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石竹科系统学研究新进展: 2017年; 本文综述了近年来石竹科系统学研究的新进展。石竹科(Caryophyllaceae)约有86属,2200余种,全球广布,主要分布在北半球温带和暖温带地区,具有重要的观赏和药用价值。石竹科可追溯到晚白垩世,其多样化中心位于地中海和伊朗–突雷尼地区。传统上石竹科被分为3个亚科:繁缕亚科(Alsinoideae)、石竹亚科(Caryophylloideae)和指甲草亚科(Paronychioideae)。近来的分子系统学研究表明,从演化关系上分析石竹科传统分类并不合理,因为3亚科均不是单系类群。而最新提出的石竹科11族分类系统则得到较好支持,尽管尚不完善。这11个分支间的系统发育关系基本清楚,但大爪草族(Sperguleae)的单系支持率不高,而且一些大属的范围及单系性仍然存在争议。此外,大属里许多小属的准确位置仍然悬而未决。因此石竹科分类系统亟需进一步修订,其内部一些关键分类群需要重新划分。; 王淑敏李静武生聃王伟张林静; 关键词：石竹科分子系统学

青藏高原高山区和泛北极地区种子植物多倍体比较被引量：2: 2021年; 多倍化是植物快速适应极端环境胁迫的一种重要机制。青藏高原高山区和泛北极地区具有相似的极端低温环境,且两地的植物曾有密切的交流和联系。然而,多倍体物种对两地植物区系生物多样性的贡献是否相同仍不清楚。我们系统地收集两地已有染色体数目和倍性报道的种子植物物种名录,共计1,770种,其中青藏高原高山区774种,泛北极地区996种;同时也相应地收集了每个物种的生活型信息。分析显示青藏高原高山区多倍体植物的比例为20.9%,泛北极地区多倍体植物比例为61.5%;青藏高原高山区一年生草本、多年生草本和木本植物中多倍体的比例分别为20.7%、21.6%和12.8%,泛北极地区一年生草本、多年生草本和木本植物中多倍体的比例分别为60.2%、65.5%和38.3%。这些结果表明泛北极地区比青藏高原高山区具有较高比例的多倍体物种。青藏高原高山植物区系在渐新世-中新世之交开始兴起,此时高原已达到一定高度,而后的高寒环境相对稳定,致使多倍体物种相对较少;而泛北极地区植物区系在3–4 Ma兴起,此后经历了冰期-间冰期、海平面波动等反复剧烈的气候环境变化,可能促进了大量的多倍化事件发生。本研究通过比较青藏高原高山区和泛北极地区植物多倍体物种的比例,揭示了两地多倍体比例差异的可能原因,将提高对多倍体适应极端环境的理解。; 张军彭焕文夏富才王伟; 关键词：青藏高原多倍化生活型

欧亚大陆东部毛茛科植物多样性格局及主导因子被引量：3: 2021年; 毛茛科是真双子叶植物的基部类群之一,包含多种药用植物,具有较高的保护价值,但关于毛茛科物种多样性和谱系多样性大尺度格局及其影响因子的研究还比较匮乏,特别是以较高分辨率分布数据为基础的物种多样性格局研究尚未见报道。本文旨在:(1)建立欧亚大陆东部毛茛科植物分布数据库,估算不同生活型物种多样性和谱系多样性格局,并探究格局的形成机制。(2)分析毛茛科物种多样性和谱系多样性的相关关系,确定多样性热点地区,为毛茛科保护规划提供依据。根据中国、哈萨克斯坦、吉尔吉斯斯坦、塔吉克斯坦、土库曼斯坦、乌兹别克斯坦、蒙古和俄罗斯等国家的区域和地方植物志,建立了"欧亚大陆东部地区毛茛科物种分布数据库"。该数据库包含了欧亚大陆东部地区1,688种毛茛科物种的分布数据,空间分辨率为100 km×100 km。在此基础上,估算了毛茛科全部及不同生活型的物种多样性和谱系多样性格局,并利用广义线性模型和等级方差分离方法分析了毛茛科物种和谱系多样性格局与环境因子的关系。最后比较了物种多样性和谱系多样性的相关关系,确定了毛茛科的古热点地区。结果显示:(1)欧亚大陆东部毛茛科植物物种和谱系多样性均呈明显的纬度格局,且在山区具有较高的多样性。(2)毛茛科植物物种和谱系多样性受现代气候、地形异质性和末次冰期以来的气候变化的共同影响,但不同影响因子的相对贡献率在物种和谱系多样性及不同生活型之间差异显著。(3)中高纬度地区的谱系多样性高于给定物种数的预期,是毛茛科的古热点地区,在毛茛科保护规划中应受到重视。; 李亦超陈永生Denis Sandanov罗奥吕童苏香燕刘云鹏王庆刚Viktor ChepinogaSergey Dudov王伟王志恒; 关键词：毛茛科草本植物木本植物物种多样性

植物DNA条形码在系统发育研究中的应用被引量：4: 2015年; 1常用植物DNA条形码物种的准确鉴定是开展科学研究和生物多样性保护的先决条件,但根据形态学特征进行物种鉴定对非专业人员而言比较困难。即使是专业人员,面对纷繁复杂的物种,要想逐一鉴定也难以实现。DNA条形码技术（DNA barcoding）为物种的快速、准确鉴定提供了可能（Hebert et al.,2003）。线粒体COI基因作为动物的DNA条形码已得到广泛应用。; 向小果王伟; 关键词：植物DNA 条形码技术系统发育物种鉴定 COI基因

植物生命之树重建的现状、问题和对策建议被引量：5: 2020年; 生命之树的概念源自1859年达尔文的《物种起源》,但利用分子数据重建植物生命之树的研究则在20世纪90年代才开始兴起。近年来,随着测序技术、分析方法和计算能力的快速发展,植物生命之树重建研究取得了显著成果。本文首先概述了当前以及未来很长一段时间内植物生命之树重建工作的重点,包括植物属级和种级水平的系统发育研究、植物系统发育基因组学研究、分子和形态数据联合分析、包括灭绝与现存植物类群的生命之树重建,以及超大植物生命之树重建等5个方面;然后简要概括国内植物生命之树重建研究的现状,指出了我国在植物生命之树重建领域发展中所存在的问题,并从"类群研究体系、学科评价体系、国家顶层设计,以及拓展国际合作"等方面对学科未来的发展提出了一些对策建议。; 王伟刘阳; 关键词：分子系统学系统发育基因组学形态学生命之树

基于分子数据的系统发生树构建: 2023年; 系统发生学是研究生物类群间进化关系的学科。随着测序技术、分析方法和计算能力的改进,分子数据被广泛应用,促进了系统发生学的快速发展。系统发生树已成为生态学和比较生物学等研究领域的有力工具。然而,许多研究在进行系统发生树构建时更侧重各种软件的使用,一些基本原则或注意事项有时会被弱化甚至忽视。该文详细介绍了基于分子数据进行系统发生树构建的工作流程和基本方法,包括类群取样、分子标记选择、序列比对、分区及模型选择、序列联合分析以及拓扑结构检验等关键步骤。此外,该文还为系统发生树构建常用的3种方法(最大简约法、最大似然法和贝叶斯法)提供了相应的软件操作流程和运行命令,以期为相关研究提供参考。; 彭焕文王伟; 关键词：分子系统学

被子植物APG分类系统评论被引量：15: 2017年; 随着植物分子系统学的兴起,被子植物系统发育研究取得了举世瞩目的进展。被子植物系统发育组提出了基于DNA证据的被子植物在目、科分类阶元上的分类系统,简称APG系统。本文简要概括了APG系统的主要成就:(1)验证了被子植物分类系统的可重复性和可预言性;(2)解决了一些依据形态学性状未能确定的类群的系统位置;(3)证明了将被子植物一级分类分为双子叶植物和单子叶植物的不自然性;(4)证实了单沟花粉和三沟花粉在被子植物高级分类单元划分中的重要性;(5)发现雄蕊的向心发育和离心发育在多雄蕊类群中是多次发生的,不应作为划分纲或亚纲的重要依据;(6)支持基于形态学(广义)性状划分的大多数科是自然的;(7)将一些长期认为自然的科四分五裂。同时,我们指出了尚需深入研究的几个问题:(1)如何将以分子数据建立的系统和以综合形态学证据建立的系统相协调;(2)依据APG系统的研究结果需要创立新的形态演化理论;(3)只以"单系群"作为划分科、目的依据值得商榷;(4)APG系统中一些目的分类没有可信的形态学共衍征;(5)依据APG系统需要做出一个自然系统的目、科检索表和目、科的特征集要。此外,我们对以亚洲,特别是东亚为分布中心的一些类群的系统关系或分类等级提出建议,包括八角科、芒苞草科、水青树科、火筒树科、马尾树科、七叶树科、槭树科、伯乐树科应独立为科,山茱萸科(广义)应分为山茱萸科(狭义)和蓝果树科(广义)。; 王伟张晓霞张晓霞陈之端; 关键词：被子植物分子系统学形态学单系

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王伟

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