叶丛华
- 作品数:13 被引量:27H指数:4
- 供职机构:云南农业大学更多>>
- 发文基金:云南省科技攻关计划云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目公益性行业(农业)科研专项更多>>
- 相关领域:农业科学医药卫生生物学更多>>
- 云南2008~2009年H9N2亚型禽流感病毒血凝素和神经氨酸酶基因序列分析被引量:4
- 2011年
- 禽流感病毒血凝素(HA)和神经氨酸酶(NA)是病毒粒子表面抗原,是亚型划分的重要依据。从云南分离的H9N2亚型禽流感病毒感染鸡胚尿囊液中提取总RNA,采用特异性引物经RT-PCR分别扩增云南毒株10个HA和9个NA基因,纯化后克隆至pMD18-T载体,并对其进行测序。序列比对及系统发育分析结果表明:云南H9N2毒株HA基因核苷酸序列同源性为95.0%~99.7%;NA基因核苷酸序列同源性为86.2%~99.6%。在进化分枝中HA基因均属于欧亚分枝的类CBJ194亚分枝,与CBJ194的核苷酸序列同源性为92.0%~99.1%,NA基因属于CK/BJ/1/94和QaHKG1/97两个分枝。云南毒株HA裂解位点结构具有低致病性病毒分子特征;HA受体结合位点143、145、198和234位氨基酸存在变异,尤其234位氨基酸全部变为L,呈现了人流感受体结合特性。NA糖基化位点61~63、86~88部分毒株存在缺失,部分毒株在143~145位出现新的糖基化位点。
- 宋建领叶丛华田建国张文东赵焕云吕粤岳亮邱薇刘加茂冯子良张思东范泉水张应国张富强
- 关键词:禽流感病毒H9N2亚型血凝素神经氨酸酶
- 云南边境禽流感H5N1亚型病毒血凝素基因进化特征分析被引量:4
- 2009年
- 目的:认识2003年~2008年期间云南边境禽流感H5N1亚型病毒血凝素(HA)基因的进化特征。方法:2003年~2008年期间在云南边境采集境外禽类样品380份,经H5/N1亚型特异性多重RT-PCR检测,对阳性样品中H5N1病毒HA基因进行RT-PCR扩增,克隆至pMD18-T载体测序,并与国内外已知参考毒株序列进行比对及系统发育分析。结果:多重RT-PCR检出18份阳性样品,阳性率4.74%;14份代表性病毒样品HA基因核苷酸和氨基酸序列同源性介于93.1%~99.3%、90.5%~99.1%;HA裂解位点序列存在4种不同排列方式,均具有高致病性禽流感病毒分子结构特征;系统发育分析表明阳性样品可划分为5个不同进化分枝(1、2.4、2.3.2、2.3.4、7)。结论:2003年~2008年期间云南边境境外H5N1亚型病毒间具有遗传差异,进化分枝2.3.4毒株已成为当地流行的优势毒株。
- 叶丛华张文东宋建领李静田建国吕粤岳亮邱薇李刚山冯子良郑颖张思东范泉水张应国王双印张富强
- 关键词:禽流感病毒H5N1亚型血凝素进化特征
- 云南地区马流感病毒检测及其HA基因序列分析被引量:7
- 2009年
- 马流感能引起马属动物的高度接触性呼吸道传染病。该病毒已知仅存在H7N7(马流感病毒1型)、H3N8(马流感病毒2型)两个亚型,目前仅H3N8亚型毒株在全球范围内引起马流感流行和暴发。采用A型及H3亚型特异性RT-PCR技术,检测云南疑似马流感病例鼻腔棉拭子样品;HA基因PCR扩增产物经纯化后,克隆至pMD18-T载体进行测序,并与已知代表性毒株对应序列进行比对及系统发育分析。研究发现云南马流感病毒与已知代表毒株血凝素基因核苷酸及氨基酸序列同源性分别介于91.2%-99.2%和89.5%-98.4%,属于美洲谱系(American lineage)佛罗里达亚谱系(Florida sub-lineage)毒株。
- 田建国叶丛华张文东宋建领吕粤岳亮邱薇冯子良张思东范泉水张应国张富强
- 关键词:马流感病毒血凝素基因测序
- 云南境外禽流感H5N1亚型病毒神经氨酸酶基因进化及分子结构特征分析
- 2010年
- 目的:禽流感病毒神经氨酸酶(NA)是病毒粒子重要表面抗原之一,其抗原性差异决定病毒神经氨酸酶亚型(N1-N9)的划分。NA介导病毒对敏感细胞的侵染及协助子代病毒粒子的成熟和释放,与病毒的宿主嗜性及毒力有关。方法:对2003~2009年期间采集自云南境外家禽的H5N1亚型阳性样品中病毒NA基因进行测序,并与国内外已知代表毒株进行序列比对及系统发育分析。认识云南境外禽流感H5N1亚型病毒神经氨酸酶(NA)基因分子结构特征。结果:21份代表性病毒样品NA基因核苷酸和氨基酸序列同源性介于94.3%~99.3%、93.1%~99.3%。系统发育分析表明可划分为6个不同进化(亚)分支(1、7、9、2.4、2.3.2、2.3.4),其中进化亚分支2.3.4毒株已成为当前云南境外流行的优势毒株;所有云南境外毒株NA蛋白的49-68位氨基酸均存在缺失。结论:糖基化位点存在特有变异;云南境外毒株对Oseltam ivir(达菲)类抗病毒药物可能无耐药性。
- 董波张文东宋建领赵焕云叶丛华田建国吕粤岳亮邱薇冯子良张思东苑述友范泉水张应国张富强
- 关键词:禽流感病毒H5N1亚型神经氨酸酶系统发育分子特征
- 云南边境禽流感H5N1亚型病毒血凝素基因分子结构特征分析被引量:8
- 2010年
- 目的分析2003-2008年云南边境禽流感H5N1亚型病毒血凝素(HA)基因分子结构特征。方法对2003-2008年在云南边境采集境外禽类样品420份,做H5/N1亚型特异性RT-PCR及多重RT-PCR检测,对阳性样品中H5N1病毒HA基因进行RT-PCR扩增,克隆至pMD18-T载体测序,并与国内外已知参考毒株序列进行比对及系统发育分析。结果21份代表性病毒样品HA裂解位点序列存在4种不同排列方式,均具有高致病性禽流感病毒分子结构特征;HA受体结合位点、糖基化位点及表位关键性氨基酸位点存在变异;系统发育分析表明可划分为5个不同进化分枝(1、2.4、2.3.2、2.3.4、7)。结论2003-2008年云南边境外H5N1病毒间具有遗传差异,进化分枝2.3.4毒株为当地流行的优势毒株,不同进化分枝或同一进化分枝不同毒株HA基因存在变异。
- 叶丛华张文东宋建领范泉水张应国张富强
- 关键词:禽流感病毒H5N1亚型血凝素分子特征
- 云南省高致病性禽流感病原监测及病毒基因组进化分析
- 叶丛华
- 关键词:H5N1亚型进化特征
- 云南结核分枝杆菌耐药基因变异分析
- 由结核耐药菌株引起的耐多药结核病和严重耐多药结核病是当前防治结核的重点和难点,而结核耐药菌株的产生与菌株耐药基因的变异密切相关。自云南6个地州临床呈现多重耐药的结核病人痰样品中,进行结核分枝杆菌rpoB、katG、pnc...
- 叶丛华田建国王玲张富强
- 文献传递
- 云南省新城疫病毒F基因测序及系统发育分析
- 鸡新城疫是由新城疫病毒(NDV)引起的一种高度接触性传染病,主要侵害鸡和火鸡,其他家禽、野禽及人也能感染。新城疫病毒属于副粘病毒科腮腺炎病毒属。其基因组为15kb左右的单股负链RNA,编码6种结构蛋白,其中融合蛋白(F)...
- 叶丛华田建国宋建领张文东王金萍李静吕粤岳亮张应国范泉水张富强
- 文献传递
- 云南省猪圆环病毒的分子流行病学调查及其2型cap基因遗传多样性分析
- 2009年
- 采用猪圆环病毒(PCV)通用PCR技术和PCV-2特异性PCR技术检测云南省2007~2008年采集的120份病猪组织样品,结果获得PCV-2阳性样品21份。选取12份有代表性的阳性样品进行cap基因的扩增、纯化,将产物克隆至pMD18-T载体测序,并与已知参考毒株进行比对及系统发育分析。结果显示,云南省12份阳性样品cap基因的核苷酸及氨基酸序列的同源性分别为92.4%~99.7%和94.4%~99.6%;与国内PCV-2毒株cap基因的核苷酸和氨基酸序列同源性为89.3%~92.9%、88.4%~94.0%;与国外毒株的核苷酸和氨基酸序列同源性为90.0%~99.4%、93.6%~99.6%。有25个氨基酸位点存在变异,其中14个位点位于抗原表位区;12份阳性样品可划分为3个进化分枝(1.1.1.1、1.1.2、1.2),其中1.1.2、1.2可能是新出现的分枝。
- 王瑞欣张文东庞海洋叶丛华田建国吕粤岳亮张应国张富强宋学林
- 关键词:猪圆环病毒2型
- 新城疫病毒云南分离株F基因变异特性分析被引量:4
- 2010年
- 采用RT-PCR技术对云南2007年-2009年采集的948份喉气管拭子或组织样品中新城疫病毒F基因进行检测,获得阳性样品65份,选择30份代表性阳性样品采用特异性引物经RT-PCR扩增F基因,纯化后克隆至pMD18-T载体,并对其进行测序。序列比对及系统发育分析结果表明,新城疫病毒云南分离株F基因核苷酸与疫苗LaSota株之间的同源性为70.5%~99.8%,与F48E9株之间的同源性为70.7%~90.8%。系统发育分析表明,30株病毒中21株属于基因型Ⅶ,裂解位点氨基酸为R-R-Q-K-R-F,与传统认为强毒裂解位点氨基酸序列相同;7株属于基因型Ⅱ,5株裂解位点氨基酸为G-R-Q-G-R-L,属于弱毒株裂解位点氨基酸排列特征,2株裂解位点氨基酸为R-R-Q-K-R-F属于强毒裂解位点氨基酸序列;2株病毒与9个基因型的同源性差异较远。
- 宋建领田建国叶丛华张文东赵焕云吕粤岳亮王金萍邱薇冯子良张思东范泉水张应国张富强
- 关键词:新城疫病毒F基因基因型