感染的病原学特征及干细胞移植术对其的影响
- 2023年
- 目的了解血液系统恶性肿瘤患者治疗期间发生血流感染的病原菌流行病学特征并比较异基因造血干细胞移植(allogeneic hemato-poietic stem cell transplantation,Allo-HSCT,简称HSCT)对其的影响,为血流感染诊疗提供依据。方法收集2017—2021年解放军总医院第一医学中心血液科发生血流感染的住院病例,根据是否行HSCT分为HSCT和N-HSCT两组,分析比较两组血流感染病原菌的流行病学特征及其影响。结果共收集292例病例,362株病原菌,HSCT组(84例)106株,N-HSCT组(208例)256株;急性髓系白血病(130/392,44.52%)发生血流感染较多见,其次是非霍奇金淋巴瘤(74/292,25.34%);发生1次血流感染的比例HSCT组高于N-HSCT组,发生2次血流感染的比例NHSCT组较高;病原菌以革兰阴性杆菌为主(56.08%),大肠埃希菌占绝对优势(109/362,30.11%),其次是肺炎克雷伯菌(39/362,10.77%);革兰阳性球菌以凝固酶阴性葡萄球菌(107/362,29.56%)为主;HSCT组的真菌检出率(10/106,9.43%)高于N-HSCT组(9/256,3.52%);常见病原菌的耐药率均处于较高水平,多重耐药菌株存在一定比例(铜绿假单胞菌除外);HSCT组凝固酶阴性葡萄球菌对青霉素、庆大霉素、莫西沙星、克林霉素、利福平的耐药率高于N-HSCT组;HSCT组的大肠埃希菌对哌拉西林/他唑巴坦、头孢类抗生素和厄他培南的耐药率高于N-HSCT组。结论血液系统恶性肿瘤患者血流感染的病原种类复杂多样,多次感染和多个病原菌的检出给临床诊疗带来了困难。HSCT患者有较高的真菌血流感染风险和多重耐药菌株检出,因此,对HSCT患者的血流感染及多重耐药菌株应加强监测。
- 蔡雅楠叶丽艳张光存马薇郭玲王丽凤马艳宁叶坤杨继勇
- 关键词：血液系统恶性肿瘤血流感染耐药率
- 致血流与腹腔共同感染大肠埃希菌表型和基因型特征分析
- 2023年
- 目的分析致血流与腹腔共同感染大肠埃希菌(CoECO)的表型和基因型特征,为经验性抗感染治疗提供线索。方法回顾性分析2010至2020年解放军总医院第一医学中心检验科自血液和腹腔标本中分离出的大肠埃希菌菌株。使用质谱鉴定仪鉴定菌种。使用全自动细菌鉴定药敏仪测定最小抑菌浓度。采用2×150 bp双末端测序策略对大肠埃希菌进行高通量测序。基因组序列经拼接后,使用kSNP3软件对菌株序列进行单核苷酸多态性(SNP)分析,以明确菌株间的同源关系;若分离自两部位的菌株具有较高同源关系,视为同一菌株,则该病例为CoECO感染病例。使用PubMLST网站确定多位点序列型(MLST),使用CARD网站筛选耐药基因。结果共筛选出70例CoECO感染病例,其中男45例,女25例,年龄(59.2±16.3)岁。每例CoECO感染病例选取1株大肠埃希菌进行后续分析,共计70株,分属于35种ST型,菌株数量较多的ST型包括:ST38(n=6)、ST405(n=6)、ST1193(n=6)、ST131(n=5),其他ST型所含菌株均少于5株。菌株间同源关系比较分散,整体呈现散发趋势,仅有个别菌株引起了小规模爆发。药敏结果显示:大肠埃希菌对氨苄西林的耐药率最高(91.4%,64/70),其次为氨苄西林/舒巴坦(74.3%,52/70)、头孢曲松(72.9%,51/70)、环丙沙星(71.4%,50/70)、左氧氟沙星(71.4%,50/70);对哌拉西林/他唑巴坦、碳青霉烯类和阿米卡星保持较高敏感性。耐药基因携带数量最多的是tet(A/B)(70.0%,49/70),其次分别为bla_(TEM)(58.6%,41/70)、sul1(55.7%,40/70)、sul2(54.3%,38/70)、bla_(CTX-M-14)(25.7%,18/70)、bla_(CTX-M-15)(17.1%,13/70)、bla_(CTX-M-55)(15.7%,11/70)、bla_(CTX-M-64/65)(5.7%,4/70)、bla_(CTX-M-27)(4.3%,3/70)、mcr-1(4.3%,3/70)、bla_(NDM-5)(2.9%,2/70)。结论CoECO整体呈散发分布,无明显优势克隆,未发现具有明显优势的基因型;菌株虽然对部分抗菌药物耐药率较高,但携带耐药基因比例较低,对部分一线抗菌药物有较高敏感�
- 宫天野郭玲叶坤赵强叶丽艳马艳宁王丽凤杨继勇
- 关键词：血流感染腹腔感染大肠埃希菌高通量测序多位点序列分型
- 品管圈助力医技质量管理水平提升被引量：3
- 2017年
- 在医技科室开展品管圈活动,可以创建积极向上的科室文化,有效提高医技人员工作效率、医疗服务质量和临床满意度等。对医技品管圈开展情况进行介绍,通过微力圈、闪电圈、同心圈3个案例介绍了其开展实效。指出在医技品管圈开展过程中,选定合适的主题十分重要,应科学运用质量管理工具,注重激发员工自动自发的精神潜力等。
- 马薇叶丽艳马艳宁叶坤张有江杨继勇罗燕萍
- 关键词：品管圈医技科室质量管理
