贵甫
- 作品数:6 被引量:20H指数:2
- 供职机构:福建农林大学更多>>
- 发文基金:国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域:农业科学更多>>
- 草菇葡萄糖-6-磷酸异构酶异核基因表达的协同增效作用
- 以草菇单孢菌株"Pyd21"(基因组测序菌株)和"Pyd15"(基因组重测序菌株)为材料,配对获得可正常出菇的异核菌株"1521".比对"Pyd21&...
- 刘鹏虎陈炳智贵甫江玉姬邓优锦谢宝贵
- 关键词:草菇
- 草菇基因组中的tRNA分析被引量:2
- 2013年
- 草菇(Volvariella volvacea),又名中国蘑菇,是一种生长于中国和东南亚的重要经济食用菌。本文基于本实验室的草菇基因组测序结果,分析了草菇基因组中的tRNA情况。草菇基因组的302个框架中,共发现了177个tRNA基因,其中有7个可能的假基因,有2个携带硒代半胱氨酸,一个抑制性tRNA基因和一个未知的异型结构tRNA。除了上述11个特殊的tRNA基因外,166个tRNA可按反密码子类型分成47类。与其它5种担子菌的基因组tRNA比较,草菇的tRNA数量处于第4位,少于鬼伞、裂褶菌、灵芝,多于双孢蘑菇和平菇。通过比较分析草菇及这5种大型真菌的基因组tRNA编码情况,首次报道了几种食用菌tRNA遵守修正的摆动假说的情况。另外,草菇的同功受体tRNA非编码子序列也具有差异性,对tRNA的分析将有助于进一步研究草菇的进化。
- 陈炳智谢宝贵胡良韬邓优锦江玉姬刘新锐贵甫
- 关键词:TRNA基因
- 草菇基因组分析
- 本研究以福建主栽的草菇(Volvariella volvacea)品种屏优一号(Py)的两个可亲和单孢PYd15和PYd21为实验材料,采用Solexa测序法对PYd21进行denovo sequencing(从头测序)...
- 章小寅邓优锦江玉姬贵甫陈炳智谢宝贵
- 关键词:串联重复序列转座子单核苷酸多态性
- 草菇数字基因表达谱揭示同核体与异核体CAZymes表达差异
- 草菇(Volvariella volvacea)为草腐真菌,在热带和亚热带地区是一种重要的食用真菌。草菇野生种多生长在稻草等草本植物上。而生产中,多以稻草或废棉等富含纤维素、半纤维素的材料为基质进行草菇栽培。草菇降解木质...
- 贵甫
- 关键词:草菇异核体
- 草菇gpi基因结构及其异核体表达协同增效作用被引量:16
- 2011年
- 以草菇(Volvariella volvacea)单孢菌株PYd21(基因组测序菌株)和PYd15(基因组重测序菌株)为材料,配对获得可正常出菇的异核菌株H15-21。克隆测序了PYd21和PYd15的葡萄糖-6-磷酸异构酶基因(gpi),并对基因的结构和表达谱的表达量进行分析。结果表明,PYd21和PYd15的gpi基因序列相同;转录组reads定位、paired-end分析结果显示,gpi基因全长2404bp,ORF全长1659bp,编码552个氨基酸,含有8个外显子、7个内含子,5'UTR长度为101bp、3'UTR为183bp,RNA加工过程中有2种可变剪切类型、3个可变剪接位点;表达谱测序结果,PYd21、H15-21和PYd15 gpi基因的表达量分别为84.53、1079.31和270.95TPM,草菇gpi基因表达表现出异核体表达协同增效作用,暗示着异核菌株中的2种不同来源的细胞核可能存在相互作用,这一结果在实时荧光定量PCR检测后得到证实。
- 刘朋虎谢宝贵邓优锦陈炳智贵甫朱坚江玉姬刘新锐
- 关键词:葡萄糖-6-磷酸异构酶基因结构协同增效作用
- 草菇子实体菌柄发育的表达谱分析
- 运用高通量的数字化基因表达谱测序技术,分析了草菇纽扣期(Nb)、蛋形期(Db)、伸长期(Sb)和成熟期(Cb)菌柄的基因表达谱.Nb、Db、Sb、Cb四个发育阶段菌柄基因表达标签(Clean tag)总数分别是56123...
- 王海英陈炳智邓优锦江玉姬贵甫谢宝贵
- 关键词:草菇菌柄表达谱