陶聪 作品数:26 被引量:51 H指数:4 供职机构: 中国农业科学院北京畜牧兽医研究所 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 中央级公益性科研院所基本科研业务费专项 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 农业科学 生物学 医药卫生 更多>>
冷刺激小鼠脂肪组织差异表达长链非编码RNA的初步研究 被引量:1 2015年 脂肪组织主要有白色脂肪组织(WAT)和褐色脂肪组织(BAT)两种类型;WAT储存能量,BAT通过特异性表达解耦联蛋白1(uncoupling protein 1,UCP1)消耗能量产热。与BAT不同,WAT具有很强的可塑性,在寒冷刺激下,呈现褐色脂肪表型、获得褐色脂肪的产热活性("褐色化")。根据对冷刺激组(6℃)和对照组(28℃)小鼠的肩胛区褐色脂肪组织(iBAT)和皮下白色脂肪组织(sWAT)的RNA转录组测序分析结果,初步筛选出1个差异明显的长链非编码RNA(lncRNA-6030408B16Rik)。通过qRT-PCR检测lncRNA-6030408B16Rik在野生型小鼠的脾脏、肌肉、肾脏、十二指肠、大脑、肝脏、sWAT和iBAT中的表达;24只雄性C57BL/6野生型小鼠随机分成冷刺激组(6℃)和对照组(28℃),两组小鼠分别在6和28℃环境下处理10d,分别采集两组的iBAT和sWAT;并分离出生1d的野生型小鼠褐色前脂肪细胞,诱导分化后,收集0、1、3、5d的细胞,检测UCP1基因和lncRNA-6030408B16Rik在分化过程中的时空表达。qRT-PCR结果显示iBAT和sWAT中lncRNA-6030408B16Rik的表达量均明显高于其他组织;与对照组相比,冷刺激组iBAT中lncRNA-6030408B16Rik的表达量极显著上调(P<0.01),冷刺激组sWAT中lncRNA-6030408B16Rik的表达量显著上调(P<0.05);前脂肪细胞诱导分化的过程中,lncRNA-6030408B16Rik的表达量呈先上调后下调的趋势。lncRNA-6030408B16Rik在脂肪组织中特异性高表达。lncRNA-6030408B16Rik可能对白色脂肪组织"褐色化"及褐色前脂肪细胞的分化具有重要的调控作用。 黄素娟 陶聪 甄二东 王亚君 魏刚 白立景 杨述林 王彦芳 李奎 敖红关键词:小鼠 白色脂肪组织 褐色脂肪组织 前脂肪细胞分化 长链非编码RNA 急性冷刺激后巴马猪背膘和腹股沟皮下脂肪组织的脂质组比较 被引量:1 2020年 本研究旨在获得巴马猪皮下脂肪组织(包括背膘(backfat)和腹股沟皮下脂肪组织(inguinal subcutaneous white adipose tissue,iWAT))在急性冷刺激(4℃、4 h)后其脂质组成应答的差异。正常饲喂的6月龄巴马公猪在急性冷刺激处理后进行屠宰,收集背膘和腹股沟皮下脂肪组织,利用液相二级质谱(LC-MS/MS)高通量脂质组学检测技术分析其脂质组成。结果表明,在巴马猪皮下脂肪组织中,中性脂类、游离脂肪酸、磷脂类和鞘脂类4大类脂质含量差异巨大,其中含量最高的为中性脂类,在腹股沟皮下脂肪组织和背膘中分别占4大脂类总和的97.43%和98.53%;含量最低的为鞘脂类,在腹股沟皮下脂肪组织和背膘中所占比例分别为0.10%和0.07%。在16亚类脂质组成中含量最高的脂质为甘油三酯,在腹股沟皮下脂肪组织和背膘分别占16亚类脂质总和的95.97%和97.33%;含量最低的脂质为磷脂酸,在腹股沟皮下脂肪组织和背膘中所占比例分别为3.98E-04%和1.13E-04%。主成分分析表明,背膘和腹股沟皮下脂肪组织在急性冷刺激后脂质组成存在差异。以∣差异倍数∣>1.5和P<0.05为标准筛选,共获得18种差异显著的脂类,其中16种脂类在背膘中含量显著低于腹股沟皮下脂肪组织,其中包括14种甘油三酯、DAG32∶1(16∶1/16∶0)和PE40∶6p;只有2种脂质(CL74∶8(18∶2)和TAG54∶3(16∶0))在背膘中的含量显著高于腹股沟皮下。巴马猪皮下脂肪主要脂质组成为甘油三酯;急性冷刺激后,背膘和腹股沟皮下脂肪组织对急性冷刺激存在不同的应答。 潘建飞 郑千涛 陶聪 赵建国 王彦芳关键词:背膘 BMP2蛋白或其编码基因在调控猪米色脂肪细胞分化中的应用 本发明涉及基因工程技术领域,具体公开了BMP2蛋白或其编码基因在调控猪米色脂肪细胞分化中的应用。本发明利用基因工程技术构建过表达质粒、重组蛋白增加BMP2基因的表达,发现其能增加猪米色脂肪细胞的分化效率及产热功能。此外本... 王彦芳 刘嘉莉 陶聪 张立兰 陈川河利用CRISPR-CAS9系统敲除猪胎儿成纤维细胞系中APOC3基因的方法 本发明涉及生物技术领域,提供一种利用CRISPR‑CAS9系统敲除猪胎儿成纤维细胞系中APOC3基因的方法,其是根据猪APOC3基因序列,设计并合成靶向猪APOC3基因的sgRNA,然后构建含有所述sgRNA的CRISP... 王彦芳 汤嘉玉 杨淳怀 赵莹 杨述林 陶聪 吴添文猪脂肪组织发育示踪系统及应用 本发明涉及生物技术领域,提供一种猪脂肪组织发育示踪系统及应用,所述系统包括px330‑Rosa26和pRosa26‑AdipoTracer‑KI两个载体。于猪友好基因座位Rosa26中定点整合了AdipoTracer系统... 王彦芳 王煜 吴添文 毕登峰 陶聪SCD基因敲除的猪胎儿成纤维细胞系及其构建方法 本发明提供SCD基因敲除的猪胎儿成纤维细胞系及其构建方法。利用CRISPR/Cas9系统编辑猪SCD基因,打靶位点位于SCD基因第二外显子,可以有效地敲除SCD基因,得到SCD基因敲除猪胎儿成纤维细胞,该敲除细胞可用于制... 王彦芳 刘璐璐 王煜 陶聪 梁小娟 刘嘉莉文献传递 ITGA2基因在调控猪米色脂肪形成中的应用 本发明公开了ITGA2基因在调控猪米色脂肪形成中的应用。本发明利用RNA‑seq技术,通过分析藏猪成熟米色脂肪细胞和白色脂肪细胞的基因表达差异,筛选出米色脂肪特异性的高表达基因,并基于人、鼠、猪比较基因组学技术,成功鉴定... 陶聪 张立兰 王彦芳 陈川河 刘嘉莉UCP3基因在巴马猪和藏猪脂肪组织中的表达和甲基化分析 被引量:5 2019年 为探究解偶联蛋白3(uncoupling protein 3,UCP3)基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的表达和甲基化水平,试验采用实时荧光定量PCR技术检测UCP 3基因在巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中的mRNA表达水平;针对猪UCP 3基因启动子区域(-3580^+920 bp),利用在线软件MethPrimer对该区域进行CpG岛预测,并采用亚硫酸氢盐测序法(bisulfite sequencing PCR,BSP)检测其甲基化水平,探究UCP 3基因甲基化水平在巴马猪和藏猪中的差异。结果显示,巴马猪皮下脂肪组织UCP 3基因表达量显著高于藏猪(P<0.05);在UCP 3基因启动子区预测到3个CpG甲基化岛,分别是CpG island1(-3171^-2928 bp)、CpG island2(-154^-2 bp)和CpG island3(+648^+806 bp),其中CpG island1和CpG island3的甲基化水平在巴马猪和藏猪中差异较小,而藏猪CpG island2的甲基化水平(42.61%)高于巴马猪(24.49%)。本研究绘制了2个猪种CpG island2甲基化水平的黑白点图,其中CpG位点为4、8、9、10、11、12、15,藏猪甲基化频率分别比巴马猪高28.26%、17.39%、26.09%、26.09%、26.09%、23.91%和34.78%。在CpG island2处预测到3个转录因子结合位点(SP2、PPARγ和EGR1)。结果表明,巴马猪和藏猪皮下脂肪组织中UCP 3基因mRNA水平的表达差异可能是由于CpG island2的甲基化水平不同所导致,藏猪DNA甲基化水平在一定程度上阻碍了转录因子与启动子调控区域的结合,从而抑制了UCP 3基因的表达。 范一萍 王彦芳 陶聪关键词:藏猪 UCP 脂肪组织 甲基化 TMEM100基因调控猪脂肪细胞能量代谢 本发明涉及基因工程技术领域,尤其涉及TMEM100基因调控猪脂肪细胞能量代谢。本发明利用基因工程技术构建过表达质粒增加TMEM100基因的表达,发现其能增加猪米色脂肪细胞的分化效率及产热功能。此外本发明还进行了反向验证,... 王彦芳 姜琳 陶聪 刘嘉莉 王佳昊RNF20及其介导的组蛋白H2B单泛素化对小鼠棕色脂肪细胞分化的影响 2020年 旨在研究RNF20及其介导的组蛋白H2B第120位赖氨酸的单泛素化(H2Bub)对小鼠棕色脂肪细胞成脂分化的影响。采集1日龄和2月龄雄性C57BL/6小鼠的棕色脂肪组织(n=3),用Western blot方法检测RNF20的表达及其介导的H2Bub水平。利用胶原酶消化法分离获得1日龄小鼠的棕色前体脂肪细胞。分别诱导棕色前体脂肪细胞和C3H10T1/2细胞系成脂分化,通过油红O染色检测其分化效果,进一步通过Western blot检测细胞分化前后(0和8 d)RNF20的表达及其介导的H2Bub水平。通过siRNA干扰Rnf20基因在C3H10T1/2细胞系中的表达,油红O染色方法观察Rnf20基因对成脂分化的影响,利用qPCR和Western blot技术检测Rnf20基因的干扰效率及其介导的H2Bub水平。结果显示,2月龄小鼠棕色脂肪组织中RNF20表达量及其介导的H2Bub水平均显著高于1日龄小鼠。脂肪细胞分化标记蛋白PPARγ和CEBPα的表达水平,RNF20表达量及其介导的H2Bub水平在棕色前体脂肪细胞及C3H10T1/2细胞成脂分化后均显著增加。此外,在C3H10T1/2细胞中敲降Rnf20基因后,与阴性对照组相比,RNF20及其介导的H2Bub水平显著降低,成脂分化后脂滴明显减少。综上表明,RNF20对小鼠棕色脂肪细胞的分化是必需的,敲降Rnf20基因导致组蛋白H2Bub水平显著降低,且降低了C3H10T1/2细胞的成脂分化效率。本研究丰富了小鼠棕色脂肪细胞分化过程中的表观遗传调控研究,为深入理解动物脂肪细胞分化提供了新的基因素材。 梁小娟 陶聪 赵莹 王超 刘璐璐 王彦芳关键词:成脂分化 小鼠