彭沙沙
- 作品数:5 被引量:29H指数:3
- 供职机构:浙江农林大学林业与生物技术学院更多>>
- 发文基金:浙江省重大科技专项基金国家自然科学基金浙江省科技计划项目更多>>
- 相关领域:生物学农业科学更多>>
- 杉木材性相关基因的克隆、表达及单核苷多态性分析
- 杉木是我国特有的常绿针叶树种,其生长快,木材纹理直,结构细,耐腐力强,用途广泛。本研究以杉木为材料,克隆其纤维素合成酶及类似蛋白基因,并对肉桂酰辅酶A还原酶(CCR)基因组部分序列进行单核苷酸多态性(SNP)分析。主要结...
- 彭沙沙
- 关键词:杉木单核苷酸多态性
- 文献传递
- 光皮桦ACC氧化酶基因BlACO的克隆和表达分析被引量:4
- 2010年
- ACC(1-aminocyclopropane-1-carboxylic acid)氧化酶(ACO)是植物乙烯合成过程中的关键限速酶,对乙烯的合成具有重要的调控作用。以光皮桦茎叶组织提取的RNA为模板,据已报道的ACO同源序列设计简并引物,通过RT-PCR扩增获得部分基因片段,结合5',3'RACE方法从光皮桦中扩增出1个ACO的全长cDNA序列。该基因cDNA全长1262bp,具有一个957bp的完整开放阅读框架,编码含318个氨基酸的蛋白。与其他植物中的ACO基因进行同源性比对的结果显示,BlACO蛋白与欧洲白桦的同源性最高,达到97%。该基因在光皮桦的雄花和雌花中表达量较高,而在茎中的表达量较低。
- 周厚君黄华宏林二培程龙军彭沙沙童再康
- 关键词:光皮桦ACO基因克隆
- 濒危植物伯乐树遗传多样性的初步研究被引量:13
- 2011年
- 利用ISSR和RAPD分子标记技术对23份伯乐树材料进行遗传多样性研究。结果表明,筛选出的13条ISSR和10条RAPD引物分别得到79条和57条扩增带,其中多态性条带分别为50条和33条,多态性条带比率分别为63.29%和57.89%;ISSR和RAPD检测的有效等位基因数分别为1.4036和1.3601,基因多样性为0.2305和0.2115,Shannon信息指数为0.3405和0.3145;分析表明23份伯乐树之间具有比较丰富的遗传变异。对比ISSR和RAPD在PCR反应中的稳定性和检测变异的能力表明,对于试验条件的稳定性而言,ISSR优于RAPD,且总的来说ISSR能检测到比RAPD更多的遗传变异。另外,本研究推断人类活动的干扰和生境的片断化是导致伯乐树濒危现状的主要因素之一。
- 彭沙沙黄华宏童再康周厚君时剑余国民骆文坚
- 关键词:伯乐树RAPDISSR
- 杉木纤维素合成酶类似蛋白基因ClCslD1的克隆及其生物信息学分析被引量:3
- 2012年
- 纤维素合成酶类似蛋白(CSL)作为一种重要的膜蛋白与纤维素合成酶具有相类似的蛋白结构,都含有D,D,D,QXXRW保守区。利用其他物种中的CesA基因的保守序列设计简并引物,采用反转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)结合cDNA末端快速扩增技术(RACE)成功地从杉木Cunninghamia lanceolata中扩增出一个含有完整阅读框架的cDNA序列,长度为4 150 bp,开放阅读框架为3 396 bp,编码1 132个氨基酸并含有保守的D,D,D,QXXRW天冬氨酸残基序列。应用美国国家生物技术信息中心(NCBI)数据库对获得的基因进行序列分析比对,发现它属于CslD基因家族,命名为ClCslD1基因。多重序列比对结果分析表明,该蛋白与来自颤杨Populus tremuloides,水稻Oryza sativa,拟南芥Arabidopsis thaliana等的同源基因相似性高达71%以上。利用生物软件对其进行生物学分析,为进一步研究其在植物纤化中的功能奠定基础。
- 彭沙沙童再康黄华宏周厚君时剑林二培
- 关键词:林木育种学杉木克隆
- 中国石蒜SSR体系的建立及性状对应分析被引量:8
- 2011年
- 为开发利用石蒜属球根花卉资源和开展分子标记辅助选择育种,利用正交试验和单因素试验建立了中国石蒜的SSR分子标记体系:20μL含Taq酶0.5U、Mg2+1.5mmol·L-1、dNTP0.125mmol·L-1、Primer0.5mmol·L-1、DNA50ng。利用该体系对石蒜属的8个物种和中国石蒜种内35个无性系进行扩增,每对引物在种间平均得到7个多态性位点,在中国石蒜种内得到9.5个多态性位点,反映出该体系具有较好的通用性和稳定性。利用对应分析法对中国石蒜的花葶高度、开花期等性状和SSR扩增条带之间的对应关系进行关联分析,初步得到与迟花期‘Oct’性状相关的Ly97和Ly98条带,与中矮花葶高度‘Mid’、‘Low’性状相关的Ly84、Ly87和Ly97条带等,并提出开展进一步的杂交和遗传测定,对辅助选择标记的可靠性进行验证。
- 时剑童再康黄华宏刘志高彭沙沙周厚君
- 关键词:石蒜属中国石蒜SSR标记