何群
- 作品数：53 被引量：139H指数：7
- 供职机构：中国医科大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金辽宁省自然科学基金辽宁省教育厅高等学校科学研究项目更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学文化科学理学更多>>
- 转录因子HSF4的生物信息学分析被引量：2
- 2016年
- 热休克转录因子4（heat shock transcription factor 4,HSF4）是热休克转录因子HSF家族成员,近年发现HSF4除发挥调控热休克蛋白（heat shock protein,HSP）表达的功能外,亦直接或间接调节许多非热休克基因的表达,参与细胞生长发育及多种生理病理过程。现对9个物种的HSF4蛋白序列进行了多序列对比、进化痕迹分析和蛋白质特定功能区域分析,发现两个保守区域：一个是75-119保守区域,其部分位于文献报道的HSF家族的DNA结合区域,该区域呈现锤子状颈环结构,中部富含亲水氨基酸,提示该颈环结构有嵌入DNA结构内部解开其双链结构起转录调控的作用;另一保守区域在176-230,呈现卷曲螺旋（coil）结构,可能跟HSF4与DNA识别、结合、固定功能相关。对HSF4的生物信息学分析可以为其功能研究奠定理论基础。
- 马汝海钟连声王天骄潘忠诚赵雨杰王绍成何群
- 关键词：生物信息学分析转录调控
- 消化系统肿瘤中p53和K-ras基因突变及其相互关系的研究
- 何群
- 低密度cDNA芯片技术的优化被引量：2
- 2004年
- 为了建立稳定的低密度cDNA芯片技术平台,研究靶基因的最适长度、浓度、点样溶液种类及杂交反应动力学,并了解该芯片的重复性与可靠性.结果表明,杂交具有较好的特异性,不同长度(189～1078bp)、浓度(0.5g/L、1.0g/L、1.5g/L)的同一靶基因杂交信号强度无明显差别;以50%DMSO为点样溶液者杂交信号最好(P=0.0001).60℃杂交18h信号最佳(P<0.001).重复2次检测结果差异无显著性(P=0.348),重复性较好,其相关系数为0.588.与RT-PCR结果相比,相关系数为-0.778(P<0.0001),特异性为100%,灵敏度为80%(16/20),可靠性较好.
- 赵雨杰黄宝俊徐惠绵何群
- 关键词：CDNA芯片可靠性
- α-2，3-唾液酸糖基转移酶ST3家族分子序列生物信息学分析被引量：1
- 2011年
- 目的比较探讨人类α-2,3-唾液酸糖基转移酶家族成员间的同源性,探讨其进化规律及其与功能相关性。方法利用网上数据库和生物信息学软件对核酸及蛋白质序列进行同源比较、结构域分析和进化树绘制。结果人类α-2,3-唾液酸糖基转移酶家族一级结构、二级结构均有较高的同源性,系统进化分析显示其各成员来源于同一祖先并在不同时期分野。结论各成员来自于同一祖先的同一家族,其进化方式属于趋异性进化,家族中各亚型底物特异性可能与其糖基化位点相关。
- 马汝海钟连生潘忠诚王天骄何群
- 关键词：同源性分析结构域系统进化树
- 原子吸收光谱法检测肝癌、肝硬化、肝脓肿患者血清中Cu、Zn、Cr、Mn、Mg微量元素含量被引量：11
- 2000年
- 应用原子吸收光谱法检测了肝癌、肝硬化、肝脓肿患者血清微量元素的含量 ,发现肝癌和肝硬化患者血清内Cu含量明显高于正常对照组和肝脓肿组 (P <0 0 0 1 ) ,Cr、Mn含量明显低于正常对照组 (p <0 0 0 1 )和肝脓肿组 ,肝脓肿患者血清内微量元素含量与正常对照组无显著性差异 (p <0 0 5 )。结果表明 :肝癌、肝硬化患者Cu、Mn、Cr存在代谢异常。
- 何群马汝海李延宾张凯李守芬
- 关键词：微量元素肝癌肝硬化肝脓肿光谱法
- 应用凝集素芯片检测胃正常黏膜上皮细胞与胃癌细胞膜表面糖链表达被引量：2
- 2009年
- 目的应用凝集素芯片检测胃正常黏膜上皮细胞系GES-1和胃癌细胞系SGC7901、MKN45细胞膜表面糖链表达,并对芯片上捕获的细胞进行初步的免疫荧光研究。方法用胶原酶Ⅱ消化细胞系,利用芯片上的凝集素位点对糖链的亲和特异性捕获荧光标记的细胞,激光共聚焦扫描仪扫描检测细胞膜表面糖链表达。结果在大多数凝集素位点上,这几种细胞均显示出荧光信号;在凝集素位点WBA、EEL、MAH-Ⅱ上均未显示荧光信号;其中,与GES-1相比,胃癌细胞系SGC7901和MKN45在LTL、HHL位点上基本没有荧光信号。结论根据凝集素的亲和特异性说明,这几种细胞系膜表面共同表达的糖链包括:唾液酸、乙酰葡萄糖/葡萄糖、乙酰半乳糖/半乳糖、甘露糖等糖链。其中,胃癌细胞系SGC7901和MKN45可能较少表达岩藻糖。
- 李春辉何群马静红潘忠诚王天骄张玉魁赵雨杰
- 关键词：胃癌免疫荧光
- 应用细胞芯片捕获人正常胃细胞系、胃癌细胞系细胞并检测其细胞表面CD表型的差异被引量：2
- 2010年
- 目的构建一种细胞芯片,根据芯片表面固定的CD抗体与细胞膜表面CD抗原免疫结合原理捕获细胞,检测人正常胃黏膜细胞系GES-1、胃腺癌细胞系7901细胞表面CD抗原表达的差异。方法将64种CD抗体蛋白固定在化学修饰醛基玻片上制成抗体阵列,将GES-1、7901细胞用胶原酶消化制成单个细胞悬液,用吖啶橙荧光标记后与芯片进行孵育,洗去芯片上游离的细胞,激光扫描仪检测芯片上CD抗体各点捕获到细胞的荧光信号,以此判定GES-1、7901细胞膜表面CD表型情况。结果发现CD9、CD13、CD29、CD44、CD49e、CD55、CD71、CD95抗体点均捕获到GES-1、7901细胞;CD15、CD24抗体点仅捕获到GES-1细胞;CD77、CD133、CD103、CD64抗体点仅捕获到7901细胞。结论 CD15和CD24可能是人正常胃黏膜细胞系GES-1细胞的表面标志物,CD77、CD133、CD103、CD64可能是人胃癌细胞系7901细胞的标志物。
- 马静红何群徐晓雪王天骄潘忠诚钟连声张玉魁赵雨杰
- 关键词：细胞芯片GES-1细胞
- 原子吸收光谱法检测子宫肌瘤、不孕症患者血清中微量元素Cu,Zn,Mg,Cr含量被引量：4
- 2002年
- 应用原子吸收光谱法检测了子宫肌瘤、女性不孕症患者血清中微量元素Cu ,Zn ,Mg ,Cr的含量 ,发现子宫肌瘤患者血清内Cu ,Cr含量明显高于正常对照组 (P <0 0 1) ,Zn含量明显低于正常对照组 (P <0 0 1)。不孕症患者血清内微量元素Zn ,Cr含量明显低于正常对照组 (P <0 0 1)。结果表明 :微量元素Cu ,Zn ,Cr代谢与子宫肌瘤有关 ,微量元素Zn 。
- 何群马汝海唐轶
- 关键词：原子吸收光谱法子宫肌瘤女性不孕症
- 一种新的DNA芯片的封闭方法被引量：6
- 2004年
- 提出了一种新的DNA芯片的封闭方法:1-碘丙烷封闭方法,并对1-碘丙烷和琥珀酸酐两种不同的封闭方法的封闭效果进行了比较实验,研究封闭试剂、封闭时间对氨基DNA芯片杂交结果所产生的影响。结果表明:1-碘丙烷封闭效果明显好于琥珀酸杆的封闭效果,用1-碘丙烷封闭后的芯片进行杂交,芯片杂交信号强、背景噪声低,灵敏度高,整个封闭过程实验操作简单,时间短,1h即可达到所需效果。1-碘丙烷可以作为一种很好的DNA芯片封闭试剂。
- 何群赵雨杰
- 关键词：DNA芯片琥珀酸酐
- 利用光波导模式光谱生物传感器研究二级结构对固-液界面DNA杂交动力学的影响
- 2011年
- 目的探讨探针和靶分子二级结构对基因芯片杂交过程的影响,并完善基因芯片设计方法,提高基因芯片的重复性和特异性。方法应用二级结构分析软件Mfold设计3对25-mer完全互补的具有不同二级结构的探针和靶分子(P0T0、P3T3、P4T4)及1对尾端有2个碱基错配的探针和靶分子(P4T3)。制备醛基化传感器芯片,将终浓度为1、2、5、10、20μmol/L的探针分别固定在芯片上,与浓度为5μmol/L的N,N′-对羧苄基吲哚三菁(Cy5)标记靶分子杂交,荧光图像扫描仪检测确定最佳杂交探针浓度;以最佳探针浓度构建芯片,分别与终浓度为0.1、0.2、0.5、1.0、2.0、5.0μmol/L的Cy5标记靶分子杂交,荧光图像扫描仪检测确定最佳杂交靶分子浓度;同时用光波导模式光谱生物传感器(OWLS)实时监测其杂交过程。以0.4%SDS和0.1%NaOH分别处理杂交后芯片10、20、30、60min,荧光图像扫描仪检测芯片再生稳定性。控制靶分子进样速度和杂交时间分别为15μl/h、7h和180μl/h、0.5h,OWLS测定杂交复合物质量、杂交效率和反应速率。结果荧光图像扫描结果显示,最佳杂交探针和靶分子浓度分别为10、1μmol/L,传感器芯片构建成功且具有再生稳定性。15μl/h、7h和180μl/h、0.5h条件下,P0T0、P3T3、P4T4、P4T3杂交复合物的质量(ng/cm2)分别为45和30、43和20、40和13、42和18;杂交效率(%)分别为40.9和27.3、39.1和18.2、36.4和11.8、38.2和16.4;杂交7h时的反应速率常数[K,105L/(mol·s)]值分别为0.465、0.247、0.081、0.247。结论在一定时间内,探针和靶分子二级结构增多可导致杂交时间延长,杂交速率和效率降低。应用OWLS成功建立了一种研究固-液界面DNA杂交过程的新平台,为研究基因芯片的杂交过程提供了一个新方法。
- 钟连声齐华文潘忠诚马汝海何群姜雪赵雨杰
- 关键词：寡核苷酸序列分析核酸杂交
