孙枫
- 作品数：56 被引量：22H指数：1
- 供职机构：江苏省农业科学院更多>>
- 发文基金：江苏省农业科技自主创新基金国家自然科学基金公益性行业(农业)科研专项更多>>
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- 应答水稻黑条矮缩病毒侵染的osa-miR396d及其应用制作方法
- 本发明公开了一种应答水稻黑条矮缩病毒侵染的osa-miR396d及其应用。本发明还保护序列1所示RNA在抑制生长调节因子基因表达中的应用；所述生长调节因子如序列表的序列2所示。有望通过应用水稻中的osa-miR396d基...
- 兰莹周彤周益军李艳舞杜琳琳孙枫
- 文献传递
- 一种水稻抗性相关基因及其应用
- 本发明提供一种水稻抗性相关基因及其应用，属于植物分子生物学与植物遗传工程领域。本发明提供一种水稻蛋白质及其编码基因的应用：调控水稻对水稻黑条矮缩病和南方水稻黑条矮缩病的抗性；选育对水稻黑条矮缩病和南方水稻黑条矮缩病抗性增...
- 王招云周彤刘斌赵均良孙枫周炼周益军范永坚
- 宏病毒组测序检测豆蚜田间种群病毒种类
- 2023年
- 为探究蚜虫体内携带的病毒种类,采集江苏地区豆蚜田间种群,鉴定种类后,提取豆蚜总RNA,以片段化的mRNA为模板构建测序文库,利用宏病毒组测序技术检测分析豆蚜体内的病毒种类,并对获得的2个新病毒进行检测鉴定。结果显示,测序数据经拼接、比对和分类注释,最终共得到病毒序列177条,与24种病毒序列一致或同源性较高,包括5种植物病毒(属于5个病毒科)和19种昆虫病毒(涉及9个科和6种暂未分类病毒);对植物病毒中测序丰度最高的种类进行基因检测,获得序列经Blast比对,与其同源性较高的病毒均来自细胞质弹状病毒属,并且它们具有相同的保守区,确定该病毒为一种新的细胞质弹状病毒,暂命名为Aphis craccivoraassociated rhabdovirus(AcARV);基于病毒L蛋白系统进化分析显示,AcARV与水稻条纹花叶病毒(RSMV)构成最小分支,说明这2种病毒在进化上最为近缘;鉴定的多数昆虫病毒种类在蚜虫中鲜有报道;通过RT-PCR和蛋白免疫印迹在豆蚜体内均检测出昆虫病毒(HiPV)衣壳蛋白VP1,证实了HiPV对豆蚜的感染,这是首次在蚜虫体内发现HiPV,HiPV豆蚜分离物VP1基因与日本、江苏灰飞虱分离物核苷酸同源性分别为95.5%,99.0%。研究结果表明,豆蚜体内携带多种植物病毒,并含有一种新的弹状病毒AcARV,同时,豆蚜体内昆虫病毒种类非常丰富,HiPV可感染蚜虫。
- 朴君靳道然朴敬爱季英华孙枫李硕
- 关键词：豆蚜病毒种类
- 一种玉米品种抗粗缩病人工接种鉴定方法
- 本发明提供了一种玉米粗缩病品种抗性的人工接种鉴定方法。本发明的原理是在室内条件下以一定数量的接种体在玉米特定生育期接种待测玉米一定时间，培养待测玉米至发病显症后，根据病害发生的严重度评价待测玉米对玉米粗缩病的抗性水平。利...
- 周彤杜琳琳周益军曹晓燕吕建颖饶鸣帅王喜兰莹孙枫
- 文献传递
- 5号染色体上与LRGPP相关水稻干尖线虫抗性QTL连锁的SSR标记及其应用
- 本发明公开了一种与水稻干尖线虫抗性QTL连锁的分子标记。本发明的实质是根据连锁分离规律，以水稻干尖线虫抗病品种Tetep和淮稻5号杂交后代F<Sub>2</Sub>群体为作图群体，通过水稻干尖线虫抗性鉴定结果和SSR标记...
- 周彤杜琳琳周益军高存义兰莹孙枫
- 文献传递
- 水稻黑条矮缩病抗病基因RBSDV-6c及其编码蛋白
- 本发明公开了一种水稻黑条矮缩病抗病基因RBSDV‑6c及其编码蛋白和应用。该基因为序列表中SEQ ID NO：1所示的CDS序列。其编码蛋白为序列表中SEQ ID NO：3所示的氨基酸序列。本发明提供的水稻黑条矮缩病抗病...
- 周彤周益军杜琳琳施文娟兰莹孙枫
- 文献传递
- 江苏大豆上分离的豇豆轻斑驳病毒基因组序列克隆及特征分析
- 2022年
- 为明确豇豆轻斑驳病毒江苏分离物的基因组结构特征,阐明其分类地位及进化特点,选择采自江苏的CpMMV大豆分离物作为研究对象,针对病毒基因组序列设计了4对特异性引物,以病样总RNA反转录后获得的cDNA为模板,通过分段法对其基因组序列片段进行了PCR扩增,扩增产物克隆至T载体经验证后进行序列测定,获得的序列片段经拼接组装得到病毒全基因组序列。序列分析结果显示,CpMMV江苏分离物基因组核苷酸序列全长8194 bp,编码6个蛋白,5′端和3′端各含有一个非编码区(UTR),长度分别为72,117 nt;在编码的6个蛋白中,CP与其他分离物之间的同源性较高(96.5%~100.0%),相对保守;而RdRp(81.1%~98.2%)、TGB1(81.0%~97.0%)、TGB3(80.9%~95.6%)同源性相对较低,在不同分离物中表现较好的多样性;基于全基因组序列的系统进化分析结果显示,江苏分离物与已公开的其他CpMMV分离物同源性较高,共同聚类到一个大分支上,其中与中国安徽分离物同源性最高(98.2%),与海南分离物次之(96.0%),而与美国、巴西、印度、墨西哥、肯尼亚等国外分离物同源性相对较低(<82.7%)。这些研究结果表明,CpMMV江苏分离物与其他CpMMV分离物具有类似的基因组结构特征,在系统进化上,江苏分离物与国内分离物近缘而与国外分离物远缘。
- 吉颖孙枫吴淑华李硕涂丽琴高丹娜崔晓艳陈新季英华郭青云
- 关键词：大豆全基因组序列克隆
- 玉米品种抗粗缩病人工接种鉴定方法研究
- 2017年
- 为建立科学有效的玉米品种抗玉米粗缩病人工接种鉴定方法,分别研究了玉米接种苗龄、接种强度及接种时间3个因素对鉴定效果的影响。结果显示,玉米接种苗龄在芽鞘期、2叶1心期和4叶1心期接种无显著差异;在有效接种强度为3头/苗条件下,鉴定效果优于1~2头/苗处理;接种12~48 h条件下,鉴定效果优于6 h处理。由此构建了玉米粗缩病人工接种鉴定方法:在玉米芽鞘期至4叶1心期接种,接种时间12~48 h,有效接种强度3头/苗。在此条件下对玉米品种苏951进行接种鉴定,鉴定结果与重病区田间鉴定无显著性差异,表明所建立的人工接种鉴定方法能客观地反映玉米品种对玉米粗缩病的抗性水平。
- 杜琳琳吕建颖曹晓燕饶鸣帅施文娟兰莹孙枫程兆榜孟庆长袁建华周益军周彤
- 关键词：玉米粗缩病水稻黑条矮缩病毒人工接种抗性鉴定
- 利用RT-LAMP方法快速检测植株中水稻黑条矮缩病毒
- 本发明提供了一种水稻、小麦和玉米等植株上水稻黑条矮缩病毒的快速检测技术及其在病害诊断上的应用方法。利用这一方法可以排除南方水稻黑条矮缩病的干扰，快速鉴定出水稻黑条矮缩病毒植株样品，进而采取针对性的防治策略，减少病害带来的...
- 周彤周益军杜琳琳兰莹徐秋芳孙枫范永坚
- 基于基因组序列分析的烟草轻绿花叶病毒江苏辣椒分离物侵染性克隆构建
- 2023年
- 【目的】烟草花叶病毒属(Tobamovirus)是危害辣椒、烟草等茄科作物的主要病毒之一,严重影响蔬菜作物的种植和生产。本研究旨在探明侵染江苏省南京市辣椒的烟草轻绿花叶病毒(tobacco mild green mosaic virus,TMGMV)分离物(TMGMV-JS)的基因组结构特征、系统进化关系及其致病性,为TMGMV的防控提供科学依据。【方法】从江苏省南京市采集的辣椒病样,提取总RNA,利用TMGMV特异检测引物确认阳性后,设计病毒特异性全长引物扩增TMGMV-JS全基因序列,通过同源重组的方法克隆至pCB301植物表达载体上,获得TMGMV-JS分离物基因组序列和全长cDNA侵染性克隆。BLAST分析TMGMV-JS分离物与已报道分离物的同源性,利用MEGA7软件的邻接法进行系统进化分析。将侵染性克隆通过农杆菌浸润本氏烟和辣椒,经RT-PCR和Western blot检测验证侵染效果,测定TMGMV-JS分离物的致病性。【结果】侵染江苏省南京市辣椒的TMGMV全长序列为6356 nt,编码4个功能蛋白,分别为126K复制相关蛋白、183K复制酶、运动蛋白MP和外壳蛋白CP。同源性分析结果显示TMGMV-JS与重庆分离物TMGMV-TN29(MF139550)同源性最高,厦门分离物(JX534224)次之,系统进化分析结果也显示TMGMV-JS与其他TMGMV聚于同一大分支,其中与重庆、厦门两个分离物在同一小分支,相对近缘。构建的pCB301-TMGMV-JS侵染性克隆载体可以系统侵染本氏烟,引起叶片黄化,植株系统性坏死;也可以系统侵染辣椒,引起叶片斑驳、卷曲和植株矮化等症状。【结论】侵染江苏省南京市辣椒的TMGMV-JS分离物基因组全长6356 nt,与国内重庆、厦门TMGMV分离物具有较近的亲缘关系,同属于一个分支;构建的TMGMV-JS侵染性克隆可以系统侵染本氏烟和辣椒,在本氏烟上会导致系统性坏死。
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- 关键词：侵染性克隆
