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植物根毛生长发育及分子调控机理被引量：6: 2007年; 植物根毛是植物吸收营养的主要器官,了解根毛的发生、发育及遗传规律,能对植物的养分吸收研究提供有利依据。文章旨在介绍植物根毛形态发生特性、发育生长过程及分子调控机理的研究进展,利用比较基因组学方法研究农作物根毛形态和功能,及有目的性的对根生长发育进行调控提供参考。研究发现植物根毛发育有反馈侧向抑制(lateralinhibitionwithfeedback)和位置决定模式(position-dependentpatternofcelldifferentiation)两种方式。拟南芥根表皮细胞是以位置方式决定毛或非毛细胞发育类型,已成为研究植物细胞命运和分化的模型。目前,已经鉴定出控制根毛发育的基因,包括一些转录因子如MYB家族蛋白TRIPTYCHON(TRY)、CAPRICE(CPC)和basicHelix-Loop-Helix(bHLH)蛋白GLABRA3、ENHANCEROFGLABRA3(EGL3)及WD-repeat蛋白等基因。最后针对根毛研究前景提出展望。; 王跃平李英慧关荣霞刘章雄陈雄庭常汝镇邱丽娟; 关键词：根毛发育细胞识别分子调控

大豆基因组和转录组的核基因密码子使用偏好性分析被引量：57: 2011年; 研究大豆核基因密码子的使用模式,探讨影响其密码子组成和编码特点的因素,为运用基因工程技术提高改良大豆提供理论依据。以大豆基因组的46430个高置信编码基因和2071条大豆全长转录本序列为数据来源,应用CodonW软件对大豆全基因组密码子组成、同义密码子使用频率和全长转录组编码区密码子使用各项参数的计算和统计分析发现,基因的表达水平与编码区G+C和GC3s含量均呈极显著正相关,且G+C和GC3s含量越高的基因密码子使用偏好性越高,并确定了UCC和GCC为大豆最优密码子。编码区长度分组分析表明,密码子使用偏好性随编码区长度的增加而降低,编码区较长的基因则趋向于随机使用密码子,且在转录组数据范围内,编码区长度介于400～600bp的基因表达水平最高。大豆叶片和种子中特异表达基因的密码子使用偏好性和基因表达水平较为接近,但种子特异表达基因的G+C和GC3s含量均显著高于叶片特异表达基因,而其芳香族氨基酸含量则极显著低于叶片特异表达基因。; 张乐金龙国罗玲王跃平董志敏孙守红邱丽娟; 关键词：大豆基因组转录组密码子

绥农14鼓粒期籽粒cDNA文库构建及初步分析被引量：4: 2008年; 大豆EST分析对深入了解大豆重要性状形成机制并发掘新基因具有重要意义。本研究利用SMART技术,构建了绥农14鼓粒期的籽粒cDNA文库并测定EST序列,目的是分析绥农14鼓粒期的基因表达特性,为挖掘和克隆基因提供物质支撑。结果表明,本研究构建文库的初始库容为1.2×106,扩增后文库的库容为1.6×109,重组率达98%,用载体两端通用引物进行PCR鉴定,插入片段均大于0.9kb,随机对2300个单克隆测序,获得有效序列2201条,SeqMANⅡ组装整理后的序列2114条,包括1516个contig或者singlet,平均长度为672bp。对组装后的序列构建籽粒鼓粒表达图谱,发现籽粒形成初期,能量代谢、初级代谢途径、蛋白合成定向贮藏类基因表达量较多,而涉及细胞运输,细胞结构和抗性类基因表达量较低。; 王跃平李英慧陈雄庭常汝镇邱丽娟; 关键词：CDNA文库同源分析功能注释

大豆胰蛋白酶抑制剂Bowman-Birk基因家族新等位变异分析被引量：1: 2008年; 大豆胰蛋白酶抑制剂主要有Kunitz型胰蛋白酶抑制剂(KTi)和Bowman-Birk型胰蛋白酶抑制剂(BBI).BBI家族已经克隆的有BBI-A,BBI-C和BBI-D三类抑制剂,而KTi型家族包含有Tia,Tib,Tic,Tid,Tie,Tif,Tis和ti共8个多基因共显性控制单位点的多态类型及KTi1/2,KTi3等成员.本研究对大豆品种"绥农14"鼓粒期籽粒cDNA文库随机测序,组装出的175个contigs(或singletons),大豆胰蛋白酶抑制剂有关的contigs有17个,其中12个序列组装成的4个contigs,如contig5,contig35,contig8和contig9分别与BBI家族成员BBI-A1,BBI-A2,BBI-C和BBI-D有关,序列之间的相似性达到98%以上,均包含完整的可读框(ORF),并且存在新的等位变异,通过cDNA和基因组PCR扩增,克隆了BBI家族4个成员,证实了新等位变异的存在.通过比较分析籽粒形成时期的cDNA文库,发现大豆胰蛋白酶抑制剂基因表达随籽粒的发育和成熟而呈现由低到高变化趋势.大豆、水稻、花生、玉米和豇豆的Bowman-Birk蛋白酶抑制剂基因的序列聚类分析,表明禾谷类和豆科植物BBI家族具有共同的祖先.; 王跃平陈雄庭邱丽娟; 关键词：等位变异

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王跃平