何苗
- 作品数：2 被引量：8H指数：2
- 供职机构：西北濒危药材资源开发国家工程实验室更多>>
- 发文基金：“十一五”科技支撑计划国家基础科学人才培养基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 丹参BTF3基因的克隆及生物信息学分析被引量：6
- 2009年
- 采用PCR及RT-PCR技术分别从丹参基因组DNA和cDNA水平克隆了通用转录因子3(Basic TranscriptionFactor3,BTF3)基因,运用生物信息学方法对该基因编码氨基酸序列的组成成分、疏水性/亲水性、翻译后修饰、蛋白质高级结构等进行预测,利用实时荧光定量PCR检测丹参不同器官以及脱落酸和干旱诱导下BTF3的表达情况。结果表明:丹参BTF3基因全长为1510 bp,包含5个外显子和4个内含子;cDNA全长794 bp,编码蛋白整体表现为亲水性,二级结构主要由α-螺旋、不规则卷曲组成,具有NAC结构域,与其他植物的BTF3在序列组成、结构及活性位点上有高度的相似性。丹参BTF3基因在根、茎、叶中均有不同程度的表达,表达丰度为:根>茎>叶;ABA诱导该基因表达量24 h内没有显著的变化;干旱胁迫下该基因的表达受到抑制。
- 何苗武雪王喆之
- 关键词：生物信息学丹参
- 贯叶连翘ISSR-PCR反应体系的建立与条件优化被引量：2
- 2012年
- [目的]建立贯叶连翘的ISSR-PCR反应体系,并对其条件进行优化。[方法]以贯叶连翘基因组DNA为模板,用L16(45)正交试验设计系统分析引物浓度、Taq DNA聚合酶浓度、Mg2+浓度、dNTP浓度和模板DNA浓度5种因素对贯叶连翘ISSR-PCR反应扩增结果的影响。[结果]正交试验设计的方法可以用于贯叶连翘ISSR-PCR反应体系的建立,经过优化得到贯叶连翘ISSR-PCR反应体系的最佳条件为:20μl ISSR-PCR反应体系中含10×PCR buffer,Mg2+浓度1.2 mmol/L,Taq DNA聚合酶浓度50 U/ml,DNA浓度20 ng/μl,dNTP浓度250μmol/L,引物浓度0.75μmol/L。[结论]试验建立的贯叶连翘的ISSR-PCR反应体系重复性好、分辨率高,结果稳定可靠。
- 冯俊姣何苗联想
- 关键词：ISSR-PCR
