北京大学理论生物学研究中心
- 作品数：5 被引量：3H指数：1
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生理学化学工程更多>>
- 疾病网络的多靶标药物控制策略研究
- ＜正＞多靶标药物治疗被认为是一种对抗复杂系统疾病的有效措施,然而何时以及如何有效地对疾病网络进行多靶标控制仍有待研究。我们采用系统生物学建模方法针对这两个问题进行了研究。首先,我们试图找出需要多靶标控制才能起到治疗效果的...
- 尹宁裴剑锋来鲁华
- 文献传递
- 芯片数据标准化方法比较研究被引量：3
- 2007年
- 在基因芯片实验中,基因表达水平之间的相关性在推断基因间相互关系时起到非常重要的作用.未经标准化处理的芯片数据基因之间往往都呈现出很强的相关性,这些高相关性一部分是由基因表达水平变化引起的,而另外一部分是由系统偏差引起的.对芯片数据进行标准化处理的目的之一是消除系统偏差引起的高相关性,同时保留由真正生物学原因引起的基因表达水平高相关性.虽然目前对标准化方法已经有了不少比较研究,但还较少有人研究标准化方法对基因之间相关系数的影响,以及哪种方法最有利于恢复基因之间的相关性结构.通过对基因表达水平数据的模拟,具体比较了几种常用标准化方法的效果,从而给出最有利于恢复基因之间相关性结构的那种标准化方法.
- 谈效俊张永新钱敏平张幼怡邓明华
- 关键词：基因芯片相关系数
- 生化网络动态变化的可视化系统
- 2009年
- 目前,生化网络体系的定量研究越来越重要,观察生化网络的动力学模拟结果是对其进行定量研究的重要手段。本文实现了一个交互式的展示生化网络动态变化的可视化系统:Intuitive View(IV,网址:http://mdl.ipc.pku.edu.cn/～ywang/ iv/)。该系统是基于Flash Action Script制作的软件,它通过几何图形大小和颜色的动画来呈现生化网络模型中化学物质和反应流随时间的变化,能够直观地显示用传统二维作图方法不易观察到的网络的特征,帮助发现有用的信息,从而为生化网络模型的定量研究提供了一种新的途径。IV可以免费用于学术研究。
- 王懿来鲁华欧阳颀
- 关键词：可视化生物信息学
- 基于结构的全新药物设计方法
- ＜正＞计算机辅助药物设计方法在过去几十年中得到了广泛的重视,在此基础上发展的基于结构的全新药物设计为药物设计提供了一个新的方向,也成为药物研发中一个非常重要的课题。然而以往的全新设计方法由于设计分子的合成性等问题,在应用...
- 苑亚夏裴剑锋来鲁华
- 文献传递
- Adjustment of systematic biases in PICR model for DNA copy number estimation based on SNP microarray data
- Affymetrix’s SNP array has been widely used for single-nucleotide polymorphism (SNP) genotyping and DNA Copy N...
- 汪泉曲江寒程晓行康永健钱敏平邓明华
- 文献传递
