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Pathogen detection in Prostate Cancer using NGS data: Background: Prostate Cancer (PCa) is one of the most common cancers in men.Many microbes were reported to be p...; 陈垚文李宗城胡朔枫张健邵宁生应晓敏; 关键词：PROSTATE CANCER PATHOGEN RNA-SEQ

Functional annotation of lncRNAs based on lncRNA-Histone modification association network: Background: Increasing evidences demonstrate that long non-coding RNAs (lncRNAs) play many important roles in ...; 李宗城陈垚文胡朔枫张健邵宁生应晓敏; 关键词：LONG NON-CODING FUNCTIONAL ANNOTATION ASSOCIATION NETWORK

基于整合组学的肿瘤分子分型研究: 恶性肿瘤是威胁人类健康的重要疾病之一。近年来肿瘤的发病率呈现上升趋势，死亡率也一直居高不下，而且患者人群越来越趋于年轻化。因此，对肿瘤的诊断和治疗的研究成为当前生命科学和医学领域最为迫切和重要的课题之一。传统临床上，主要...; 李宗城; 关键词：乳腺癌非编码RNA 分子分型蛋白表达; 文献传递

A long non-coding RNA signature predicts survival of patients with non-small-cell lung cancer: Background: Long non-coding RNAs (lncRNAs) have been reported to play important roles in cancer development.To...; 张健胡朔枫李宗城陈垚文应晓敏; 关键词：LUNG CANCER LONG NON-CODING SIGNATURE

基于全基因组范围发现及验证创伤弧菌sRNA: ＜正＞目的:创伤弧菌是一种革兰氏阴性条件致病菌,分为三种生物型,其中生物Ⅰ型易引起人类败血症和伤口感染,致死率高。创伤弧菌一些相关致病物质陆续被发现,但基于sRNA调控机制的研究尚未开展。细菌sRNA是一类50-500n...; 曹源李宗城应晓敏李伍举胡成进; 文献传递

体内与体外RNA-RNA相互作用的比较初探: 2013年; 目的通过比较in vitro与in vivo的RNA-RNA相互作用(RNA-RNA interaction,RRI),探究通过in vitroRRI推测in vivo RRI的可靠性。方法采用perl语言编写脚本分析酵母转录组水平in vitro RNA的二级结构信息,得到可能的in vitro RRI,再与酵母的in vivo小核仁RNA(snoRNA)-rRNA相互作用进行比较。结果发现in vitrosnoRNA-rRNA相互作用与in vivo snoRNA-rRNA相互作用的重叠率仅为23.42%(26/111);而in vitro测定的snoRNA双链片段与in vivo测定的参与RRI的snoRNA片段重叠率为38.78%(19/49);in vitro测定的rRNA双链片段与in vivo测定的参与RRI的rRNA片段重叠率为80.70%(46/57)。结论 in vitro和in vivo条件下snoRNA-rRNA的相互作用差异很大,提示in vitro条件下测定的snoRNA-rRNA的相互作用不能真实反映它们在in vivo的相互作用。; 陆启轩查磊李宗城陈临溪李伍举应晓敏; 关键词：生物信息学 RNA 核糖体RNA

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李宗城