张巧霞
- 作品数：21 被引量：57H指数：4
- 供职机构：重庆大学更多>>
- 发文基金：教育部“春晖计划”霍英东基金重庆市应用基础研究项目更多>>
- 相关领域：理学医药卫生化学工程生物学更多>>
- 生物序列表征体系构建及定量结构功能预测研究
- 梁桂兆李志良杨善彬周原周鹏梅虎舒茂田菲菲杨力张巧霞张梦军吴玉乾
- 随着人类基因组计划的实施与完成，生物序列(肽、蛋白质、核酸等)数目呈“指数”增长，在当今全球每天测出以千万计数碱基对核酸序列，从中翻译出以十万计的可能蛋白质序列时代，已不可能用实验办法逐一确定其结构和功能。鉴于此，近年对...
- 关键词：
- 关键词：生物序列
- 膦类化合物核磁共振谱化学位移预测被引量：4
- 2006年
- 采用离子性指数(INI)、立体效应参数(iε)对291个膦化合物中磷原子进行结构表征,并与其核磁共振磷谱(31P NMR)建立定量结构波谱关系(QSSR)模型。分别利用多元线性回归(MLR)、偏最小二乘回归(PLSR)、人工神经网络(ANN)建模,同时采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进行深入分析和检验,建模计算值、留一法(LOO)交互校验(CV)预测值和外部样本预测值的复相关系数Rcum、QLOO和Qext分别为0.9449,0.9408和0.9338(MLR);0.9421、0.9411和0.9338(PLSR);0.9741、0.9736和0.9471(ANN)。结果表明:INI、iε与31P NMR谱化学位移显著相关。
- 仝建波曾晖张生万周鹏杨胜喜冯彦琳张巧霞李志良
- 将潜因多元建模技术与遗传虚拟筛选模式相结合：改善定量构效关系被引量：1
- 2008年
- 提出了改进的定量构效关系(mmQSAR)研究方法,即认为在知晓配基与受体相互作用模式前提下建立一种较可靠的定量构效关系模型,从而克服了传统做法中仅根据样本集分子自身信息来构建预测模型的某些弊端.将此思路应用于功能肽/蛋白质亲和活性考察,采用遗传算法(GA)筛选虚拟受体结合靶点及相互作用模式,结合偏最小二乘(PLS)潜因多元建模技术,通过交互检验均方根误差(RMSCV)作适应度评价函数筛选变化位点和受体残基,完成种群进化以最优个体为最终确定模型,得到一种新颖QSAR方法(mmQSAR):基于功能肽/蛋白质作用模式的遗传虚拟筛选(暂称GVSPPC).该法成功解决了诸多QSAR研究难题,即大多数情况下受体结构未知而难以了解的配基与之结合方式.分别使用生物功能寡肽和多肽体系对GVSPPC加以检验,其结果表明,GVSPPC得到了优于传统方法QSAR结果(R2cu>0.75～0.91,Q2cv>0.71～0.86,ERMS为0.19～0.95)且深入阐明配基与受体间作用机理,物理意义较为明确;同时计算选中模式作用能并与样本活性建立PLS模型,以其交互检验均方根误差(ERMScv)作评价函数完成种群进化.通过大规模迭代直到规定的终止条件或到达最大繁殖代数,以该过程最优个体作为最终确定QSAR模型.
- 李志良田菲菲吴世容杨善彬杨胜喜张巧霞周原覃仁辉梅虎陈刚李根容
- 关键词：定量构效关系偏最小二乘遗传算法评价函数
- 三组分液相平行合成及定量构效关系研究
- 组合合成是建立在高效、快速、平行合成基础之上，这种合成新方法步骤较少，但底物和试剂较多样，故生成的化合物数量巨大，因此组合化学以其制备能力大的优点在生物学合成和化学合成中发挥了巨大作用，尤其在新药的研究与开发领域。多组分...
- 张巧霞
- 关键词：组合化学MANNICH反应定量构效关系药物设计
- 文献传递
- 原子电性作用矢量用于吡喃糖化学位移计算被引量：1
- 2006年
- 从分子二维拓扑结构出发,借助原子电性作用矢量(AEIV)描述原子所处分子微观化学环境,对54种吡喃单糖中共338个等价共振碳原子进行表征并以此建立起用于模拟单糖分子13CNMR化学位移三参数多元线性回归方程,所得模型复相关系数为Rcum=0.9696.为检验该模型对外部样本集预测能力,采用留一法(LOO)作交互校验(CV)检测,其复相关系数为Qcum=0.9687.
- 田菲菲李志良张巧霞覃仁辉周原周鹏
- 关键词：寡聚糖原子电性作用矢量多元线性回归
- 原子电性距离矢量用于萜类化合物核磁共振碳谱的QSSR研究被引量：9
- 2007年
- 本文利用原子电性距离矢量(Atomic Electro Negativity Distance Vector,AEDV)和原子杂化状态指数(Atomic Hybridization State Index,AHSI),对萜类化合物中碳原子进行结构表征,并与其核磁共振碳谱(13C NMR)建立了优良的定量构谱相关(QSSR)模型.采用内部及外部双重验证的办法对所得模型稳定性能进行了深入分析和检验。其结果表明,AEDV,AHSI与13C NMR谱化学位移显著相关.
- 仝建波曾晖张生万彭传友乔华张巧霞李志良
- 关键词：萜类化合物^13CNMR
- 单质子化蛋白质肽段结构表达及其离子迁移谱碰撞截面定量预测
- 2006年
- 基于分子二维图形特征提出一种新型结构参数化方法:分子电性作用矢量(MEI);应用于考察107个单质子化肽段样本集结构表征及离子迁移谱碰撞截面模拟和预测及严格检验,所得3个模型回归建模及留一法交叉验证复相关系数(R和Q)分别为:R=Rcu=0.983,0.981,0.980和Q=Rcv=0.979,0.979,0.978。MEI对复杂有机分子结构表达准确且性质预测良好。
- 曾晖李志良赵娜张巧霞梅虎周原杨善彬李经纬
- 关键词：离子迁移谱碰撞截面定量构效关系
- 三维全息原子场作用矢量用于脂肪酸的QSRR研究被引量：2
- 2008年
- 采用三维全息原子场作用矢量(3D-HoVAIF)进行结构表征,研究脂肪酸定量结构保留指数关系(QS-RR),通过逐步回归(SMR)进行变量筛选,多元线性回归(MLR)建立定量构效关系模型。结果表明,所建模型的复相关系数r为0.998,留一法交互校验(LOO-CV)复相关系数rcv为0.983。3D-HoVAIF能较好地表征脂肪酸的结构信息,且所建模型具有较好的稳定性和预测能力。
- 景举华张巧霞李志良
- 关键词：三维全息原子场作用矢量脂肪酸
- 分子电性作用矢量用于合成产率预测被引量：4
- 2007年
- 应用分子电性作用矢量(molecular electronegativity interaction vector,MEIV)建立了42种Wittig反应产率的定量构效关系模型,考察了反应物分子结构对合成产率的内在影响。结合多元线性回归、逐步回归变量筛选方法和QSAR建模技术,得到7参数QSAR模型,交互校验的复相关系数分别为0.985、0.973;选用外部集对模型健壮性、预测能力进行考察,亦获得良好结果:R=0.984、R=0.965。模型稳定性良好,预测能力颇强。
- 张巧霞李志良杨修明景举华彭传友康丽芳
- 关键词：定量构效关系WITTIG反应多元线性回归
- 三维原子场全息作用矢量用于HETP类抗艾滋病类药物活性定量构效关系研究被引量：6
- 2007年
- 定量构效关系为药物设计和筛选提供相对简便途径并受到广泛重视。为更好模拟药物结构与活性问相关性，尝试采用本实验室新近提出三维原子场全息作用矢量，基于三种经典原子间静电、立体和疏水即非键作用方式，不借助任何实验参数对35个HETP类抗艾滋病药物进行定量活性构效关系。模型估计和交互校验复相关系数和标准偏差分别为Rcu^2=0．882、Qcu^2=0812与RMSEE=0．43。模型具良好稳定性和预测力，表明此矢量在分子结构表征和生物活性预测的适应性。
- 王娇娜梅虎龙海张巧霞李志良
- 关键词：定量构效关系
