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一种基于整合分析的生物标志物选择方法及系统: 本发明公开了一种基于整合分析的生物标志物选择方法及系统，该方法包括下述步骤：选取原始测序数据；原始测序数据采用FANSe算法，进行mapping分析，得到基因定量信息，设定基因原始分组；采用GWGS算法计算基因在原始分组...; 刘婉婷张弓何庆瑜; 文献传递

A novel strategy of integrated microarray analysis identifies CENPA, CDK1 and CDC20 as a cluster of diagnostic biomarkers in lung adenocarcinoma: Scope: The integration of multiple microarray datasets from various platforms remained a challenge. The study ...; 汪洋张静刘婉婷李斌何庆瑜; 文献传递

一种抑制人USP46基因表达的siRNA和脂质体及其应用: 本发明提供了一种抑制人USP46基因表达的siRNA和脂质体及其应用。本发明合成的siRNA具有比较高的稳定性，能很好地抑制USP46基因的表达，可特异作用于USP46基因，通过纳米脂质体包封递送系统，将合成的siRNA...; 林棉杰刘婉婷张弓钟利叶

一种基于整合分析的生物标志物选择方法及系统: 本发明公开了一种基于整合分析的生物标志物选择方法及系统，该方法包括下述步骤：选取原始测序数据；原始测序数据采用FANSe算法，进行mapping分析，得到基因定量信息，设定基因原始分组；采用GWGS算法计算基因在原始分组...; 刘婉婷张弓何庆瑜; 文献传递

非模式细菌功能基因组获取策略比较被引量：1: 2017年; 高通量测序技术的发展以及成本的降低使得细菌基因组测序成为研究细菌的标准流程。但细菌基因组变异度大,近缘基因组修正以及基因组从头拼接各有利弊,如何准确获得更多的有效功能基因尚无系统性的研究。本研究对真实环境中分离的一株短小芽孢杆菌(Bacillus pumilus)进行基因组测序,使用近缘基因组修正、基因组从头拼接、修正完剩下的reads再拼接(修正+拼接)这3种策略进行对比拼接,评价各策略的效能:近缘基因组修正获得原有标准基因组中已有的基因更准确;基因组从头拼接能获得大部分有效基因,但会引入大量的假阳性;修正+拼接策略可兼顾二者,但引入的假阳性也是最多的。分析还发现,注释到门以下的拼接结果可靠性高,有效减少拼接引入的假阳性。本研究为环境微生物研究提供策略指导,将促进环境微生物功能基因组的研究。; 曹欣刘婉婷张弓; 关键词：基因组测序

利用蛋白质组学研究新德里金属β-内酰胺酶1对鲍曼不动杆菌的影响: 2018年; 【目的】比较临床分离的亲缘关系近的多药耐药鲍曼不动杆菌MDR-ZJ06(blaNDM-1–)和ABC3229(blaNDM-1+)的差异蛋白质组,以期发现新德里金属?-内酰胺酶1(New Delhimetallo-β-lactamase-1,NDM-1)对鲍曼不动杆菌生长代谢的影响。【方法】利用2-DE联合MALDI-TOF MS/MS技术鉴定差异表达蛋白,并在GO注析的基础上,对差异蛋白进行通路分析、功能分类和富集分析,并作出蛋白与蛋白相互作用网络。【结果】发现ABC3299相对于MDR-ZJ06有51个差异表达蛋白,其中11个蛋白表达上调,40个蛋白表达下调,并且这些差异蛋白主要涉及降低碳代谢、氨基酸代谢、脂肪酸代谢和细胞壁合成,增加铁离子转运系统形成。【结论】这个结果揭示了NDM-1可能是通过减缓细菌自身的代谢,增加自身铁的摄取使细菌机体系统地抵抗抗生素从而达到耐药。; 曾观娣徐倩刘婉婷阳小燕孙雪松; 关键词：鲍曼不动杆菌 NDM-1 多药耐药差异蛋白质组学

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刘婉婷