武雪
- 作品数：4 被引量：30H指数：3
- 供职机构：陕西师范大学生命科学学院药用植物资源与天然药物化学教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：“十一五”科技支撑计划更多>>
- 相关领域：生物学农业科学更多>>
- 丹参BTF3基因的克隆及生物信息学分析被引量：6
- 2009年
- 采用PCR及RT-PCR技术分别从丹参基因组DNA和cDNA水平克隆了通用转录因子3(Basic TranscriptionFactor3,BTF3)基因,运用生物信息学方法对该基因编码氨基酸序列的组成成分、疏水性/亲水性、翻译后修饰、蛋白质高级结构等进行预测,利用实时荧光定量PCR检测丹参不同器官以及脱落酸和干旱诱导下BTF3的表达情况。结果表明:丹参BTF3基因全长为1510 bp,包含5个外显子和4个内含子;cDNA全长794 bp,编码蛋白整体表现为亲水性,二级结构主要由α-螺旋、不规则卷曲组成,具有NAC结构域,与其他植物的BTF3在序列组成、结构及活性位点上有高度的相似性。丹参BTF3基因在根、茎、叶中均有不同程度的表达,表达丰度为:根>茎>叶;ABA诱导该基因表达量24 h内没有显著的变化;干旱胁迫下该基因的表达受到抑制。
- 何苗武雪王喆之
- 关键词：生物信息学丹参
- 植物查耳酮异构酶生物信息学分析被引量：8
- 2009年
- 查耳酮异构酶(CHI)是黄酮类化合物合成途径中的关键酶之一。利用生物信息学方法对该酶基因及编码蛋白进行系统的分析,将为深入开展研究打下基础。本文利用NCBI数据库中注册的CHI基因的核酸及氨基酸序列,以葡萄CHI为主,对其组成成分、疏水性/亲水性、翻译后修饰、蛋白质二级及三级结构等进行预测和推断。结果表明:葡萄CHI不具有明显的亲水或疏水区域;二级结构主要由α-螺旋、不规则卷曲和β-折叠组成,β-转角散布于整个肽链中;β3a-β3f连同α1-α7构成了蛋白三级结构的核心;包含CHI结构域;在高级结构、活性位点等方面具有较高的保守性。
- 陈克克武雪
- 关键词：生物信息学
- 葡萄乙醇脱氢酶基因Ⅲ的电子克隆及生物信息学分析被引量：16
- 2009年
- 利用电子克隆方法获得葡萄乙醇脱氢酶基因Ⅲ(ADHⅢ),并采用生物信息学方法对该基因编码蛋白从氨基酸组成、理化性质、跨膜结构域、疏水性/亲水性、亚细胞定位、高级结构以及功能域等方面进行了预测和分析。结果表明,葡萄ADHⅢ基因全长1 602 bp,包含1 140 bp的ORF,编码379个氨基酸,该蛋白不具有明显的疏水区域,也无跨膜结构域,α-螺旋和不规则卷曲是其二级结构的主要构件。葡萄ADHⅢ包含有ADH功能域,和其他植物的ADHⅢ在序列组成、高级结构及活性位点等方面均具有高度的相似性。
- 武雪黄晓丽王喆之
- 关键词：电子克隆生物信息学
- 鸦胆子脂溶性成分的GC-MS分析
- 本文采用索氏提取法提取鸦胆子中脂溶性成分,进行甲酯化处理后用气相色谱-质谱联用技术分离和鉴定脂溶性成分的组成和含量。从鸦胆子中分离鉴定出的19种脂溶性成分中,脂肪酸占99.91%(饱和脂肪酸占18.04%,不饱和脂肪酸占...
- 武雪
- 关键词：鸦胆子脂溶性成分气相色谱-质谱联用技术
- 文献传递
