甄国亮
- 作品数：4 被引量：14H指数：2
- 供职机构：南京军区南京总医院更多>>
- 发文基金：江苏省社会发展科技计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生生物学更多>>
- HCV基因分型生物芯片探针设计的探讨被引量：5
- 2005年
- 目的 探讨适用于临床实验室的丙型肝炎病毒(hepatictisCvirus,HCV)基因分型诊断芯片的探针设计方案。方法 用TaxonomyBrowser和BLAST工具搜索GenBank中所有已登录的HCV序列,用Clustal.W算法进行序列连配与比对,用生物信息学方法获得 5′非编码区(5′UTR)和核心蛋白区(C区)的比对文件,根据探针设计的原则和要求,确定探针在序列中的位置。用Oligo6. 0和PrimerPremier5. 0软件设计探针。设计芯片上 6×6的探针阵列模式。结果 从 778个HCV序列中获得 5′UTR和C区序列变异比对文件,发现 7个存在活跃共突变的区域。根据序列分析数据设计了 5′UTR27个探针和C区 9个探针。设计了由不同的探针组合构成的 33种杂交阵列模式。结论 采用 5′UTR和C区多探针联合检测的基因芯片技术可简化HCV分型方法,提高检测结果的特异性。
- 甄国亮齐名陈亚利熊华王艾丽李保仝武建国
- 关键词：HCV基因分型核心蛋白基因芯片技术
- 非线性模型在蛋白质薄膜厚度测定中的应用被引量：1
- 2000年
- 为了通过测定蛋白质薄膜厚度变化而定量地研究生物分子间的相互作用 ,探讨了基于光学干涉法的薄膜厚度的测量方法。借助于在玻璃基底表面沉积的聚苯乙烯薄膜对噪声的抑制 ,使用非线性回归模型对生物传感器的检测信号进行了分析。通过反射干涉光谱法测定到乙型肝炎表面抗原在聚苯乙烯 -玻璃表面的吸附使薄膜厚度增加了3.3nm。随着5μg/ml,10μg/ml,20μg/ml,30μg/ml和50μg/ml浓度的乙型肝炎表面抗体的加入 ,薄膜厚度分别增加了3.7nm,4.3nm,5.3nm ,6.3nm和7.5nm。通过与经典的干涉测量技术和酶标记法相对照 ,证明了测量结果具有较高的可信度。
- 王德育蒋笃孝陈树建甄国亮袁春伟
- 关键词：非线性回归模型蛋白质
- HCV基因分型生物芯片的研制及HCV基因型与自身免疫关系的研究
- 丙型肝炎病毒(Hepatitis C virus，HCV)是血源性肝炎的主要病因，感染后极易慢性化，并与肝硬化和原发性肝癌的发生关系密切，对人类健康危害很大。HCV感染是我国目前一个严重的卫生问题。HCV是单股正链线状R...
- 甄国亮
- 关键词：生物芯片HCV基因分型自身免疫力分型诊断生物电子学
- 文献传递
- HCV基因型检测芯片的设计与研制初报被引量：8
- 2002年
- 目的 设计与研制丙型肝炎病毒 (HCV)基因型检测芯片。方法 用生物信息学方法设计HCV 5′UTR型特异性探针。按设计模式 ,以自动化微阵列点样仪将探针点样于APTES PDC修饰的玻片表面。用商品PCR试剂盒掺入荧光分子对患者血清样本进行扩增 ,用激光共聚焦荧光扫描仪检测并分析结果。结果 根据 5′UTR序列设计了各型HCV的特异性探针。芯片表面修饰符合固定探针和杂交检测的需求。含荧光分子的RT PCR产物可成功地与固定于芯片上的探针阵列杂交进行HCV基因型的检测。 2 1例丙型肝炎患者中 ,19例为 1b型 ,1例为 2a型 ,1例为混和型。结论 所设计研制的基因芯片可望成为检测HCV基因型的操作简便 ,结果准确 ,价格低 。
- 齐名甄国亮熊华刘新钰吴引伟袁春伟武建国
- 关键词：丙型肝炎病毒基因型生物芯片
