国家自然科学基金(30470751)
- 作品数：12 被引量：40H指数：4
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- 造血干细胞移植供受体人群HLA-Cw基因遗传多态性研究被引量：7
- 2006年
- 目的调查了人类白细胞抗原(humanleucocyte antigen, HLA)Cw位点在中国汉族人群中的等位基因分布规律,为进一步研究Cw位点的遗传特征提供背景资料。方法采用序列特异性引物扩增技术对1285名无关个体进行HLA-Cw基因特异性分析,并对其分布规律进行统计学分析。结果共检测到23种HLA-Cw位点的等位基因,其中HLA-Cw*01、*03、*07、*08为主要基因型,其基因频率分别为0 .1529、0 .2385、0 .1747、0 .1004 ,并检出HLA-Cw*12、*14、*15、*16、*17等血清学方法不能鉴定的HLA-Cw基因;统计结果表明HLA-Cw位点的基因分布符合Hardy-Weinberg平衡(χ2=73 .74 ,df=98 ,P>0 .5)。结论本研究结果为中国汉族人群提供了一套较为完整HLA-Cw基因遗传学参数。
- 刘金锋孙玉英金荔梁飞刘楠袁方骆媛刘曙光宋新强奚永志
- 关键词：遗传多态性汉族人群
- 人类白细胞抗原分子遗传中的基因重组被引量：11
- 2005年
- 深入研究人类白细胞抗原(humanleucocyteantigen,HLA)基因重组的分子生物学特性,对于揭示其等位基因多样性形成的演化机理以及人体所具有的抵抗多样致病微生物的防御能力具有重要意义。国外学者通过家系调查研究、统计学分析等方法估算了HLA的重组频率,证实了一些重组发生的热点,并且对重组的单倍型特异性、序列基序特异性、性别特异性等进行了深入研究。本文就HLA重组的交换频率、重组热点以及其它特性的研究现状作一综述。
- 骆媛孙玉英奚永志
- 关键词：人类白细胞抗原分子遗传基因重组同源染色体
- 一种罕见的人类白细胞抗原HLA-B/Cw座位间的基因重组被引量：7
- 2006年
- 目的探讨人类白细胞抗原复合体HLA-B/C座位间的基因重组。方法采集拟进行造血干细胞移植的一例患者(男,39岁)及其妻女的外周血标本,首先对其HLA-Ⅰ、Ⅱ类区域的5个经典基因位点进行顺序特异引物PCR(PCR-SSP)低、高分辨基因分型及SBT分析,然后再进行遗传家系分析研究,确定HLA基因重组相关位点。结果HLA高分辨基因分型的结果证实患者(AML-M5患者)的2条单倍型分别为A2402101-Cw030401/0402-B1301-DRB10406-DQB1030302/0303与A02011-Cw150201/0202-B4002-DRB11405-DQB105031;其女儿的2条单倍型分别为A02011-Cw150201/0202-B1301-DRB10406-DQB1030302/0303与A2406-Cw0602-B1302-DRB1070101/0102-DQB10202;患者配偶的2条单倍型则分别为A330301/0302-Cw030201/0202-B5801-DRB117-DQB10202与A2406-Cw0602-B1302-DRB1070101/0102-DQB10202。从遗传家系分析显示,患者的女儿所携有的父源A02011-Cw150201/0202是源自父亲的一条染色单体,而B1301-DRB10406-DQB1030302/0303则源自父亲的另一条染色单体,这表明父亲的2条染色单体在减数分裂时HLA-B和-Cw基因座位间发生了重组,即2条染色体间发生了交换,重组后的单倍型又完整地遗传给了女儿。结论首次在国际上发现并证明了一例罕见的中国汉族人群HLA-B/C基因座位间的基因重组家系,这为更深入的研究HLA重组机制奠定了坚实基础。
- 骆媛孙玉英金荔梁飞刘楠宋新强袁方刘曙光刘金锋奚永志
- 关键词：人白细胞抗原
- HLA-A/B/C/DRB1/DQB1基因多态性与急性淋巴细胞白血病关联分析被引量：4
- 2013年
- 目的探讨人类白细胞抗原(HLA)-A/B/C/DRB1/DQB1基因多态性与急性淋巴细胞白血病(acute lymphoblastic leukemia,ALL)的关联性。方法采用聚合酶链反应序列特异性引物(PCR-SSP)分型技术对277例ALL患者以及1370例健康无血缘关系对照组进行HLA-A/B/C/DRB1/DQB1基因分型,并将结果采用病例对照研究方法进行基因频率、单倍型频率以及疾病发生相对危险率(RR)的研究。结果 ALL患者Cw7的基因频率较对照组升高(P<0.05),其RR为6.0202;而HLA-A30、B13及Cw4基因频率较对照组降低(P<0.05);其RR分别为0.5181、0.6907和0.4769。两位点单倍型B13-Cw6在疾病组较对照组频率显著性升高(P<0.05),其RR为4.7861。两位点单倍型A30-B13、A30-DR7、B13-DR7以及扩展单倍型A30-B13-Cw6-DR7-DQ2在疾病组均较对照组频率显著性降低(P<0.05),其RR分别为0.3566、0.4933、0.4824和0.4052。结论我们在中国汉族人群中通过大样本量的病例对照研究来探寻HLA基因多态性与ALL之间的关联性,并取得了初步结果。HLA-Cw7与ALL的易感性相关;HLA-A30、B13、Cw4基因频率则与ALL发生呈负相关,可能是ALL的保护性基因;某些HLA单倍型亦与ALL的发生有关。
- 刘楠林晓娥袁方梁飞代东发孙玉英奚永志
- 关键词：急性淋巴细胞白血病人类白细胞抗原基因型基因频率
- 中国汉族白血病患者及其相关人群罕见的HLA-DR/DQ连锁不平衡研究
- 2006年
- 目的研究中国汉族白血病患者及其相关人群罕见的HLA-DR/DQ连锁不平衡单倍型。方法对2000-2005年在我院进行异基因造血干细胞移植前HLA配型的白血病患者及与患者有血缘关系的家系供者共1500例的血液标本,采用低分辨序列特异性引物聚合酶链反应(PCR-SSP)方法进行HLA-DR/DQ基因分型,并对两位点间连锁不平衡参数进行统计学分析。1500例中患者650例,平均年龄25岁;家系供者850例,平均年龄42岁。结果在41例的血液标本中发现13种罕见的连锁不平衡单倍型,主要为HLA-DQ8或HLA-DQ9与不同DR位点的连锁。其中DR14/DQ4、DR4/DQ5、DR9/DQ6、DR9/DQ7、DR8/DQ8、DR9/DQ8、DR12/DQ8、DR13/DQ8和DR14/DQ9共9种单倍型尚未见报道。650例白血病患者中有20例存在12种罕见的连锁不平衡单倍型,850例家系供者中有21例存在8种罕见的连锁不平衡单倍型。DR8/DQ8单倍型只见于家系供者,而DR14/DQ4、DR12/DQ6、DR11/DQ8、DR13/DQ8和DR14/DQ9单倍型则只见于白血病患者。41例HLA-DR/DQ基因分型结果显示,连锁不平衡单倍型与DR52(DRB3)宽抗原相关联者占58.5%(24/41),与DR53(DRB4)宽抗原相关联者占36.6%(15/41),而与DR51(DRB4)宽抗原相关联者仅占4.9%(2/41)。所发现单倍型频率最高的为DR12/DQ8(0.0023)和DR9/DQ8(0.0023),其次为DR11/DQ9(0.0020)和DR12/DQ9(0.0017)。13种连锁不平衡单倍型的绝对及相对连锁不平衡参数均为负值,说明它们在中国汉族人群中较为罕见,并处于连锁不稳定状态。结论发现了罕见的DR/DQ连锁不平衡单倍型,对补充中国汉族人群HLA-DR/DQ基因的连锁不平衡类型,提高HLA分型结果的准确性具有一定意义;同时,DR/DQ连锁不平衡单倍型在不同人群中的差异为疾病关联研究提供了思路。
- 梁飞罗卫东刘楠金荔袁方孔繁华孙玉英奚永志
- 关键词：HLA基因分型单倍型
- 参照链介导的构象分析策略在HLA-B位点分型中的临床应用研究
- 2005年
- 目的建立并稳定HLAB位点的参照链介导的构象分析(RSCA)系统,并鉴定RSCA分型策略的优势。方法提取27例造血干细胞移植患者及63名供者的外周血DNA,采用RSCA进行HLAB位点分型,并与序列特异性引物聚合酶链反应技术(PCRSSP)分型结果进行比较,对于疑难标本采用测序鉴定。结果在90份标本中,87份(96.7%)可明确判定结果,其中有1份标本与PCRSSP结果不一致,经测序鉴定RSCA结果正确;67份(74.4%)可直接指定等位基因型别。此外,1份标本(1.1%)因PCR扩增结果太弱而未能获得RSCA分型结果,2份标本只能确定1条等位基因,经测序发现另1条等位基因为已知等位基因,但RSCA数据库中没有其数据。随机选择20份标本进行RSCA重复性实验,重复率为100%。在PCRSSP方法分型中,约有10%的标本需要重复1～3次方能判定结果。结论RSCA具有灵敏、特异、分辨率高、重复性好、可发现变异基因及新的等位基因、大规模和低成本等优点,适用于大规模的无关移植供、受者的选择。
- 赵丹丹孙玉英刘楠梁飞金荔奚永志
- 关键词：介导PCR-SSP方法序列特异性引物外周血DNA基因型别变异基因
- HLA-A*110104新等位基因的克隆与序列分析被引量：2
- 2006年
- 目的识别并确认中国人群HLA新等位基因。方法采用基因克隆、测序及生物信息学技术,分析HLA新等位基因与HLA已知基因序列的差异。建立HLA新等位基因序列特异引物聚合酶链反应(PCR-SSP)分型方法,并对1200名HLA-A*11阳性的造血干细胞移植无关供者(包含100名HLA-A*11纯合子个体)进行HLA新等位基因筛选和频率分析。结果HLA新基因与A*110101的差异只是在外显子3区域中279位碱基发生C→T突变,导致93位密码子由CAC变为CAT,但氨基酸未发生变化,并最终被世界卫生组织HLA因子命名委员会正式命名为HLA-A*110104。该新基因出现在2个无关家系中,分别具有2～3代遗传史。在1200名无关供者中未发现其他带有新基因的个体。其基因频率为0．000 83。结论HLA-A*110104新基因具有稳定的遗传性和一定的普遍性,对无关供者的选择和人类学、遗传学等的研究具有一定意义。
- 刘曙光孙玉英骆媛刘金锋金荔梁飞袁方刘楠奚永志
- 关键词：等位基因碱基突变造血干细胞移植
- 焦磷酸测序——HLA基因高分辨分型的新策略被引量：2
- 2005年
- 刘曙光孙玉英奚永志
- 关键词：HLA基因焦磷酸测序异基因造血干细胞移植移植物抗宿主病器官移植
- 人类白细胞抗原-B＊2704／B＊2705重链拮抗肽的筛选和初步鉴定
- 2008年
- 目的从噬菌体展示随机12肽库筛选人类白细胞抗原（HLA）-B＊2704及B＊2705重链拮抗肽并做初步鉴定。方法用HLA—B＊2704／B＊2705重链胞外区蛋白分别筛选噬菌体展示随机肽库，酶联免疫吸附试验（ELISA）鉴定阳性克隆，DNA测定确定氨基酸序列，免疫荧光和流式细胞术鉴定噬菌体克隆分别与HLA—B＊2704及B＊2705细胞株结合的特异性。结果经3轮筛选，获得12个HLA—B＊2704拮抗肽，共有5种序列，分别为HTSFCSTHLCLI（×4），QHCSPTLCQIHR（×5），ARCTITLCYLSN（×1），YGLCTDWYCHIT（×1），YPLCDAILCRLP（×1）；10个B＊2705拮抗肽共有4种序列，分别为：①SHCSPHWCALPF（×6）；②HLCSNSLCLLPW（×2）；③EPMCSWFWCTLP（×1）；④WTCSPLLCTWGA（×1）。比对分析表明，B＊2704与B＊2705拮抗肽的序列是基本一致的，均含有CS（T）TXXL（W）CXL表位。展示有B＊2704拮抗肽的噬菌体克隆可与HLA—B＊2704细胞株结合，阳性率为43．55％；而B＊2705拮抗肽噬菌体克隆与HLA—B＊2705细胞株的阳性结合率为45．69％。结论筛选获得的HLA—B27拮抗肽的噬菌体克隆具有一定的亲和力，可与表达于细胞株表面的B＊2704和B＊＊2705分子特异性结合，而与正常B细胞不结合，因而表现出一定的结合特异性。
- 李彦博孙玉英张立新骆媛郭斯启陆浩军奚永志
- 关键词：肽库拮抗肽
- 群体反应性抗体检测技术的新进展——免疫磁珠流式细胞仪技术被引量：1
- 2006年
- 毋庸置疑，补体依赖的抗-HLA抗体是介导尸体器官移植后严重排斥（超急或加速排斥）反应的元凶。群体反应性抗体（panel—reactive antibody，PRA）是患者HLA抗原致敏的结果，临床上常因怀孕、输血或接受器官移植而产生，它与移植物排斥反应及存活率密切相关。PRA分析是反映移植受者体内抗-HLA抗体水平的实验方法，借助对受者预致敏状态的分析可识别受者不能接受的HLA基因。近年来的一些实验研究结果显示，这些PRA既有IgG抗体、Ign抗体和IgA抗体，也存在自身抗体，而自身抗体的存在不仅不会增加移植失败的危险，还会提高移植物存活率，所以真正对移植物存活和排斥反应有影响的抗体只有IgG。这就要求PRA检测技术既要有较高的灵敏度，又能够排除非IgG抗体的干扰。因此，对PRA检测技术的灵敏度、特异性等要求就相当高。
- 刘金锋孙玉英奚永志
- 关键词：流式细胞仪技术免疫磁珠移植物排斥反应HLA抗体
