- 稽留流产中铁死亡相关基因的生物信息学分析
- 2023年
- 本研究旨在通过生物信息学分析,探讨铁死亡关键基因在稽留流产(MA)中的发生和发展中的作用,并初步确定潜在的生物标志物。方法 在相关人类疾病数据库GeneCards中以“Missed abortion”为关键词,搜索筛选MA相关基因。从FerrDb数据库下载铁死亡相关基因,将筛选出来的MA相关基因与铁死亡相关基因取交集获得MA铁死亡相关基因。利用DAVID数据库对MA铁死亡相关基因进行GO及KEGG通路分析。利用String数据库和Cytoscape软件分析蛋白互作网络,筛选Hub基因。最后,采用实时荧光定量PCR在正常人流组及MA组患者绒毛组织中检测最显著的Hub基因mRNA的表达水平。结果 筛选出来的MA铁死亡基因共74个。MA铁死亡基因GO功能富集主要在基因表达的正向调节、细胞外区、酶结合等。KEGG通路分析提示MA铁死亡基因主要富集在癌症通路、人巨细胞病毒感染通路、HIF-1信号通路等。筛选出的Hub基因前10位分别为TP53、STAT3、JUN、EGFR、PIK3CA、MAPK1、HIF1A、AR、MDM2、IL6。应用qRT-PCR对最显著的Hub基因TP53进行验证,结果显示,TP53在MA组中的表达高于正常对照组且有统计学意义(P<0.05)。结论 TP53、STAT3、JUN、EGFR、PIK3CA、MAPK1、HIF1A、AR、MDM2、IL6可作为稽留流产铁死亡的关键基因,TP53在MA绒毛中高表达且有统计学意义,有望成为防治稽留流产的新靶点。
- 张凤廖玉萍覃颖蒙海霞庞丽红
- 关键词：稽留流产生物信息学
