复旦大学生物医学研究院蛋白质组学研究中心
- 作品数：2 被引量：14H指数：2
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- 人健康肝组织刀豆凝集素(Con A)结合型糖蛋白组学研究被引量：9
- 2006年
- 通过凝集素亲和层析技术结合双向电泳-质谱技术构建人健康肝组织Con A结合型糖蛋白数据库并进行生物信息学分析;利用研磨和匀浆两步法抽提人健康肝组织总蛋白,通过固相凝集素亲和层析获得与刀豆凝集素(Con A)结合型糖蛋白,经过双向电泳、荧光染色、图像分析获得人健康肝组织表达谱;通过MALDI-TOF-MS质谱鉴定及生物信息学分析获得人健康肝组织数据库,并建立了高重复性的人健康肝组织Con A结合型糖蛋白表达谱,图谱均点数为301±15,挖取139个蛋白点进行质谱鉴定,去冗余后确定了85个与细胞周期、代谢通路相关的蛋白质;通过NetNGlyc和NetOGlyc对糖基化位点进行预测,并按照geneontology对其功能定位等进行分类,并对其中与肿瘤发生发展相关的蛋白进行具体分析.由此可见,凝集素亲和层析结合2-DE,质谱鉴定是一种高通量的检测方法,Con A结合型糖基化修饰谱的构建为后续研究奠定了基础.
- 孙强玲刘银坤卢雯静程钢周海君周信文魏黎明代智郭坤陆皓杰
- 液相等电聚焦结合双向凝胶电泳分离碱性蛋白被引量：5
- 2006年
- 在蛋白组学研究中,经典的双向凝胶电泳法(2-DE)对碱性蛋白及低丰度蛋白的分离存在技术障碍,但预分离技术的应用可弥补其缺陷.液相等电聚焦可有效地分离富集复杂蛋白样品.碱性胶条用于2-DE可极大地提高蛋白上样量和凝胶分辨率.将上述两种技术相结合用于碱性蛋白质和低丰度蛋白质的分离鉴定,可使碱端区域双向凝胶图谱质量显著提高,蛋白点更清晰且点数增多,质谱鉴定确信度提高,碱性蛋白和低丰度蛋白质谱鉴定成功率提高,对于蛋白组学研究具有一定的意义.
- 钟华张扬樊惠芝杨芃原
- 关键词：双向凝胶电泳碱性蛋白
