李伟红
- 作品数：33 被引量：301H指数：9
- 供职机构：北京市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：首都卫生发展科研专项国家科技重大专项北京市自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学理学环境科学与工程更多>>
- 2022年北京市通州区一起霍乱疫情分离菌株的病原学特征分析
- 2023年
- 目的分析2022年北京市通州区一起霍乱弧菌引起的疫情的病原学特征,并与引起通州区过往疫情的菌株进行比对分析。方法用实时荧光PCR方法检测样本中O1/O139群霍乱弧菌的特异性基因,同时按常规法对样本进行菌株的分离培养鉴定;用普通PCR方法检测霍乱弧菌的11种毒力基因;用微量肉汤稀释法进行12种药物的敏感性试验,采用NotⅠ限制性内切酶进行脉冲场凝胶电泳(PFGE)和聚类分析,基于全基因组序列进行菌株遗传学分析。结果本次疫情共检出5株O1群小川型非产毒霍乱弧菌,所有菌株均携带ompU、toxR、tcpI、tcpA^(EL)、hlyA^(EL)、hlyA^(CL)和rtxC基因,不携带ctxAB基因,5株菌耐药情况一致,均为美罗培南–头孢噻肟–头孢他啶–链霉素–氨苄西林–氨苄西林/舒巴坦6种药物耐药,为多重耐药菌株。PFGE分6种带型Ⅰ~Ⅵ,本次疫情菌株带型为Ⅱ型。与通州区既往检出的菌株相比,与2011年2株产毒O1群小川型霍乱弧菌带型较为接近,耐药情况一致,毒力基因携带情况有所差异,但都携带tcpA^(EL)基因。遗传学分析显示本次疫情菌株为不同于第七次世界大流行菌株的新出现的克隆群。结论通州区流行的O1群霍乱菌株以多重耐药小川型非产毒株为主,PFGE带型分散,本次疫情菌株是新出现的克隆群,以后的霍乱防控工作中应重视此类菌株并制定相应的策略。
- 张萍邹林高翔杨郝亮甄博珺李伟红郭晓晨林长缨李仁清严寒秋逄波
- 关键词：O1群霍乱弧菌毒力基因脉冲场凝胶电泳遗传学分析
- 综合指数法建立北京市诺如病毒急性胃肠炎流行水平分级标准被引量：4
- 2019年
- 目的建立北京市诺如病毒急性胃肠炎流行水平分级标准,针对不同流行水平制定相应防控措施建议.方法利用北京市2014—2018年4个流行季诺如病毒急性胃肠炎病原学及聚集性疫情监测数据,采用综合指数法,对原始监测数据进行标准化处理,赋予不同权重,计算周综合指数并划分流行强度等级.结果 4个流行季共208个监测周的综合指数值范围为0.2~4.4,中位数为0.5.将诺如病毒急性胃肠炎流行水平分为5个等级,等级1~5强度递增.0.5为流行期与非流行期的划分阈值,0.8、1.5和3.5分别作为流行强度等级2~5的划分阈值.经专家研讨制定相应等级防控建议.结论本研究建立了北京市诺如病毒急性胃肠炎流行水平分级标准,并提出相应防控措施,为2018—2019年流行季的防控工作提供了依据.
- 王宇贾蕾高志勇刘白薇田祎严寒秋李伟红王小莉王全意
- 关键词：诺如病毒急性胃肠炎综合指数法
- 2011—2018年北京市门诊儿童轮状病毒检出率的季节特征分析及模型预测被引量：3
- 2019年
- 目的分析2011—2018年北京市门诊儿童轮状病毒检出率的季节性分布规律,探讨合适的预测模型。方法采用圆形分布法对2011年7月—2018年6月北京市门诊儿童轮状病毒检出率的时间分布特征进行分析,应用Eviews 9.0构建和优化SARIMA模型,模型预测2018年7—12月北京市门诊儿童轮状病毒检出率,并与实际值进行比较验证模型。结果2011—2018年北京市门诊儿童轮状病毒的检出存在季节性(M=0.59),除2012—2013年度外,流行趋势基本相同。高峰集中在冬春季(11月—次年1月),每年均存在高峰日和高峰期,但各年的高峰日不全相同(F=9.23,P<0.05)。最优模型为SARIMA(1,1,1)×(1,0,2)12,预测的平均绝对误差为5.65%。结论2011—2018年冬春季北京市门诊儿童轮状病毒检出率较高,SARIMA(1,1,1)×(1,0,2)12模型拟合效果较好,可用于北京市门诊儿童轮状病毒检出率的预测。
- 田祎严寒秋高志勇刘白薇陈艳伟李伟红贾蕾王全意
- 关键词：轮状病毒圆形分布法SARIMA模型
- 北京市农村人群及家畜嗜吞噬无形体和查菲埃立克体感染状况调查被引量：6
- 2012年
- 目的调查北京市农村人群及家畜新发查菲埃立克体和嗜吞噬无形体感染状况。方法按地理位置选择北京市西北（延庆）、东北（密云）及东南（通州）地区3个植被率较高的旅游县（区）。按在册户籍随机以家庭为单位，调查并采集562人及90只山羊、71头牛和2只家犬血液标本，按WHO推荐间接免疫荧光方法（mIFA）检测血清IgG抗体。动物血球提取DNA扩增无形体16SrRNA基因并测序分析。结果人群查菲埃立克体和嗜吞噬无形体抗体阳性率分别为16．5％和14．0％；山羊和牛嗜吞噬无形体抗体阳性率分别为2．3％和0；2只家犬未检测到相应抗体。山羊、牛无形体16SrRNA扩增阳性率分别为48．9％和23．9％。16SrRNA序列（228bp）分析显示，3类优势流行株无明显地理分布特征。结论北京市农村人群存在查菲埃立克体和嗜吞噬无形体感染，调查地区家畜存在无形体感染。
- 张秀春张立霞李伟红王誓闻孙玉兰王圆圆关增智刘秀军杨育松张曙光禹惠兰张丽娟
- 关键词：查菲埃立克体血清流行病学
- 北京市市售结球生菜诺如病毒和轮状病毒污染状况调查被引量：2
- 2020年
- 目的调查北京市市售结球生菜诺如病毒(norovirus,NoV)和轮状病毒(rotavirus,RV)污染情况。方法2015年11月至2016年10月,在北京市某菜市场摊位采集结球生菜54件。用离心法和直接法,分别对应3种洗脱液洗脱菜叶中病毒并浓缩,用荧光PCR法检测NoV和RV核酸。用半巢式RT-PCR方法扩增NoV阳性样本的衣壳蛋白区基因,PCR产物直接测序,用BioEdit7.0.9.0软件进行序列比对,用MEGA6.06软件构建进化树。结果54件结球生菜,未检出RV。NoV总检出率为11.1%(6/54),其中GI组1件、GⅡ组3件、GI/GⅡ组混合2件。春夏秋冬季检出率依次为8.3%(1/12)、0.0%(0/8)、28.6%(4/14)和5.0%(1/20)。1件GⅡ阳性样本测序成功,为GⅡ.3基因型,该毒株与2014年广东省人源毒株KY348698相似性最高100.0%。结论北京市市售部分结球生菜存在人源NoV污染,生食未洗净结球生菜有引起病毒性急性胃肠炎的风险。
- 严寒秋陈艳伟田祎李伟红刘白薇高志勇王全意
- 关键词：结球生菜诺如病毒轮状病毒基因型
- 北京市肠道门诊腹泻患者人杯状病毒感染调查被引量：10
- 2012年
- 目的调查北京地区肠道门诊就诊腹泻患者人杯状病毒的感染情况。方法收集北京市2011年4月至2012年3月丰台、昌平、怀柔3个区县的肠道门诊就诊腹泻患者450例，采集患者粪便标本，使用逆转录聚合酶链反应法（RT—PCR）对粪便标本进行人杯状病毒RNA检测，对RT—PCR阳性标本的PCR产物进行克隆测序。结果450例患者标本中68例人杯状病毒阳性（68／450，15．11％）。选择其中18例PCR产物进行克隆测序，将获得的序列进行比对分析、构建系统发生树，结果表明，15株为诺如病毒，3株为扎如病毒。其中诺如病毒GII／4型11株（11／18，61．11％），GII／7型1株（1／18，5．56％），G1I组未定型3株（3／18，16．67％）。结论人杯状病毒足北京地区肠道门诊就诊腹泻患者的重要病原，主要流行株为诺如病毒G1I／4型。
- 邓瑛高志勇严寒秋李锡太李伟红李洁贾蕾王全意
- 关键词：肠道门诊腹泻人杯状病毒基因型
- 北京市2008年肠道病毒71型VP_1编码区基因特征分析被引量：10
- 2009年
- 目的了解北京市2008年手足口病(Hand,Foot and Mouth Disease,HFMD)流行期间,人肠道病毒71型(Human Enterovirus71,HEV71)分离株的VP1编码区基因特征。方法采集发病1～3d的咽拭子标本33份,采用人横纹肌肉瘤(Human Rhabdomyosarcoma,RD)细胞进行EV分离,用特异引物通过逆转录-聚合酶链反应扩增进行毒株鉴定。对分离到的HEV71进行VP1编码区全长扩增,并对扩增产物采用双脱氧链终止法进行序列测定,Bioedit7.0.5和Mega3.1软件进行序列比对和系统进化树分析。结果从33份咽拭子标本中共分离到16株病毒,经鉴定:HEV7114株,柯萨奇病毒(Coxsackie Virus,CV)A组16型(CVA16)2株,其中1例为HEV71和CVA16混合感染。对10株HEV71进行了VP1编码区全序列测定,10株病毒的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为95.5%～100%和98.9%～100%;与安徽省阜阳市2008年流行株的核苷酸和氨基酸序列同源性分别为95.4%～99.1%;与C4基因型代表株的核苷酸序列同源性>92%。基于HEV71的VP1编码区核苷酸序列构建亲缘性关系树,北京市2008年流行株与C4亚型代表株聚为一簇,属于C4基因亚型中的C4a分支;且10株病毒处于四个相对独立的进化分支。结论北京市2008年从HFMD患儿分离的HEV71均为C4亚型,且属于2004年以来我国的优势分支——C4a。亲缘性分析提示,此次流行中至少存在4个HEV71传播链。由于近年来HEV71在中国持续大规模流行,迫切需要对HEV71进行连续的分子流行病学监测,及时阐明现阶段流行毒株的基因特征,为疾病预防控制提供病毒学依据。
- 黄芳李伟红檀晓娟曲梅吕燕宁丁立新
- 关键词：肠道病毒71型基因型分子流行病学
- 牡蛎中诺如病毒检测的前处理方法比较及应用被引量：9
- 2015年
- 目的 对牡蛎中诺如病毒检测的三种前处理方法进行比较并探讨应用策略.方法 2014年8月-2015年3月采集160只市售牡蛎,每组5只,共32组样品,取其肠腺组织采用直接处理法（M1）、PEG 8000沉淀法（M2）和蛋白酶K消化-PEG 8000沉淀法（M3）三种方法进行前处理,提取核酸后荧光定量RT-PCR检测诺如病毒核酸.应用串并联法对三种前处理方法的样品阳性率进行分析,利用x2检验比较不同方法的阳性率差异,应用一致性检验比较不同方法的一致性,对荧光RT-PCR所得到的Ct值进行ANOVA检验.结果 M1、M2、M3三种前处理方法诺如病毒阳性率依次为15.63％（5/32）、34.38％ （11/32）和37.50％ （12/32）;M1/M2/M3并联使用的阳性率最高,为50.00％ （16/32）;其次为M2/M3并联法,阳性率为46.88％ （15/32）;M1＋ M3串联或M1＋ M2＋ M3串联的阳性率最低,均为9.38％ （3/32）.M2/M3与M1/M2/M3的阳性率经x2检验比较,差异无统计学意义（P＞0.05）,两种方法经一致性检验,kappa=0.931（P＜0.05）,一致性较高.M1、M2、M3三种方法检测阳性样品的Ct值依次为33.44±0.66、33.70±1.88和33.42±2.44.经ANOVA检验,差异无统计学意义（P＞0.05）.结论 常规监测时推荐使用M2或M3,暴发疫情溯源时可考虑使用M2/M3并联法.
- 严寒秋霍达刘白薇高志勇李伟红杜轶威梁志超杨扬陈丽娟王全意
- 关键词：牡蛎诺如病毒前处理荧光定量RT-PCR
- 北京市2014-2018年诺如病毒急性胃肠炎暴发的影响因素分析被引量：14
- 2019年
- 目的分析2014-2018年北京市诺如病毒急性胃肠炎暴发的影响因素.方法收集2014年4月至2018年3月北京市诺如病毒急性胃肠炎聚集性事件及暴发资料,应用非条件logistic回归模型分析诺如病毒急性胃肠炎暴发的影响因素.结果北京市共报告由诺如病毒感染引起的急性胃肠炎事件765起,85.88%(657/765)为聚集性事件,14.12%(108/765)为暴发.在暴发中,70.37%(76/108)发生在2017年;84.26%(91/108)发生在冬、春季节;88.89%(96/108)发生在托幼机构及中小学;主要传播途径为人传人(81.48%,88/108);93.52%(101/108)为GⅡ组诺如病毒感染引起.多因素logistic回归分析结果显示,在近郊区及远郊区发生的事件,出现暴发的风险分别是城区的1.84倍(95%CI:1.13~3.02)及3.78倍(95%CI:1.62~8.82);在小学、中学及其他机构发生的事件,出现暴发的风险分别是幼儿园的6.26倍(95%CI:3.53~11.10)、14.98倍(95%CI:6.23~36.01)及8.71倍(95%CI:3.07~24.71);就诊率低于全部事件就诊率中位数的,发生暴发的风险是就诊率高的2.29倍(95%CI:1.42~3.68);传播途径为食源性的事件,发生暴发的风险为人传人传播的14.55倍(95%CI:3.15~67.07).结论加强郊区、中小学及其他机构诺如病毒暴发疫情的防控力度,急性胃肠炎患者积极就医,做好食源性疫情的防控及厨工的健康管理,有助于减少诺如病毒急性胃肠炎的暴发.
- 刘白薇高志勇贾蕾严寒秋王小莉张惺惺李伟红王全意
- 关键词：急性胃肠炎影响因素
- 新型冠状病毒奥密克戎变异株核酸检测试剂盒的检测效果比较被引量：1
- 2022年
- 目的评估三种商业化试剂盒对新型冠状病毒奥密克戎变异株核酸检测的效果。方法收集2021年12月北京市监测发现的经测序分析确定为新型冠状病毒奥密克戎变异株的咽拭子标本8份,同时收集北京市2021年11月监测发现的新型冠状病毒德尔塔变异株咽拭子标本5份,用三种针对新型冠状病毒奥密克戎变异株的商业化荧光定量RT-PCR试剂盒进行检测,对检测效果进行比较分析。取其中两份Ct值较低的样本10倍系列稀释5个梯度,用于比较检测试剂的灵敏性。结果三种试剂盒均能特异性地检出8份奥密克戎变异株和5份非奥密克戎株(德尔塔变异株)。试剂A和B的灵敏性高于试剂盒C一个稀释度。结论三种试剂盒均能特异性地检测奥密克戎变异株。试剂盒A核酸用量最少,虽然只检测一个变异位点(Q498R),但该位点是奥密克戎变异株特有的,从而使实验操作和结果判定都更简便。
- 李伟红潘阳冯兆民张冬莹王丽丽丰一兴高志勇严寒秋张代涛
- 关键词：新型冠状病毒荧光定量RT-PCR检测试剂盒
