张慧娟
- 作品数：19 被引量：29H指数：2
- 供职机构：台州学院生命科学学院更多>>
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- 相关领域：农业科学生物学医药卫生更多>>
- 绿萝叶腐病病原菌16S rDNA序列的克隆与分析
- 2020年
- 为绿萝叶腐病病原菌菌株LR12的分子鉴定和应用研究提供参考,利用PCR法克隆其16S序列,并借助生物信息学方法进行分析,明确其16S rDNA序列特征。结果表明:以YFUP/YFDN为PCR引物,扩增到大小约为1700 bp的条带;LR12的16S rDNA全长为1551 bp,GC为53.9%;LR12与胡萝卜软腐果胶杆菌胡萝卜亚种的16S rDNA相似性最高,达100%,与巴西亚种的相似性次之,为99.9%,两者存在2个碱基的差异;15种细菌在发育树上可分为5组,其中LR12与胡萝卜软腐果胶杆菌巴西亚种的关系最近,处于同一分支,支持率达100%,并与其他2种果胶杆菌属细菌聚在同一组。
- 邬张颖徐凡舒钟依妮马佳莹朱欣张慧娟蒋明
- 关键词：绿萝克隆
- 青花菜转录因子基因BoiWRKY8及其与抗病性的关系
- 2024年
- WRKY转录因子是植物特有的一类调控蛋白,在抵御生物和非生物逆境中起着重要作用。为初步明确该基因在抗病反应中的功能,本研究在分离青花菜BoiWRKY8基因的基础上,利用生物信息学方法进行序列分析,采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)明确其在核盘菌、灰霉菌侵染下的表达模式,并对过量表达植株进行抗病性鉴定。结果表明,BoiWRKY8的基因组全长为3170 bp,具2个内含子,长度分别为776和1422 bp。编码区全长为972 bp,编码323个氨基酸,WRKY结构域由60个氨基酸组成,包括一个WRKYGQK序列和一个C_(2)H_(2)锌指结构C-X_(4)-C-X_(23)-H-X_(1)-H。系统发育分析结果表明,BoiWRKY8与芸薹属植物的同源序列聚为一组,支持率达100%,与野甘蓝的关系最近。qRT-PCR结果显示,BoiWRKY8受核盘菌和灰霉菌的诱导,在6和12 h时的表达量最大,为对照的3.18/2.68和3.22/2.90倍;BoiWRKY8过量表达植株对核盘菌、灰霉菌的抗性显著增强,JA/ET通路标志基因BoPDF1.2的表达量显著提高。本研究结果为后续开展青花菜抗病机理研究和分子育种奠定了基础。
- 蒋明何佳薇方宇洁尹龙飞张慧娟
- 关键词：青花菜核盘菌灰霉菌
- 黄岩凤仙花叶绿体atpB-rbcL序列的克隆与分析
- 2023年
- 【目的】探明黄岩凤仙花(Impatiens huangyanensis)atpB-rbcL序列的特征及其分类地位,为后续开展遗传结构和遗传多样性研究奠定基础。【方法】在野外采样后利用PCR方法克隆黄岩凤仙花的atpB-rbcL全长,借助生物信息学手段进行序列分析,并构建系统发育树。【结果】黄岩凤仙花atpB-rbcL序列的全长为764 bp,GC值为27.5%;与淡黄绿凤仙花(I.chloroxantha)、阔萼凤仙花(I.platysepala)和武夷凤仙花(I.wuyiensis)的相似性最高,达98%以上;经多重比对,凤仙花属植物atpB-rbcL存在较多的插入、缺失、转换和颠换现象;经系统发育分析,黄岩凤仙花与淡黄绿凤仙花、阔萼凤仙花和武夷凤仙花处于同一组,亲缘关系最接近。【结论】叶绿体atpB-rbcL具有较高的变异,可用于黄岩凤仙花的分子鉴定。
- 朱晏吴倩田盛野张慧娟蒋明
- 关键词：ATPB-RBCL克隆分子鉴定系统发育
- 蜘蛛抱蛋(Aspidistra elatior)炭疽病病原菌的分离与鉴定被引量：1
- 2021年
- 为明确蜘蛛抱蛋(Aspidistra elatior)炭疽病病原菌的种类,本研究对采集的炭疽病样本进行分离纯化培养,得到1株蜘蛛抱蛋炭疽病病原真菌YYL,采用针刺回接实验测定其致病性,并在形态学鉴定基础上,克隆其ITS、ACT、GAPDH和CAL片段进行多基因联合鉴定。结果表明,该病原菌具有较强致病性,其菌落、菌丝和分生孢子形态符合百合炭疽菌(Colletotrichum lilii)的特征,且与百合炭疽菌相似度最高,其ITS和ACT序列与百合炭疽菌完全一致。综合形态学特征和分子生物学鉴定结果,确定引起蜘蛛抱蛋炭疽病的病原菌为百合炭疽菌。
- 黄钰婷孙洁张慧娟朱晏蒋明
- 关键词：蜘蛛抱蛋炭疽病病原菌
- 青花菜乙烯反应传感蛋白基因BoERS的克隆与表达分析被引量：1
- 2019年
- 乙烯反应传感蛋白在乙烯信号转导中起着重要作用,可作为负调控因子使下游的CTR1失活,并激活之后的一系列反应。为明确青花菜ERS基因的序列特征和表达特点,本研究以青花菜为试验材料,在克隆乙烯反应传感蛋白基因BoERS的基础上进行表达分析,以明确其在核盘菌和根肿菌侵染下的表达模式。结果表明,BoERS的基因组DNA全长为1 928 bp,含有1个长度为68 bp的内含子;编码区全长为1 860 bp,编码619个氨基酸,编码蛋白有4个跨膜结构域、1个GAF结构域和1个HisKA结构域。序列比对结果表明,BoERS与芸薹属ERS序列的差异最小,在系统发育树上处于同一分支,但与萝卜属、盐芥属和拟南芥属植物ERS序列的差异较大,在系统发育树上处于不同的分支。实时荧光定量PCR结果表明,BoERS的表达受核盘菌的诱导,36 h时表达量最大,为对照的3.53倍,但BoERS的表达不受根肿菌的诱导。本研究结果为进一步开展BoERS基因功能鉴定和应用研究奠定了理论基础。
- 蒋明张志仙张慧娟管铭陈孝赏尹龙飞刘洁
- 关键词：青花菜核盘菌根肿菌
- 细辛属8种药用植物rDNA ITS的克隆与序列分析被引量：1
- 2017年
- 目的克隆和分析8种细辛属药用植物的ITS序列,为开展该属植物分子鉴定和遗传多样性研究奠定基础。方法以基因组DNA为模板,利用PCR法克隆ITS全长序列,借助生物信息学软件对序列进行比对分析,并构建系统发育树。结果测序结果表明,8种细辛属植物的ITS全长为637~646 bp,其中的5.8 S序列最为保守,长度和碱基组成完全一致;ITS1与ITS2均存在一定的变异,它们的长度分别为255~257 bp和226~232 bp,序列中出现大量插入/缺失和转换/颠换现象,ITS1、ITS2的可变位点和简约信息位点数分别为46/30和14/9。系统发育分析结果表明,8种细辛属植物在进化树上可分为4组,与传统分类结果完全一致,I^IV分别对应细辛组、华细辛组、长花组和杜衡组。结论 8种细辛属植物ITS序列具有丰富的信息位点,可用于这些植物的分子鉴定。
- 蒋明吴丹李嵘嵘张慧娟贺蔡明
- 关键词：RDNAITS序列分子鉴定
- 西兰花表皮特异硫蛋白基因的克隆与表达分析被引量：1
- 2022年
- 表皮特异硫蛋白在硫代葡萄糖苷代谢调控中起着重要作用,包括催化异硫氰酸酯生成环腈类和腈类物质。本研究以西兰花为试验材料,在克隆表皮特异硫蛋白基因BoiEPS的基础上进行序列分析和表达分析,并初步明确其在野油菜黄单胞菌侵染下的功能。结果表明,BoiEPS基因全长1270 bp,有1个长度为238 bp的内含子;编码区全长1032 bp,编码343个氨基酸,编码蛋白具有2个Kelch结构域。系统发育分析结果表明,BoiEPS与来自芜菁、甘蓝型油菜的EPS聚为一组,但与其他十字花科植物的EPS处于不同分支。实时荧光定量PCR结果表明,BoiEPS的表达受野油菜黄单胞菌的诱导,在24 h的表达量最大;BoiEPS的过量表达可显著提高西兰花对黑腐病的抗性,病程相关蛋白基因BoPR1的表达量在3个过表达株系均明显增加。本研究结果为后续开展西兰花-黑腐病抗性机理研究奠定了理论基础。
- 蒋明苗立祥朱晏吴嘉婧吴倩张慧娟
- 关键词：西兰花野油菜黄单胞菌
- 濒危植物多花帚菊叶枯病病原菌的分离与鉴定
- 2023年
- 多花帚菊(Pertya multiflora)为浙江省特有种,植株数量十分稀少,该植物叶枯病的发生较为严重,但病原菌的种属尚不明确。本文采用组织分离法对病原菌进行分离、纯化,在致病性鉴定、形态学观察的基础上,结合分子生物学手段进行鉴定。研究结果表明:经分离、纯化,获得一株真菌,定名为DHZJJ;致病性鉴定得出,该真菌能侵染多花帚菊的叶片,发病症状与自然生境下病害特征一致;形态学观察得出,该菌在生长初期的菌落呈白色,后加深成淡褐色,菌丝圆柱形、具隔、无孢子且菌丝分支近直角,符合角担菌属(Ceratobasidium)真菌特征;克隆RPB2和LSU片段进行多基因联合鉴定,发现DHZJJ与角担菌属真菌的亲缘关系最近。通过对多花帚菊叶枯病病原菌的分离与鉴定,以期为后续开展病害的科学防治和濒危物种保护奠定基础。
- 黄雯馨吴倩田盛野刘烨张焱琴顾航张慧娟蒋明
- 关键词：病原菌叶枯病
- 锈毛钝果寄生叶绿体基因组的序列特征和系统发育分析被引量：1
- 2023年
- 目的 以药用植物锈毛钝果寄生Taxilluslevinei为材料,在高通量测序、组装的基础上,明确叶绿体因组的结构、序列特征和系统发育关系。方法 利用SDS法提取基因组DNA,采用Illumina HiSeq X Ten进行高通量测序,用Novo Plasty组装叶绿体基因组,借助PhyML生成系统发育树。结果 锈毛钝果寄生的叶绿体基因组全长为122 208 bp,GC值为37.3%,大单拷贝区(large single copy region,LSC)、小单拷贝区(small single copy region,SSC)和反向重复区(inverted repeat region,IR)的长度分别为70 522、6084和22 801 bp;锈毛钝果寄生的叶绿体基因组共有基因108个,其中的编码蛋白基因、t RNA与r RNA分别为66、29和8个,另有5个假基因;inf A基因、所有的ndh基因及6个t RNA发生丢失。序列比对结果表明,锈毛钝果寄生与桑寄生T. sutchuenensis (Lecomte) Danser叶绿体基因组之间的相似性最高,达96.7%。系统发育分析结果表明,7种植物在发育树上分成5组,其中,锈毛钝果寄生与桑寄生和广寄生聚于一组。结论 锈毛钝果寄生叶绿体基因组的组装、序列分析和系统发育分析,为后续开展遗传结构和遗传多样性研究奠定了基础,并为桑寄生科植物的进化和系统发育研究提供了依据。
- 蒋明王军峰吴丹朱晏汤紫依何海叶张慧娟
- 关键词：桑寄生叶绿体基因组系统发育分析
- 华顶杜鹃叶绿体psbA-trnH序列的克隆与分析
- 2022年
- 以不同地理来源的华顶杜鹃叶片DNA为材料,采用PCR方法克隆叶绿体psbA-trnH,并利用生物信息学技术明确序列特征和系统发育关系。结果表明:华顶杜鹃psbA-trnH的序列长度为352~353 bp,GC值29.2%~29.3%;经多重比对后得出4个不同地理来源样品的psbA-trnH之间仅存在1个碱基的差异,但与其他杜鹃属植物同源序列间的差异较大;从系统发育分析得出,华顶杜鹃与其他14种杜鹃属植物在发育树上分为6组,其中,华顶杜鹃与长蕊杜鹃和毛棉杜鹃的亲缘关系最近,它们聚于同一分支。以期通过对华顶杜鹃叶绿体psbA-trnH序列的克隆与分析,为后续开展该珍稀濒危植物的遗传多样性研究奠定基础。
- 汤紫依吴倩田盛野何海叶朱晏张慧娟蒋明
- 关键词：华顶杜鹃PSBA-TRNH叶绿体克隆系统发育分析
