白林泉
- 作品数：167 被引量：173H指数：6
- 供职机构：上海交通大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学轻工技术与工程医药卫生化学工程更多>>
- 阿维菌素的优化生产方法
- 一种生物医药技术领域的阿维菌素的优化生产方法，通过构建包含sav933基因和sav934基因的超量表达质粒pFAveT，并将所述的表达质粒转入阿维链霉菌3-115中，实现产量的提高。本发明在抗生素工业生产菌株里超量表达外...
- 白林泉邱竞帆朱冬青邓子新
- 文献传递
- 春雷霉素低产和高产菌株的比较基因组分析被引量：4
- 2018年
- 氨基糖苷类抗生素春雷霉素由春雷链霉菌和小金色链霉菌产生,广泛应用于农业病害的防治。本研究利用二代和三代测序技术相结合的策略对低产的春雷链霉菌BCRC12349（Streptomyces kasugaensis BCRC12349,LY）和高产的小金色链霉菌XM301（S.microaureus XM301,HY）进行了全基因组测序,发现高产菌株染色体比低产菌株小了将近200 kb。比较基因组分析发现,与低产菌株相比,高产菌株中存在41个插入缺失（In Del）和164个单碱基突变位点（SNV）。基于RNA-seq的比较转录组分析发现,高产菌株中的一些初级代谢关键基因、春雷霉素前体合成相关基因、春雷霉素生物合成基因簇内部基因的转录发生了上调。同时发现基因组中调控基因有44个显著上调、16个显著下调,转运蛋白基因有32个显著上调、11个显著下调。高产菌株和低产菌株基因组和转录组的比较分析为春雷霉素产生菌的进一步高产改造提供了理论基础。
- 刘晓霞朱琛琛张晓洁邓子新白林泉蒋明
- 关键词：春雷霉素链霉菌比较基因组
- 增强表达安丝菌素体内靶标蛋白APASM_1807的高产安丝菌素方法
- 本发明公开了一种增强表达安丝菌素体内靶标蛋白APASM_1807的高产安丝菌素方法。通过在珍贵束丝放线菌ATCC 31280中，利用强启动子kasOp*分别增强表达安丝菌素体内靶标蛋白APASM_1807，得到高产安丝菌...
- 白林泉黄群刚
- 增强表达安丝菌素体内靶标蛋白APASM_6307的高产安丝菌素方法
- 本发明公开了一种增强表达安丝菌素体内靶标蛋白APASM_6307的高产安丝菌素方法。通过在珍贵束丝放线菌ATCC 31280中，利用强启动子kasOp*分别增强表达安丝菌素体内靶标蛋白APASM_6307，得到高产安丝菌...
- 白林泉黄群刚
- 抗生素生物合成调控元件的功能解析
- 2016年
- 抗生素生物合成的整个过程由多个环节构成,受到前体物供给、装配、外运、调控和抗性等因素的影响,因此形成了相应的各种生物合成元件和模块。其中最为重要的是控制生物合成基因转录和翻译等表达水平的调控蛋白及其机制。放线菌的调控蛋白有全局性、多效性和途径专一性三种类型,并形成复杂的级联调控网络,对抗生素的合成实施严谨的控制。调控基因的功能鉴定和调控机理的解析是定向提高生物合成基因转录水平和抗生素产量的重要前提,也是构建抗生素高效合成的放线菌底盘生物的必要基础。在该研究执行的前两年,本研究重点对纳他霉素产生菌和天蓝色链霉菌的多个重要调节基因及其调控机制展开了深入的研究。抗生素生物合成途径优化的重要策略之一是提高生物合成基因及其编码蛋白的表达水平,因此,解析抗生素生物合成的调控机制是实施该策略的重要前提。该研究对恰塔努加链霉菌和天蓝色链霉菌中跟那他霉素、十一烷基灵菌红素和放线紫红素相关的多个途径专一性基因和多效性基因进行了功能鉴定,揭示了放线菌抗生素生物合成复杂而特别的调控机制,为途径优化和优良底盘生物的构建奠定了基础,而且通过调控基因的改造显著提高了抗生素的产量或缩短了发酵周期,已经初步显示出改造调节基因是提高抗生素产量的重要合成生物学策略。
- 李永泉毛旭明康前进白林泉
- 关键词：抗生素生物合成放线菌
- 提高井冈霉素发酵水平的方法
- 一种提高井冈霉素发酵水平的方法，通过在吸水链霉菌井冈变种5008中双缺失转录负调控基因SHJG7318和SHJG4003，实现井冈霉素产量和产率的提高。本发明所得到工程菌株井冈霉素的发酵产量提高50％以上，抗生素合成速率...
- 谭高翼白林泉钟建江
- 文献传递
- 白色链霉菌DSM 41398中洋橄榄菌素和放线吡喃酮的发现及其生物合成途径分析
- 2018年
- 【目的】从菌株Streptomyces albus DSM 41398的发酵产物中发掘结构多样的由I型聚酮合酶催化形成的化合物,以期找到具有新颖结构或强生物活性的化合物。在结构鉴定的基础上,对其生物合成途径进行分析。【方法】利用HPLC分析方法,通过系统比较野生型菌株S.albus DSM 41398与I型聚酮合酶编码基因簇失活突变株的发酵产物差异,实现目标化合物的定向分离。然后,利用~1H-和^(13)C-NMR以及HR-ESI-MS进行化合物的结构鉴定。最后,利用生物信息学等方法对化合物的生物合成途径进行推测和分析。【结果】从5 L的S.albus DSM 41398发酵产物中,分离得到了2个具有抗肿瘤活性的聚酮类化合物放线吡喃酮和洋橄榄菌素,分别定位了它们的生物合成基因簇,并分别对其生物合成途径进行了推导。其中,放线吡喃酮的生物合成基因簇为首次报道。【结论】本研究一方面为基因组发掘S.albus DSM 41398中其他由I型聚酮合酶催化形成的化合物提供参考,另一方面也为相关化合物的结构修饰改造奠定了良好的基础。
- 谢守锋芦晨阳胡晓婧蒋程恺康前进白林泉邓子新
- 盐霉素的生物合成基因簇及其应用
- 本发明涉及盐霉素的生物合成基因簇及其应用，具体地，本发明提供了一类由白色链霉菌产生的具有球虫抑制活性和生长促进活性的抗生素-盐霉素(salinomycin)的生物合成基因簇的克隆、测序、分析、功能研究及其应用。整个基因簇...
- 白林泉姜春艳王后根
- 文献传递
- 低毒匹马霉素衍生物及其制备方法和应用
- 一种低毒匹马霉素衍生物，分子式为C<Sub>33</Sub>H<Sub>49</Sub>NO<Sub>10</Sub>，化学结构式如下：<Image file="DDA0000595997350000011.GIF" h...
- 白林泉齐震康前进姜春艳
- 文献传递
- 提高植物耐盐能力的GmSLT蛋白及核酸和应用
- 本发明涉及一种植物学技术领域的提高植物耐盐能力的GmSLT蛋白及核酸和应用；所述GmSLT蛋白含如下氨基酸序列中的一种或多种：如SEQ ID NO.3所示的结构域ABS序列，如SEQ ID NO.4所示的TM序列，以及如...
- 马伟刘晓丽向东厉建蕾李泉李晴熊新彩白林泉邓子新
