梁平
- 作品数：16 被引量：30H指数：3
- 供职机构：第四军医大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划陕西省科技攻关计划更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学文化科学农业科学更多>>
- 应用Logistic回归与多因子降维法分析胃癌易感基因多态性被引量：3
- 2014年
- 目的应用Logistic回归与多因子降维法(multifactor dimensionality reduction,MDR)分析胃癌易感基因多态性,为胃癌的早期诊断和预警奠定基础。方法采用病例-对照研究,以中国西北476例汉族胃癌患者为病例组,361名非肿瘤、非消化系统疾病个体为对照组;通过候选基因策略,应用MassARRAY质谱平台分析与代谢、炎症相关的18个基因的37个单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点;利用Logistic回归与MDR对基因分型结果进行分析。结果 Logistic回归分析显示,磷脂酶Cε1(phospholipase C epsilon 1,PLCE1)_rs3765524[OR=1.341,95%CI(1.003,1.792)]、还原型辅酶Ⅰ/Ⅱ醌氧化还原酶1[NAD(P)H:quinone oxidoreductase 1,NQO1]_rs1800566[OR=0.615,95%CI(0.418,0.903)]、X线修复交叉互补基因1(X ray repair cross complementing gene 1,XRCC1)_rs25487[OR=0.688,95%CI(0.490,0.967)]3个SNP位点的基因型分布与胃癌易感性显著相关(P<0.05);MDR分析显示,PSCA_rs10216533-XRCC1_rs25487[模型Ⅰ:OR=3.566,95%CI(2.614,4.863)]、MTHFR_rs1801131-PSCA_rs2976392-CYP17A1_rs6163-CYP19A1_rs4646-CYP19A1_rs1902586-MMP2_rs243865[模型Ⅱ:OR=7.257,95%CI(5.337,9.870)]、IL1B_rs16944-PSCA_rs10216533-CYP17A1_rs6163-NQO1_rs1800566-ENOSF1_rs2298581-XRCC1_rs25487[模型Ⅲ:OR=15.837,95%CI(11.252,22.289)]3个模型内部各位点之间具有显著交互作用(P<0.000 1)。结论 PLCE1、NQO1、XRCC1、PSCA、MTHFR、CYP17A1、CYP19A1、MMP2、IL1B、ENOSF1等基因多态性与我国西北地区汉族人群胃癌发病风险相关;在胃癌的早期诊断与预警中应联合Logistic回归和MDR等方法,兼顾单因素与多因素交互的影响进行综合分析。
- 张文涛梁平代鹏王伟华汪钦孙建斌王伟颜真
- 关键词：胃癌单核苷酸多态性LOGISTIC回归多因子降维法
- 本科生基因工程教学改革初探被引量：5
- 2012年
- 基因工程是高等教育中生物技术专业的主干课程,其突出特点是技术性强。为了使学生易于理解和掌握该门课程,并具有较强的科研交流能力,在早期教学实践的基础上进行了部分教学改革,通过调整理论课和实验课设置,增设基础综合实验及双语教学,突出案例和基于问题的教学等,提高了教学效果。
- 雷小英向安刘永兰汪钦梁平赵锦荣郭晏海张菊颜真
- 关键词：基因工程教学改革教学方法
- 一种简易SNP检测方法的建立被引量：2
- 2011年
- 目的:建立一种快速、简单的SNP(Single Nucleotide Polymorphisms)检测方法。方法:设计带生物素标记的扩增引物对检测用具有单碱基差异的野生型和突变型靶序列分别进行扩增,然后通过紫外交联的方式将相应检测靶序列的探针固定在硝酸纤维素膜上,借助Taq酶完成膜上单引物延伸,从而对探针捕获的靶序列进行延伸固定在膜上,最后使用生物素-亲和素酶联显色(ABS-ELISA)反应肉眼观察结果。结果:阳性和阴性对照探针显示正常。野生型探针和突变型探针能够分别特异性结合靶序列,并通过生物素和亲和素显色系统放大为一种肉眼可判断结果的检测形式。结论:建立了一种基于硝酸纤维素膜载体上进行核酸扩增的SNP检测方法。
- 包晗赵锦荣汪钦郭晏海刘永兰雷小英梁平孙建斌颜真
- 关键词：硝酸纤维素膜核酸扩增SNP生物素
- PLCE1基因及rs2274223和rs3765524单体型的克隆与表达
- 2016年
- 目的：克隆人PLCE1基因,构建PLCE1 rs2274223和rs3765524 GT（PLCE1 Minor）和AC（PLCE1 Major）单体型真核表达重组载体,研究PLCE1基因多态性及单体型与基因表达的相关性。方法：利用重叠延伸PCR、In-Fusion技术构建PLCE1真核表达载体;基于同源重组的双点突变技术改造目的基因;利用基因转染、实时定量PCR和蛋白印迹等技术实现PLCE1表达载体在真核细胞中的过表达及表达水平的鉴定。结果：成功扩增并获得了全长6 927bp的人PLCE1 cDNA并经过DNA测序证实,与NCBI数据库PLCE1参考序列（NM_016341）比较,发现编码区3 554～3 572bp处存在18bp连续碱基插入,其余序列基本匹配。成功构建了PLCE1 Minor和PLCE1 Major两种单体型重组真核表达载体,转染细胞揭示PLCE1 Minor型的mRNA转录和蛋白质表达水平均高于Major型。结论：发现了一种新的PLCE1 mRNA转录本,成功构建了2种单体型真核表达载体;发现PLCE1 rs2274223G-rs3765524T单体型能够促进自身mRNA和蛋白质表达,为进一步揭示PLCE1 SNPs与癌症易感性的关系奠定了基础。
- 李达代鹏王伟张文涛汪钦束毅祝春来纪奇峰梁平颜真
- 关键词：单核苷酸多态性重叠延伸PCR基因克隆基因表达
- 乙肝治疗耐药基因突变的焦磷酸测序技术诊断被引量：3
- 2011年
- 目的:建立焦磷酸测序技术检测拉米夫定和阿德福韦酯治疗乙肝所致乙肝病毒基因耐药突变的定量检测方法,为临床乙肝耐药诊断和治疗提供依据。方法:针对乙肝病毒DNA聚合酶基因序列上4个常见基因突变位点的6种突变形式,分别克隆构建野生型和突变型质粒作为标准品,应用生物信息学手段设计目标基因通用PCR引物和各突变点的焦磷酸测序引物,建立焦磷酸测序的突变检测方法。对接受拉米夫定、阿德福韦酯治疗的慢性乙型肝炎患者血清标本进行检测。结果:构建了乙肝病毒四种常见耐药性突变的标准株和变异株克隆,建立了分别或同时检测拉米夫定、阿德福韦酯耐药突变的焦磷酸测序方法,对68例临床耐药或疑似耐药的患者血清标本进行检测,双脱氧测序验证,检出拉米夫定耐药突变32例,阿德福韦酯耐药突变5例,其中焦磷酸测序检出20例为混合突变,而双脱氧测序显示为6例。结论:成功建立了焦磷酸测序定量检测拉米夫定、阿德福韦酯耐药基因突变的方法,构建了乙肝病毒耐药基因突变的标准质粒,为临床动态监测乙肝病毒变异病毒株、指导合理用药奠定了基础。
- 汪钦郭晏海李勇年刘永兰包晗赵锦荣梁平雷小英张菊颜真
- 关键词：乙肝耐药基因焦磷酸测序阿德福韦酯
- PIK3CA基因突变的MassARRAY分子量阵列分析
- 2011年
- 目的:利用MassARRAY分子量阵列分析系统检测胃癌组织PIK3CA基因突变。方法:从胃癌石蜡包埋组织中提取基因组,PCR反应扩增目的基因片段,MassARRAY分子量阵列分析系统检测PIK3CA基因突变;焦磷酸测序验证检测结果。结果:中国西部地区144例胃癌组织样本中PIK3CA_E542K(1624G>A)突变携带率为77.6%,PIK3CA_E545K(1633G>A)突变携带率为84%。MassARRAY分子量阵列分析系统检测结果与焦磷酸测序结果达到100%吻合。结论:建立了MassARRAY分子量阵列分析系统检测基因突变的方法,初步建立了中国西北地区汉族人群胃癌组织PIK3CA基因PIK3CA_E542K(1624G>A)和PIK3CA_E545K(1633G>A)位点突变频数。
- 梁平赵锦荣惠延平孙建斌王伟汪钦包晗刘永兰金天博郭晏海张菊颜真
- 关键词：胃癌基因基因分型基因突变
- 宫颈癌中HPV感染分型与EGFR靶向治疗药物敏感突变、EGFR启动子甲基化的研究被引量：4
- 2014年
- 目的检测并分析宫颈癌组织标本中感染HPV病毒型别与EGFR基因启动子甲基化状态、EGFR靶向治疗药物敏感相关基因突变状态的分布与关联性，为指导宫颈癌的个体化治疗提供新思路和分子诊断技术方法。方法分别提取180例宫颈癌组织DNA，GP5＋／GP6＋非对称扩增荧光偏振检测方法检测每例宫颈癌标本组织DNA的HPV16、18、58、52型。非对称扩增荧光偏振检测方法检测每例宫颈癌标本组织的亚硫酸氢盐转变DNA的EGFR启动子甲基化状态：测序法检测每例宫颈癌标本组织DNA的EGFR基因18、19、21外显子突变状态；统计分析检On,0结果。结果本研究成功检测了宫颈癌标本组织DNA中HPV16、18、58、52型和EGFR基因18、19、21外显子突变状态，成功检测了宫颈癌标本组织亚硫酸氢盐转变DNA的EGFR启动子甲基化状态。EGFR启动子甲基化阳性65例，阳性率为36．1％。单纯HPV16阳性54例，其中EGFR启动子甲基化34例，占63．0％。HPV16阳性样本中EGFR启动子甲基化阳性比率最高。结论本研究中，宫颈癌标本中HPV感染率为100％，宫颈癌标本中未发现EGFR药物敏感相关基因EGFR18、19、21外显子突变，宫颈癌标本中EGFR启动子甲基化阳性率较高，其中，HPV16感染的宫颈癌标本中EGFR启动子甲基化阳性率较其他病毒型显著增高，提示HPV16感染与EGFR启动子甲基化有一定关联．
- 姜英浩张潍俞青苗强少盈梁平程红高艳娥赵星烨郭晏海张菊
- 关键词：宫颈癌表皮生长因子受体甲基化
- 非对称PCR-FP技术同步检测HSV-1/-2、CMV和EBV被引量：2
- 2009年
- 目的应用非对称PCR-荧光偏振（FP）技术建立一种同步检测全血中4种主要疱疹病毒（单纯疱疹病毒1／2型，巨细胞病毒、EB病毒）的新方法。方法以人疱疹病毒属通用引物行非对称PCR，扩增从179例样本中抽提的DNA。PCR扩增产物与特异性单纯疱疹病毒1／2型（HSV-1／-2）、巨细胞病毒（CMV）和EB病毒（EBV）寡核苷酸探针混合物温育杂交，荧光偏振检测技术检测杂交液荧光偏振值，据荧光偏振值判断病毒感染类型，并以DNA序列测定结果为参照。结果与DNA序列测定的阳性检测符合率为100％，但DNA序列测定检测均未检出多重混合感染。非对称PCR-FP方法对HSV-1／-2检测的灵敏度达到1．0×10^3拷贝／ml．对EBV和CMV检测的灵敏度达到2．0×10^3拷贝／ml。结论本法对于4种主要疱疹病毒感染的筛查及预防、预后判断具重要价值。
- 张菊吴中亮李丁王香玲梁平郭宴海李宏伟颜真
- 关键词：人疱疹病毒荧光偏振同步检测
- PLCE1基因多态性在胃癌发生过程作用的探讨
- 酶CE1(phospholipase C epsilon-1,PLCE1)是新发现的磷脂酶家族C新成员,其分子结构和功能较为复杂,在细胞信号转导过程中可能起重要作用.PLCE1的激活可引起一系列的生化反应,最终调节细胞的...
- 代鹏梁平张文涛王伟华颜真
- 关键词：胃癌基因表达
- 文献传递
- NDRG2基因启动子甲基化与肺腺癌细胞中mRNA表达相关性的实验研究被引量：2
- 2010年
- 目的:探讨肺腺癌细胞中NDRG2基因启动子甲基化状态及其与基因表达的关系。方法:甲基化焦磷酸测序技术检测启动子区域甲基化状态,荧光定量PCR技术检测不同药物浓度下培养细胞中NDRG2基因mRNA的表达水平,分析启动子区域甲基化与基因表达之间的关系。结果:在体外培养细胞中检测到NDRG2基因启动子区域呈现不同程度的甲基化,甲基化频率分别为肺癌A549细胞71.8%、GLC-82细胞86.1%、人脐静脉内皮ECV-304细胞36.8%、胃上皮GES-1细胞42.9%。NDRG2基因mRNA表达与其启动子甲基化程度成反比,甲基转移酶抑制剂5-杂氮-2-脱氧胞苷(5-Aza-CdR)作用于细胞后,A549和GLC-82细胞中NDRG2基因的mRNA转录明显上调,至72 h差异显著(P<0.05)。结论:肺腺癌细胞中NDRG2基因启动子CpG岛存在高甲基化,甲基化程度与该基因的表达具有负相关性,5-Aza-CdR能在一定程度上提高NDRG2的转录水平。
- 李慎梁平刘永兰黄启超汪钦包晗赵锦荣雷小英郭晏海颜真
- 关键词：NDRG2基因启动子甲基化焦磷酸测序5-杂氮-2-脱氧胞苷
